MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016863	GCAG	2	8	679758	679765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14502	NC_016863	GAT	2	6	679833	679838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_016863	GCC	2	6	679908	679913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988014
14504	NC_016863	CGC	2	6	679959	679964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988014
14505	NC_016863	CTG	2	6	679996	680001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988014
14506	NC_016863	GAC	2	6	680088	680093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988014
14507	NC_016863	GC	3	6	680126	680131	0 %	0 %	50 %	50 %	378988014
14508	NC_016863	AGA	2	6	680191	680196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378988014
14509	NC_016863	ATA	2	6	680230	680235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378988014
14510	NC_016863	AGT	2	6	680277	680282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_016863	GGC	2	6	680320	680325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14512	NC_016863	ATG	2	6	680341	680346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_016863	ATA	2	6	680503	680508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378988015
14514	NC_016863	TGCGGC	2	12	680533	680544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378988015
14515	NC_016863	ATC	2	6	680575	680580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378988015
14516	NC_016863	CGA	2	6	680678	680683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988015
14517	NC_016863	C	7	7	680859	680865	0 %	0 %	0 %	100 %	378988015
14518	NC_016863	GCG	2	6	681022	681027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988015
14519	NC_016863	TGGC	2	8	681083	681090	0 %	25 %	50 %	25 %	378988015
14520	NC_016863	GGC	2	6	681125	681130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988015
14521	NC_016863	TCG	2	6	681217	681222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988015
14522	NC_016863	GGC	2	6	681228	681233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988015
14523	NC_016863	CAGC	2	8	681254	681261	25 %	0 %	25 %	50 %	378988015
14524	NC_016863	ATG	2	6	681289	681294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988015
14525	NC_016863	A	6	6	681340	681345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_016863	CAT	2	6	681370	681375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_016863	CCA	2	6	681429	681434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988016
14528	NC_016863	GCC	2	6	681477	681482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988016
14529	NC_016863	AGT	2	6	681483	681488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988016
14530	NC_016863	CAG	2	6	681580	681585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988016
14531	NC_016863	GTT	2	6	681594	681599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378988016
14532	NC_016863	GCA	2	6	681645	681650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988016
14533	NC_016863	ACCAGT	2	12	681704	681715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378988016
14534	NC_016863	GA	3	6	681735	681740	50 %	0 %	50 %	0 %	378988016
14535	NC_016863	ACC	2	6	681815	681820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988016
14536	NC_016863	TGT	2	6	681855	681860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378988016
14537	NC_016863	CAG	2	6	681916	681921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988016
14538	NC_016863	TGA	2	6	681939	681944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988016
14539	NC_016863	CCA	2	6	681950	681955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988016
14540	NC_016863	CTAAG	2	10	681969	681978	40 %	20 %	20 %	20 %	378988016
14541	NC_016863	T	6	6	682028	682033	0 %	100 %	0 %	0 %	378988016
14542	NC_016863	CGC	2	6	682038	682043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988016
14543	NC_016863	AAT	2	6	682126	682131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378988016
14544	NC_016863	CAGC	2	8	682162	682169	25 %	0 %	25 %	50 %	378988016
14545	NC_016863	CAT	2	6	682270	682275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378988016
14546	NC_016863	CCG	2	6	682289	682294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988016
14547	NC_016863	GCG	2	6	682297	682302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988016
14548	NC_016863	GCG	2	6	682335	682340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988016
14549	NC_016863	TGA	2	6	682350	682355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378988016
14550	NC_016863	CCG	2	6	682370	682375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988016
14551	NC_016863	GGAG	2	8	682390	682397	25 %	0 %	75 %	0 %	378988016
14552	NC_016863	GCGT	2	8	682449	682456	0 %	25 %	50 %	25 %	378988016
14553	NC_016863	GCG	2	6	682489	682494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988016
14554	NC_016863	CCAG	2	8	682545	682552	25 %	0 %	25 %	50 %	378988016
14555	NC_016863	GTG	2	6	682556	682561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378988016
14556	NC_016863	TGC	2	6	682653	682658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988016
14557	NC_016863	ATC	2	6	682730	682735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378988016
14558	NC_016863	CGA	2	6	682737	682742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988016
14559	NC_016863	GCG	2	6	682767	682772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988016
14560	NC_016863	AAC	2	6	682796	682801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378988016
14561	NC_016863	CAC	2	6	682813	682818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988016
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14563	NC_016863	AT	3	6	682839	682844	50 %	50 %	0 %	0 %	378988016
14564	NC_016863	CAG	2	6	682946	682951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988017
14565	NC_016863	GCC	2	6	683039	683044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378988017
14566	NC_016863	CTG	2	6	683045	683050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988017
14567	NC_016863	TAA	2	6	683051	683056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378988017
14568	NC_016863	CTG	3	9	683066	683074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988017
14569	NC_016863	CCGCC	2	10	683092	683101	0 %	0 %	20 %	80 %	378988017
14570	NC_016863	GCGAC	2	10	683104	683113	20 %	0 %	40 %	40 %	378988017
14571	NC_016863	CAG	3	9	683138	683146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988017
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14573	NC_016863	CGCTTC	2	12	683240	683251	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378988017
14574	NC_016863	CG	4	8	683254	683261	0 %	0 %	50 %	50 %	378988017
14575	NC_016863	GTT	2	6	683312	683317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378988017
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14577	NC_016863	CGG	3	9	683356	683364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988017
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14580	NC_016863	GGC	2	6	683420	683425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988017
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14582	NC_016863	CGCC	2	8	683470	683477	0 %	0 %	25 %	75 %	378988017
14583	NC_016863	GCT	2	6	683493	683498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988017
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14586	NC_016863	GC	3	6	683712	683717	0 %	0 %	50 %	50 %	378988017
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14588	NC_016863	GCA	2	6	683798	683803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988018
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14590	NC_016863	CG	3	6	683851	683856	0 %	0 %	50 %	50 %	378988018
14591	NC_016863	CAG	2	6	683880	683885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988018
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14593	NC_016863	GGC	2	6	683912	683917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988018
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14596	NC_016863	CGG	2	6	684145	684150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988018
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14598	NC_016863	AGTGG	2	10	684202	684211	20 %	20 %	60 %	0 %	378988018
14599	NC_016863	GC	3	6	684229	684234	0 %	0 %	50 %	50 %	378988018
14600	NC_016863	CTTG	2	8	684238	684245	0 %	50 %	25 %	25 %	378988018
14601	NC_016863	TC	3	6	684246	684251	0 %	50 %	0 %	50 %	378988018
14602	NC_016863	AGC	2	6	684265	684270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378988018
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14604	NC_016863	CAC	2	6	684342	684347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378988019
14605	NC_016863	CGGT	2	8	684391	684398	0 %	25 %	50 %	25 %	378988019
14606	NC_016863	GC	3	6	684434	684439	0 %	0 %	50 %	50 %	378988019
14607	NC_016863	GCT	2	6	684478	684483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378988019
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14609	NC_016863	GGT	2	6	684576	684581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378988019
14610	NC_016863	GCG	2	6	684620	684625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378988019
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