MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_016863	ATC	2	6	519851	519856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987864
11003	NC_016863	CAG	2	6	519875	519880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11004	NC_016863	CAG	2	6	519887	519892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11005	NC_016863	GC	3	6	519893	519898	0 %	0 %	50 %	50 %	378987864
11006	NC_016863	GCT	2	6	519985	519990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11007	NC_016863	TTG	2	6	520022	520027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987864
11008	NC_016863	ACC	2	6	520127	520132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987864
11009	NC_016863	CAG	2	6	520148	520153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11010	NC_016863	CGA	2	6	520216	520221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11011	NC_016863	ATTGAT	2	12	520244	520255	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	378987864
11012	NC_016863	CGA	2	6	520276	520281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11013	NC_016863	TGG	2	6	520338	520343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987864
11014	NC_016863	TTA	2	6	520379	520384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987864
11015	NC_016863	CT	3	6	520441	520446	0 %	50 %	0 %	50 %	378987864
11016	NC_016863	ATC	2	6	520449	520454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987864
11017	NC_016863	GC	3	6	520598	520603	0 %	0 %	50 %	50 %	378987864
11018	NC_016863	TGGCGC	2	12	520677	520688	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378987864
11019	NC_016863	TGA	2	6	520723	520728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987864
11020	NC_016863	CAG	2	6	520769	520774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987864
11021	NC_016863	GGC	2	6	520780	520785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987864
11022	NC_016863	CAC	2	6	520798	520803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987864
11023	NC_016863	TGG	2	6	520806	520811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987864
11024	NC_016863	CAA	2	6	520898	520903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987864
11025	NC_016863	GGC	2	6	520909	520914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987864
11026	NC_016863	AGTT	2	8	520947	520954	25 %	50 %	25 %	0 %	378987864
11027	NC_016863	GAG	2	6	520958	520963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987864
11028	NC_016863	GCC	2	6	520967	520972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987864
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11030	NC_016863	GCG	2	6	520997	521002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987864
11031	NC_016863	CAT	2	6	521035	521040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_016863	CGT	2	6	521045	521050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_016863	TTTC	2	8	521059	521066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_016863	CGC	2	6	521103	521108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11035	NC_016863	CTCG	2	8	521123	521130	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11036	NC_016863	AGA	2	6	521165	521170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_016863	GCG	2	6	521179	521184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_016863	GGA	2	6	521256	521261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378987865
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11040	NC_016863	CGCGG	2	10	521356	521365	0 %	0 %	60 %	40 %	378987865
11041	NC_016863	CGA	2	6	521415	521420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987865
11042	NC_016863	ATC	2	6	521443	521448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987865
11043	NC_016863	TCG	2	6	521492	521497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987865
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11046	NC_016863	A	6	6	521583	521588	100 %	0 %	0 %	0 %	378987866
11047	NC_016863	GAT	2	6	521599	521604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987866
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11052	NC_016863	GTG	2	6	521831	521836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987866
11053	NC_016863	T	6	6	521872	521877	0 %	100 %	0 %	0 %	378987866
11054	NC_016863	GAA	2	6	521902	521907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987866
11055	NC_016863	CGG	2	6	521919	521924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987866
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11057	NC_016863	CGG	2	6	522030	522035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987866
11058	NC_016863	GTG	2	6	522050	522055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987866
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11060	NC_016863	GCG	2	6	522099	522104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987866
11061	NC_016863	CTG	2	6	522107	522112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987866
11062	NC_016863	GCT	2	6	522113	522118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987866
11063	NC_016863	GC	3	6	522123	522128	0 %	0 %	50 %	50 %	378987866
11064	NC_016863	TGG	2	6	522139	522144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987866
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11069	NC_016863	AGC	2	6	522331	522336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987866
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11072	NC_016863	CTG	2	6	522425	522430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987866
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11081	NC_016863	GCGCT	2	10	522894	522903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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11085	NC_016863	GC	3	6	523021	523026	0 %	0 %	50 %	50 %	378987867
11086	NC_016863	CGC	2	6	523045	523050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987867
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11088	NC_016863	GGAA	2	8	523209	523216	50 %	0 %	50 %	0 %	378987867
11089	NC_016863	GCG	2	6	523311	523316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987867
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11091	NC_016863	CGG	2	6	523397	523402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987867
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11093	NC_016863	CGG	2	6	523563	523568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987867
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11099	NC_016863	T	6	6	523786	523791	0 %	100 %	0 %	0 %	378987867
11100	NC_016863	AAT	2	6	523800	523805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987867
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11102	NC_016863	CATA	2	8	523832	523839	50 %	25 %	0 %	25 %	378987867
11103	NC_016863	CGG	2	6	524002	524007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_016863	G	6	6	524006	524011	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_016863	CTG	2	6	524018	524023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_016863	TGA	2	6	524030	524035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_016863	TGAA	2	8	524046	524053	50 %	25 %	25 %	0 %	378987868
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11110	NC_016863	GCC	2	6	524231	524236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987868
11111	NC_016863	GCTG	2	8	524273	524280	0 %	25 %	50 %	25 %	378987868
11112	NC_016863	GTAC	2	8	524313	524320	25 %	25 %	25 %	25 %	378987868
11113	NC_016863	CG	3	6	524384	524389	0 %	0 %	50 %	50 %	378987868
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11116	NC_016863	TATT	2	8	524431	524438	25 %	75 %	0 %	0 %	378987868
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11121	NC_016863	CGA	3	9	524542	524550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987868
11122	NC_016863	TCT	2	6	524586	524591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987868
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11126	NC_016863	CCG	2	6	524832	524837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987869
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11128	NC_016863	CGA	2	6	524917	524922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987869
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11131	NC_016863	CAGGT	2	10	525157	525166	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11132	NC_016863	GGAA	2	8	525169	525176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_016863	CCCA	2	8	525224	525231	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11134	NC_016863	CTG	2	6	525258	525263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11227	NC_016863	A	6	6	529901	529906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11240	NC_016863	CAGC	2	8	530345	530352	25 %	0 %	25 %	50 %	378987877
11241	NC_016863	GC	3	6	530354	530359	0 %	0 %	50 %	50 %	378987877
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11486	NC_016863	T	6	6	541725	541730	0 %	100 %	0 %	0 %	378987886
11487	NC_016863	CG	3	6	541737	541742	0 %	0 %	50 %	50 %	378987886
11488	NC_016863	GCT	2	6	541768	541773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987886
11489	NC_016863	GCG	2	6	541818	541823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987886
11490	NC_016863	CGC	2	6	541882	541887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987886
11491	NC_016863	CTG	2	6	541919	541924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987886
11492	NC_016863	GC	3	6	541946	541951	0 %	0 %	50 %	50 %	378987886
11493	NC_016863	GAA	2	6	542030	542035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987886
11494	NC_016863	ACC	2	6	542066	542071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987886
11495	NC_016863	CG	3	6	542201	542206	0 %	0 %	50 %	50 %	378987886
11496	NC_016863	GTT	2	6	542212	542217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378987886
11497	NC_016863	CTGA	2	8	542258	542265	25 %	25 %	25 %	25 %	378987886
11498	NC_016863	GCG	2	6	542280	542285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987886
11499	NC_016863	GAC	3	9	542333	542341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987886
11500	NC_016863	GGT	2	6	542365	542370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987886

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