MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_016912	AAT	2	6	2148136	2148141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015320
51502	NC_016912	TGC	2	6	2148186	2148191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015320
51503	NC_016912	AAT	2	6	2148325	2148330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015320
51504	NC_016912	TGT	2	6	2148395	2148400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015320
51505	NC_016912	TCT	2	6	2148436	2148441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015320
51506	NC_016912	CTTT	2	8	2148476	2148483	0 %	75 %	0 %	25 %	379015320
51507	NC_016912	CAT	2	6	2148503	2148508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015320
51508	NC_016912	CAT	2	6	2148512	2148517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015320
51509	NC_016912	AGTAA	2	10	2148518	2148527	60 %	20 %	20 %	0 %	379015320
51510	NC_016912	CTA	2	6	2148578	2148583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015320
51511	NC_016912	T	6	6	2148626	2148631	0 %	100 %	0 %	0 %	379015320
51512	NC_016912	TAA	2	6	2148642	2148647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015320
51513	NC_016912	TAA	2	6	2148699	2148704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015320
51514	NC_016912	TTC	2	6	2148729	2148734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015320
51515	NC_016912	TTC	2	6	2148777	2148782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015320
51516	NC_016912	CAT	2	6	2148798	2148803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015320
51517	NC_016912	CAC	2	6	2148815	2148820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015320
51518	NC_016912	GTT	2	6	2148855	2148860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015320
51519	NC_016912	T	6	6	2148884	2148889	0 %	100 %	0 %	0 %	379015320
51520	NC_016912	T	6	6	2148905	2148910	0 %	100 %	0 %	0 %	379015320
51521	NC_016912	TTGA	2	8	2148930	2148937	25 %	50 %	25 %	0 %	379015321
51522	NC_016912	ATC	2	6	2148942	2148947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015321
51523	NC_016912	ATT	2	6	2148951	2148956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015321
51524	NC_016912	CTT	2	6	2148980	2148985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015321
51525	NC_016912	T	7	7	2149014	2149020	0 %	100 %	0 %	0 %	379015321
51526	NC_016912	AACC	2	8	2149088	2149095	50 %	0 %	0 %	50 %	379015321
51527	NC_016912	AAT	2	6	2149182	2149187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015321
51528	NC_016912	TCA	2	6	2149246	2149251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015321
51529	NC_016912	ATA	2	6	2149404	2149409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015321
51530	NC_016912	TAA	2	6	2149467	2149472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015321
51531	NC_016912	TAA	2	6	2149487	2149492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015321
51532	NC_016912	TGTT	2	8	2149542	2149549	0 %	75 %	25 %	0 %	379015321
51533	NC_016912	ATGC	2	8	2149604	2149611	25 %	25 %	25 %	25 %	379015321
51534	NC_016912	T	6	6	2149632	2149637	0 %	100 %	0 %	0 %	379015321
51535	NC_016912	ACC	2	6	2149731	2149736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015321
51536	NC_016912	TACT	2	8	2149745	2149752	25 %	50 %	0 %	25 %	379015321
51537	NC_016912	CAT	2	6	2149769	2149774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015321
51538	NC_016912	GGAT	2	8	2149812	2149819	25 %	25 %	50 %	0 %	379015321
51539	NC_016912	GTTAAA	2	12	2149825	2149836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379015321
51540	NC_016912	GTC	2	6	2149846	2149851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51541	NC_016912	TCA	2	6	2149894	2149899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015322
51542	NC_016912	T	6	6	2149962	2149967	0 %	100 %	0 %	0 %	379015322
51543	NC_016912	TAA	2	6	2149997	2150002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015322
51544	NC_016912	ATA	2	6	2150011	2150016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015322
51545	NC_016912	TAA	2	6	2150025	2150030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015322
51546	NC_016912	TTC	2	6	2150076	2150081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015322
51547	NC_016912	GAAC	2	8	2150122	2150129	50 %	0 %	25 %	25 %	379015322
51548	NC_016912	TTTA	2	8	2150139	2150146	25 %	75 %	0 %	0 %	379015322
51549	NC_016912	AAC	2	6	2150208	2150213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015322
51550	NC_016912	T	6	6	2150226	2150231	0 %	100 %	0 %	0 %	379015322
51551	NC_016912	TCC	2	6	2150379	2150384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51552	NC_016912	TTA	2	6	2150395	2150400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015323
51553	NC_016912	ACC	2	6	2150427	2150432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015323
51554	NC_016912	CAA	2	6	2150447	2150452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015323
51555	NC_016912	CAA	2	6	2150486	2150491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015323
51556	NC_016912	AT	3	6	2150539	2150544	50 %	50 %	0 %	0 %	379015323
51557	NC_016912	CAG	2	6	2150567	2150572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015323
51558	NC_016912	CTT	2	6	2150648	2150653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015323
51559	NC_016912	CAA	2	6	2150690	2150695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015323
51560	NC_016912	CAA	2	6	2150723	2150728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015323
51561	NC_016912	CAT	2	6	2150729	2150734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015323
51562	NC_016912	TAA	2	6	2150745	2150750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015323
51563	NC_016912	TGA	2	6	2150759	2150764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015323
51564	NC_016912	CTT	2	6	2150765	2150770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015323
51565	NC_016912	AAT	3	9	2150799	2150807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015323
51566	NC_016912	ATA	2	6	2150812	2150817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015323
51567	NC_016912	ATTT	2	8	2150867	2150874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51568	NC_016912	TAAACA	2	12	2150928	2150939	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51569	NC_016912	ATA	2	6	2150954	2150959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51570	NC_016912	TGTT	2	8	2150971	2150978	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51571	NC_016912	GTT	2	6	2151022	2151027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51572	NC_016912	GTA	2	6	2151052	2151057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51573	NC_016912	A	6	6	2151095	2151100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51574	NC_016912	ATTCAC	2	12	2151121	2151132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51575	NC_016912	ACT	2	6	2151188	2151193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015324
51576	NC_016912	AT	3	6	2151197	2151202	50 %	50 %	0 %	0 %	379015324
51577	NC_016912	TCTTCA	2	12	2151224	2151235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379015324
51578	NC_016912	ATG	2	6	2151276	2151281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015324
51579	NC_016912	TCT	2	6	2151287	2151292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015324
51580	NC_016912	GTT	2	6	2151351	2151356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015324
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51582	NC_016912	TTTA	2	8	2151397	2151404	25 %	75 %	0 %	0 %	379015324
51583	NC_016912	TAC	2	6	2151411	2151416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015324
51584	NC_016912	CAC	2	6	2151501	2151506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015324
51585	NC_016912	TGTT	2	8	2151532	2151539	0 %	75 %	25 %	0 %	379015324
51586	NC_016912	TAA	2	6	2151576	2151581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015324
51587	NC_016912	ATG	2	6	2151592	2151597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015324
51588	NC_016912	CTT	2	6	2151603	2151608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015324
51589	NC_016912	TGT	2	6	2151625	2151630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015324
51590	NC_016912	ATG	2	6	2151669	2151674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015324
51591	NC_016912	T	6	6	2151679	2151684	0 %	100 %	0 %	0 %	379015324
51592	NC_016912	CAC	2	6	2151771	2151776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015324
51593	NC_016912	CAATT	2	10	2151808	2151817	40 %	40 %	0 %	20 %	379015324
51594	NC_016912	CGA	2	6	2151858	2151863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015324
51595	NC_016912	CCT	2	6	2151947	2151952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51596	NC_016912	TAA	2	6	2152019	2152024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51597	NC_016912	TAA	2	6	2152133	2152138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51598	NC_016912	TCAT	2	8	2152158	2152165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51599	NC_016912	T	6	6	2152244	2152249	0 %	100 %	0 %	0 %	379015325
51600	NC_016912	TGA	2	6	2152312	2152317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015325
51601	NC_016912	ATT	2	6	2152362	2152367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015325
51602	NC_016912	AGA	2	6	2152369	2152374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015325
51603	NC_016912	GATTG	2	10	2152448	2152457	20 %	40 %	40 %	0 %	379015325
51604	NC_016912	CAA	2	6	2152475	2152480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015325
51605	NC_016912	TCA	2	6	2152491	2152496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015325
51606	NC_016912	TGA	2	6	2152543	2152548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015325
51607	NC_016912	ATGT	2	8	2152581	2152588	25 %	50 %	25 %	0 %	379015325
51608	NC_016912	TGG	2	6	2152648	2152653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015325
51609	NC_016912	TAT	2	6	2152674	2152679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015325
51610	NC_016912	CAT	2	6	2152705	2152710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015325
51611	NC_016912	TAAA	2	8	2152719	2152726	75 %	25 %	0 %	0 %	379015325
51612	NC_016912	TTG	2	6	2152746	2152751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015325
51613	NC_016912	TCA	2	6	2152760	2152765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015325
51614	NC_016912	ATT	2	6	2152820	2152825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015325
51615	NC_016912	GAC	2	6	2152877	2152882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015325
51616	NC_016912	ATT	2	6	2153051	2153056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51980	NC_016912	CTA	2	6	2167203	2167208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015337
51981	NC_016912	TCA	2	6	2167265	2167270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015337
51982	NC_016912	CAT	2	6	2167276	2167281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015337
51983	NC_016912	T	7	7	2167315	2167321	0 %	100 %	0 %	0 %	379015337
51984	NC_016912	CGGT	2	8	2167380	2167387	0 %	25 %	50 %	25 %	379015337
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51986	NC_016912	TA	3	6	2167413	2167418	50 %	50 %	0 %	0 %	379015337
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51999	NC_016912	CAT	2	6	2167902	2167907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015338
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