MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS678 chromosome

Total Repeats: 93072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016901	TCG	2	6	255491	255496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706579
4502	NC_016901	TC	3	6	255524	255529	0 %	50 %	0 %	50 %	378706579
4503	NC_016901	GCT	2	6	255631	255636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706579
4504	NC_016901	CCA	2	6	255655	255660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378706579
4505	NC_016901	GAC	2	6	255691	255696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706579
4506	NC_016901	AGT	2	6	255699	255704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706579
4507	NC_016901	AAG	3	9	255721	255729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706579
4508	NC_016901	AAG	2	6	255788	255793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706580
4509	NC_016901	GCT	2	6	255887	255892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706580
4510	NC_016901	TTG	2	6	255969	255974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706580
4511	NC_016901	GC	3	6	255979	255984	0 %	0 %	50 %	50 %	378706580
4512	NC_016901	GCT	2	6	256049	256054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706580
4513	NC_016901	ATTG	2	8	256149	256156	25 %	50 %	25 %	0 %	378706581
4514	NC_016901	AGT	2	6	256176	256181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706581
4515	NC_016901	AGT	2	6	256218	256223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706581
4516	NC_016901	ACGGTA	2	12	256229	256240	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378706581
4517	NC_016901	TGGCTA	2	12	256245	256256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378706581
4518	NC_016901	CAG	2	6	256277	256282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706581
4519	NC_016901	TCG	2	6	256308	256313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706581
4520	NC_016901	GTTGA	2	10	256327	256336	20 %	40 %	40 %	0 %	378706581
4521	NC_016901	GTC	2	6	256367	256372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706581
4522	NC_016901	TAT	2	6	256419	256424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706581
4523	NC_016901	CTA	2	6	256496	256501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706581
4524	NC_016901	CG	3	6	256519	256524	0 %	0 %	50 %	50 %	378706581
4525	NC_016901	AGA	2	6	256731	256736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706582
4526	NC_016901	CAA	2	6	256761	256766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706582
4527	NC_016901	CTA	2	6	256770	256775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706582
4528	NC_016901	GGA	2	6	256788	256793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378706582
4529	NC_016901	TGG	2	6	256926	256931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706583
4530	NC_016901	GGT	2	6	256954	256959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706583
4531	NC_016901	TCGCG	2	10	257002	257011	0 %	20 %	40 %	40 %	378706583
4532	NC_016901	CGG	2	6	257214	257219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378706583
4533	NC_016901	AAT	2	6	257231	257236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378706583
4534	NC_016901	CCT	2	6	257305	257310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378706584
4535	NC_016901	ATT	2	6	257507	257512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706584
4536	NC_016901	A	6	6	257555	257560	100 %	0 %	0 %	0 %	378706584
4537	NC_016901	GTCG	2	8	257632	257639	0 %	25 %	50 %	25 %	378706584
4538	NC_016901	TTG	2	6	257706	257711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706584
4539	NC_016901	GATTTT	2	12	257797	257808	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378706584
4540	NC_016901	TTG	2	6	257817	257822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706584
4541	NC_016901	TTG	3	9	257891	257899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706584
4542	NC_016901	CGT	2	6	257957	257962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706584
4543	NC_016901	TCG	2	6	257964	257969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706584
4544	NC_016901	CAG	2	6	257987	257992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706584
4545	NC_016901	CAT	2	6	258079	258084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706584
4546	NC_016901	ATT	2	6	258187	258192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378706584
4547	NC_016901	TCT	2	6	258222	258227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706584
4548	NC_016901	CAG	2	6	258258	258263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706584
4549	NC_016901	GAA	2	6	258271	258276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706584
4550	NC_016901	GTG	2	6	258279	258284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706584
4551	NC_016901	ACT	2	6	258448	258453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706584
4552	NC_016901	ATG	2	6	258503	258508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706584
4553	NC_016901	TCA	2	6	258511	258516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706584
4554	NC_016901	TGA	2	6	258528	258533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706584
4555	NC_016901	TGA	2	6	258598	258603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_016901	GAA	2	6	258625	258630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706585
4557	NC_016901	CTTTAA	2	12	258814	258825	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4558	NC_016901	TAC	2	6	258999	259004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706586
4559	NC_016901	GAA	2	6	259007	259012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706586
4560	NC_016901	CGT	2	6	259043	259048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706586
4561	NC_016901	GTT	2	6	259086	259091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706586
4562	NC_016901	GCCT	2	8	259116	259123	0 %	25 %	25 %	50 %	378706586
4563	NC_016901	CGTA	2	8	259243	259250	25 %	25 %	25 %	25 %	378706587
4564	NC_016901	ATGGC	2	10	259263	259272	20 %	20 %	40 %	20 %	378706587
4565	NC_016901	CTT	2	6	259284	259289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706587
4566	NC_016901	CAA	2	6	259291	259296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706587
4567	NC_016901	GGT	2	6	259352	259357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706587
4568	NC_016901	TGC	2	6	259393	259398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706587
4569	NC_016901	GCT	2	6	259406	259411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706587
4570	NC_016901	TGC	3	9	259423	259431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706587
4571	NC_016901	A	6	6	259447	259452	100 %	0 %	0 %	0 %	378706587
4572	NC_016901	GTCCAG	2	12	259473	259484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378706587
4573	NC_016901	GTC	2	6	259572	259577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706587
4574	NC_016901	CGT	2	6	259589	259594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706587
4575	NC_016901	CAAGCT	2	12	259653	259664	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378706588
4576	NC_016901	GCC	2	6	259667	259672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706588
4577	NC_016901	ACA	2	6	259749	259754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378706588
4578	NC_016901	TCG	2	6	259815	259820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706588
4579	NC_016901	GT	3	6	259829	259834	0 %	50 %	50 %	0 %	378706588
4580	NC_016901	TGC	2	6	259866	259871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706588
4581	NC_016901	CGT	2	6	259932	259937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706588
4582	NC_016901	GTT	2	6	260017	260022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706588
4583	NC_016901	CAT	2	6	260030	260035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706588
4584	NC_016901	ATG	2	6	260051	260056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706588
4585	NC_016901	TCG	2	6	260231	260236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706588
4586	NC_016901	TAAG	2	8	260247	260254	50 %	25 %	25 %	0 %	378706588
4587	NC_016901	AACA	2	8	260258	260265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_016901	AG	3	6	260266	260271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_016901	GTC	2	6	260421	260426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4590	NC_016901	CAG	2	6	260481	260486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4591	NC_016901	AAGG	2	8	260488	260495	50 %	0 %	50 %	0 %	378706589
4592	NC_016901	AAG	2	6	260501	260506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706589
4593	NC_016901	GCA	2	6	260611	260616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4594	NC_016901	ATG	2	6	260627	260632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706589
4595	NC_016901	GAT	2	6	260764	260769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706589
4596	NC_016901	CTT	2	6	260798	260803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706589
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4598	NC_016901	CGT	2	6	260926	260931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4599	NC_016901	TTG	2	6	260966	260971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378706589
4600	NC_016901	ACGTG	2	10	260976	260985	20 %	20 %	40 %	20 %	378706589
4601	NC_016901	AGA	2	6	261003	261008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378706589
4602	NC_016901	CTG	2	6	261031	261036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4603	NC_016901	CGA	2	6	261045	261050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4604	NC_016901	AGTTG	2	10	261132	261141	20 %	40 %	40 %	0 %	378706589
4605	NC_016901	CCAG	2	8	261241	261248	25 %	0 %	25 %	50 %	378706589
4606	NC_016901	GAC	2	6	261256	261261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706589
4607	NC_016901	GTC	2	6	261327	261332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706590
4608	NC_016901	CAG	2	6	261346	261351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378706590
4609	NC_016901	ATC	2	6	261404	261409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706590
4610	NC_016901	CGT	2	6	261494	261499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706590
4611	NC_016901	TGG	2	6	261580	261585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378706590
4612	NC_016901	GCT	2	6	261668	261673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706590
4613	NC_016901	TGTTGA	2	12	261679	261690	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	378706590
4614	NC_016901	GCT	2	6	261692	261697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706590
4615	NC_016901	T	6	6	261743	261748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_016901	T	7	7	261754	261760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_016901	TTTC	2	8	261792	261799	0 %	75 %	0 %	25 %	378706591
4618	NC_016901	ATC	2	6	261856	261861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706591
4619	NC_016901	GCCA	2	8	261892	261899	25 %	0 %	25 %	50 %	378706591
4620	NC_016901	GCT	2	6	261920	261925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706591
4621	NC_016901	ATG	2	6	261934	261939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378706591
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4623	NC_016901	TGC	2	6	262145	262150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706591
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4640	NC_016901	TCA	2	6	262893	262898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4997	NC_016901	GCT	2	6	283182	283187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378706611
4998	NC_016901	CGC	2	6	283196	283201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378706611
4999	NC_016901	CTT	2	6	283253	283258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378706611
5000	NC_016901	CTA	2	6	283373	283378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378706611

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