MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_016860	CAGC	3	12	641065	641076	25 %	0 %	25 %	50 %	378983147
13503	NC_016860	ACC	2	6	641125	641130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378983147
13504	NC_016860	AGC	2	6	641167	641172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13505	NC_016860	GAC	2	6	641225	641230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13506	NC_016860	CAG	2	6	641376	641381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13507	NC_016860	TGG	2	6	641393	641398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983147
13508	NC_016860	TCG	2	6	641437	641442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13509	NC_016860	TTGC	2	8	641455	641462	0 %	50 %	25 %	25 %	378983147
13510	NC_016860	TGC	2	6	641486	641491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13511	NC_016860	CTG	2	6	641528	641533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13512	NC_016860	CTG	2	6	641574	641579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13513	NC_016860	AAT	2	6	641598	641603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378983147
13514	NC_016860	TGC	2	6	641607	641612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13515	NC_016860	AG	3	6	641617	641622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_016860	GC	3	6	641764	641769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13517	NC_016860	TCA	2	6	641794	641799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_016860	TCG	2	6	641825	641830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_016860	GGC	2	6	641843	641848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_016860	CTT	2	6	641884	641889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_016860	T	6	6	641937	641942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_016860	TTA	2	6	641962	641967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_016860	ATTA	2	8	641995	642002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_016860	TAAT	2	8	642036	642043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_016860	ATCT	2	8	642051	642058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13526	NC_016860	ATA	2	6	642099	642104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_016860	GT	4	8	642138	642145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_016860	CTA	2	6	642184	642189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983148
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13530	NC_016860	TACCG	2	10	642345	642354	20 %	20 %	20 %	40 %	378983148
13531	NC_016860	GGC	2	6	642431	642436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983148
13532	NC_016860	GCTG	2	8	642488	642495	0 %	25 %	50 %	25 %	378983148
13533	NC_016860	ATA	2	6	642550	642555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378983148
13534	NC_016860	CCG	3	9	642655	642663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983148
13535	NC_016860	ACG	2	6	642666	642671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983148
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13537	NC_016860	AAT	2	6	642715	642720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378983148
13538	NC_016860	AGGGA	2	10	642737	642746	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_016860	GAT	2	6	642794	642799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_016860	GGCGC	2	10	642807	642816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13541	NC_016860	TGG	2	6	642862	642867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983149
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13548	NC_016860	T	6	6	643363	643368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_016860	TTC	2	6	643403	643408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378983150
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13553	NC_016860	TTAT	2	8	643472	643479	25 %	75 %	0 %	0 %	378983150
13554	NC_016860	CGG	2	6	643484	643489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983150
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13556	NC_016860	A	6	6	643580	643585	100 %	0 %	0 %	0 %	378983150
13557	NC_016860	CGC	2	6	643598	643603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983150
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13560	NC_016860	A	6	6	643743	643748	100 %	0 %	0 %	0 %	378983150
13561	NC_016860	AACC	2	8	643872	643879	50 %	0 %	0 %	50 %	378983150
13562	NC_016860	TTA	2	6	643887	643892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378983150
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13564	NC_016860	GC	3	6	643985	643990	0 %	0 %	50 %	50 %	378983150
13565	NC_016860	AG	3	6	644067	644072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_016860	GAA	2	6	644097	644102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378983151
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13593	NC_016860	CGGGG	2	10	645336	645345	0 %	0 %	80 %	20 %	378983151
13594	NC_016860	CA	3	6	645384	645389	50 %	0 %	0 %	50 %	378983151
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13599	NC_016860	A	6	6	645637	645642	100 %	0 %	0 %	0 %	378983151
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13609	NC_016860	GGTC	2	8	646161	646168	0 %	25 %	50 %	25 %	378983151
13610	NC_016860	CGCGT	2	10	646327	646336	0 %	20 %	40 %	40 %	378983151
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13991	NC_016860	GTC	2	6	664628	664633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983172
13992	NC_016860	ATG	2	6	664691	664696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983172
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