MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. UK-1 chromosome

Total Repeats: 101821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016863	ATATA	2	10	230555	230564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016863	CTA	2	6	230568	230573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_016863	TG	3	6	230603	230608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016863	TAA	2	6	230636	230641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_016863	CAG	2	6	230658	230663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987600
5006	NC_016863	TGC	2	6	230677	230682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987600
5007	NC_016863	TGC	2	6	230716	230721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987600
5008	NC_016863	CGA	2	6	230791	230796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987600
5009	NC_016863	CAC	2	6	230899	230904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987600
5010	NC_016863	AAG	2	6	230910	230915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987600
5011	NC_016863	CGG	3	9	230986	230994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987600
5012	NC_016863	ACC	2	6	231027	231032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987600
5013	NC_016863	GCG	3	9	231095	231103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987600
5014	NC_016863	CTG	2	6	231144	231149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987600
5015	NC_016863	CCA	2	6	231150	231155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987600
5016	NC_016863	CAG	2	6	231175	231180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987600
5017	NC_016863	ATC	2	6	231219	231224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_016863	GAT	2	6	231244	231249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016863	A	7	7	231259	231265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016863	TA	3	6	231271	231276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016863	A	6	6	231309	231314	100 %	0 %	0 %	0 %	378987601
5022	NC_016863	GTG	2	6	231339	231344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378987601
5023	NC_016863	GAT	2	6	231426	231431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987601
5024	NC_016863	TC	3	6	231443	231448	0 %	50 %	0 %	50 %	378987601
5025	NC_016863	ATC	2	6	231487	231492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987601
5026	NC_016863	TTA	2	6	231535	231540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987601
5027	NC_016863	ATA	2	6	231553	231558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378987601
5028	NC_016863	GCT	2	6	231605	231610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987601
5029	NC_016863	ATT	2	6	231732	231737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987601
5030	NC_016863	TAT	2	6	231811	231816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987601
5031	NC_016863	ATG	2	6	231856	231861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987601
5032	NC_016863	GGTG	2	8	231896	231903	0 %	25 %	75 %	0 %	378987601
5033	NC_016863	GC	3	6	231926	231931	0 %	0 %	50 %	50 %	378987601
5034	NC_016863	GGCG	2	8	232033	232040	0 %	0 %	75 %	25 %	378987601
5035	NC_016863	GGC	2	6	232119	232124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5036	NC_016863	CGA	2	6	232136	232141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987601
5037	NC_016863	AT	3	6	232180	232185	50 %	50 %	0 %	0 %	378987601
5038	NC_016863	GC	3	6	232194	232199	0 %	0 %	50 %	50 %	378987601
5039	NC_016863	GCGG	2	8	232228	232235	0 %	0 %	75 %	25 %	378987601
5040	NC_016863	GAA	2	6	232323	232328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378987601
5041	NC_016863	GGC	2	6	232452	232457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5042	NC_016863	CCT	2	6	232477	232482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378987601
5043	NC_016863	CGG	2	6	232511	232516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5044	NC_016863	GCT	2	6	232574	232579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987601
5045	NC_016863	TGA	2	6	232694	232699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987601
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5047	NC_016863	TGA	2	6	233021	233026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987601
5048	NC_016863	CAA	2	6	233060	233065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987601
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5050	NC_016863	CG	3	6	233172	233177	0 %	0 %	50 %	50 %	378987601
5051	NC_016863	CTA	2	6	233201	233206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987601
5052	NC_016863	CGG	2	6	233273	233278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5053	NC_016863	GCG	2	6	233293	233298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5054	NC_016863	GCACC	2	10	233327	233336	20 %	0 %	20 %	60 %	378987601
5055	NC_016863	CGG	2	6	233345	233350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5056	NC_016863	GCT	2	6	233357	233362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987601
5057	NC_016863	TA	3	6	233416	233421	50 %	50 %	0 %	0 %	378987601
5058	NC_016863	ACT	2	6	233461	233466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987601
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5061	NC_016863	GGC	2	6	233625	233630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987601
5062	NC_016863	CGC	2	6	233632	233637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987601
5063	NC_016863	ACA	2	6	233656	233661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378987601
5064	NC_016863	TGC	2	6	233818	233823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987601
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5076	NC_016863	CCGC	2	8	234388	234395	0 %	0 %	25 %	75 %	378987602
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5081	NC_016863	GC	3	6	234648	234653	0 %	0 %	50 %	50 %	378987602
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5091	NC_016863	G	6	6	235281	235286	0 %	0 %	100 %	0 %	378987604
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5096	NC_016863	CGG	3	9	235529	235537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378987604
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5105	NC_016863	TGC	2	6	236283	236288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987606
5106	NC_016863	CAC	2	6	236350	236355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378987606
5107	NC_016863	TAT	2	6	236360	236365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378987606
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5109	NC_016863	GAT	2	6	236627	236632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987606
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5111	NC_016863	CCG	2	6	236702	236707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378987606
5112	NC_016863	CAGTT	2	10	236716	236725	20 %	40 %	20 %	20 %	378987606
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5120	NC_016863	A	8	8	237144	237151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_016863	GGC	2	6	237158	237163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_016863	GTT	2	6	237183	237188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016863	CG	3	6	237226	237231	0 %	0 %	50 %	50 %	378987607
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5232	NC_016863	CG	3	6	241987	241992	0 %	0 %	50 %	50 %	378987611
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5241	NC_016863	CGT	2	6	242456	242461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987612
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5246	NC_016863	GCA	2	6	242705	242710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378987612
5247	NC_016863	CTT	3	9	242717	242725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987612
5248	NC_016863	ATG	2	6	242737	242742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378987612
5249	NC_016863	ATCG	2	8	242843	242850	25 %	25 %	25 %	25 %	378987613
5250	NC_016863	TCG	2	6	242876	242881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378987613
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5313	NC_016863	C	6	6	245964	245969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5314	NC_016863	TGCTC	2	10	246042	246051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5346	NC_016863	AC	3	6	247302	247307	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5352	NC_016863	CGAT	2	8	247645	247652	25 %	25 %	25 %	25 %	378987616
5353	NC_016863	CATA	2	8	247691	247698	50 %	25 %	0 %	25 %	378987616
5354	NC_016863	TCA	2	6	247709	247714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5356	NC_016863	CCA	2	6	247756	247761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5357	NC_016863	A	7	7	247770	247776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_016863	AGA	2	6	247791	247796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5359	NC_016863	GCG	2	6	247824	247829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5360	NC_016863	CTA	2	6	247963	247968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378987617
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5364	NC_016863	T	8	8	248065	248072	0 %	100 %	0 %	0 %	378987617
5365	NC_016863	TCT	2	6	248103	248108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378987617
5366	NC_016863	GC	3	6	248149	248154	0 %	0 %	50 %	50 %	378987617
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