MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016863	CCA	2	6	613232	613237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987953
13003	NC_016863	CTC	2	6	613242	613247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_016863	ATG	2	6	613257	613262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_016863	AT	3	6	613268	613273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016863	CAT	2	6	613307	613312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_016863	A	7	7	613325	613331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016863	ATT	2	6	613354	613359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_016863	TACT	2	8	613401	613408	25 %	50 %	0 %	25 %	378987954
13010	NC_016863	AT	3	6	613434	613439	50 %	50 %	0 %	0 %	378987954
13011	NC_016863	CTG	2	6	613448	613453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987954
13012	NC_016863	CGG	2	6	613488	613493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987954
13013	NC_016863	GAAAGT	2	12	613515	613526	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378987954
13014	NC_016863	AGT	2	6	613612	613617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987954
13015	NC_016863	CAT	2	6	613696	613701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987954
13016	NC_016863	GCA	2	6	613720	613725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987954
13017	NC_016863	TTA	2	6	613767	613772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987954
13018	NC_016863	AAT	2	6	613775	613780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987954
13019	NC_016863	CAGC	2	8	613821	613828	25 %	0 %	25 %	50 %	378987954
13020	NC_016863	ATC	3	9	613838	613846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987954
13021	NC_016863	TATC	2	8	613873	613880	25 %	50 %	0 %	25 %	378987954
13022	NC_016863	TCT	2	6	613881	613886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987954
13023	NC_016863	GGC	2	6	613887	613892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987954
13024	NC_016863	CTG	2	6	613907	613912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987954
13025	NC_016863	ATG	2	6	613935	613940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987954
13026	NC_016863	GCA	2	6	613990	613995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987954
13027	NC_016863	A	7	7	613997	614003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016863	TGAT	2	8	614047	614054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016863	GGC	2	6	614067	614072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_016863	CTTCA	2	10	614238	614247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13031	NC_016863	GC	3	6	614321	614326	0 %	0 %	50 %	50 %	378987955
13032	NC_016863	CTT	2	6	614350	614355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987955
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13034	NC_016863	CAT	2	6	614394	614399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987955
13035	NC_016863	GTC	2	6	614410	614415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987955
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13038	NC_016863	GCTC	2	8	614542	614549	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13039	NC_016863	TC	3	6	614616	614621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_016863	ACG	2	6	614705	614710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_016863	TCAT	2	8	614819	614826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13042	NC_016863	T	7	7	614858	614864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_016863	CGG	2	6	614909	614914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987956
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13047	NC_016863	GTA	2	6	615004	615009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987956
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13050	NC_016863	TGG	2	6	615265	615270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_016863	T	6	6	615366	615371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_016863	CTT	2	6	615393	615398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_016863	CGC	2	6	615448	615453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_016863	TGG	2	6	615465	615470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_016863	ATTA	2	8	615479	615486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_016863	ATT	2	6	615504	615509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987957
13057	NC_016863	CGCC	2	8	615602	615609	0 %	0 %	25 %	75 %	378987957
13058	NC_016863	TCT	2	6	615640	615645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987957
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13063	NC_016863	TA	3	6	615800	615805	50 %	50 %	0 %	0 %	378987957
13064	NC_016863	GTT	2	6	615809	615814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987957
13065	NC_016863	GTA	2	6	615905	615910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987957
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13088	NC_016863	AT	3	6	616691	616696	50 %	50 %	0 %	0 %	378987957
13089	NC_016863	TA	3	6	616706	616711	50 %	50 %	0 %	0 %	378987957
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13099	NC_016863	AT	3	6	617200	617205	50 %	50 %	0 %	0 %	378987958
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13104	NC_016863	AAG	2	6	617396	617401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987958
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13109	NC_016863	TGA	2	6	617939	617944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987958
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13118	NC_016863	AAT	2	6	618487	618492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_016863	TTA	2	6	618525	618530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_016863	GTT	2	6	618538	618543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_016863	AGT	2	6	618572	618577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13123	NC_016863	GTA	2	6	618661	618666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13125	NC_016863	GC	3	6	618742	618747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13126	NC_016863	GCG	3	9	618787	618795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_016863	CTC	2	6	618865	618870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_016863	ATT	2	6	618901	618906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_016863	GTC	2	6	618940	618945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13247	NC_016863	GC	3	6	624738	624743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13248	NC_016863	CTTTT	2	10	624747	624756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13359	NC_016863	CGTT	2	8	629881	629888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13360	NC_016863	AGTA	2	8	629932	629939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_016863	CGT	2	6	629968	629973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13367	NC_016863	GCC	2	6	630204	630209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987970
13368	NC_016863	CGT	2	6	630239	630244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987970
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13485	NC_016863	GGT	2	6	635315	635320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987973
13486	NC_016863	CCCG	2	8	635322	635329	0 %	0 %	25 %	75 %	378987973
13487	NC_016863	TGC	2	6	635410	635415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987973
13488	NC_016863	CTG	2	6	635417	635422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987973
13489	NC_016863	CGG	2	6	635443	635448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987973
13490	NC_016863	AGA	2	6	635470	635475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987973
13491	NC_016863	TCC	3	9	635565	635573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987973
13492	NC_016863	GCG	2	6	635611	635616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987973
13493	NC_016863	GC	3	6	635649	635654	0 %	0 %	50 %	50 %	378987973
13494	NC_016863	CGG	2	6	635662	635667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987973
13495	NC_016863	TGC	2	6	635721	635726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987973
13496	NC_016863	CGT	2	6	635830	635835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987973
13497	NC_016863	TCACT	2	10	635851	635860	20 %	40 %	0 %	40 %	378987973
13498	NC_016863	CCT	2	6	635871	635876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987974
13499	NC_016863	CAC	2	6	635917	635922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987974
13500	NC_016863	GCGATG	2	12	635933	635944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378987974

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