MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 104581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016860	ATA	2	6	617819	617824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378983124
13003	NC_016860	ATTA	2	8	617962	617969	50 %	50 %	0 %	0 %	378983124
13004	NC_016860	ATG	2	6	618005	618010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983124
13005	NC_016860	AAT	2	6	618092	618097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016860	T	8	8	618109	618116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016860	TCA	2	6	618253	618258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983125
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13011	NC_016860	TGG	2	6	618657	618662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983125
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13013	NC_016860	TCA	2	6	618886	618891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983125
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13015	NC_016860	GCGCTG	2	12	618926	618937	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378983125
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13017	NC_016860	GAA	2	6	619122	619127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13020	NC_016860	CTGGG	2	10	619189	619198	0 %	20 %	60 %	20 %	378983126
13021	NC_016860	GTAA	2	8	619267	619274	50 %	25 %	25 %	0 %	378983126
13022	NC_016860	T	6	6	619306	619311	0 %	100 %	0 %	0 %	378983126
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13044	NC_016860	ATTT	2	8	620409	620416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_016860	AAC	2	6	620438	620443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_016860	AG	3	6	620484	620489	50 %	0 %	50 %	0 %	378983127
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13058	NC_016860	ATT	2	6	620795	620800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378983127
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13123	NC_016860	TAT	2	6	624141	624146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378983129
13124	NC_016860	CGG	2	6	624152	624157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983129
13125	NC_016860	TGA	2	6	624158	624163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983129
13126	NC_016860	TGA	2	6	624278	624283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983129
13127	NC_016860	TTA	2	6	624343	624348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378983129
13128	NC_016860	GC	3	6	624392	624397	0 %	0 %	50 %	50 %	378983129
13129	NC_016860	CTG	2	6	624403	624408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983129
13130	NC_016860	CAG	2	6	624462	624467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983129
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13132	NC_016860	GGTTT	2	10	624508	624517	0 %	60 %	40 %	0 %	378983129
13133	NC_016860	CG	3	6	624540	624545	0 %	0 %	50 %	50 %	378983129
13134	NC_016860	T	7	7	624584	624590	0 %	100 %	0 %	0 %	378983129
13135	NC_016860	TCC	2	6	624600	624605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378983129
13136	NC_016860	TGA	2	6	624629	624634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983129
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13138	NC_016860	ATG	2	6	624743	624748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983130
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13140	NC_016860	GC	3	6	624845	624850	0 %	0 %	50 %	50 %	378983130
13141	NC_016860	TGG	2	6	624874	624879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983130
13142	NC_016860	TGG	2	6	624900	624905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983130
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13153	NC_016860	CGG	3	9	625356	625364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983130
13154	NC_016860	GGA	2	6	625496	625501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378983130
13155	NC_016860	GGA	2	6	625579	625584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378983130
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13157	NC_016860	GCGTC	2	10	625665	625674	0 %	20 %	40 %	40 %	378983130
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13162	NC_016860	CCG	2	6	625968	625973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13163	NC_016860	T	6	6	626088	626093	0 %	100 %	0 %	0 %	378983131
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13189	NC_016860	GACT	2	8	627260	627267	25 %	25 %	25 %	25 %	378983132
13190	NC_016860	CGA	2	6	627299	627304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983132
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13210	NC_016860	TCT	2	6	627974	627979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378983132
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13213	NC_016860	ATC	2	6	628099	628104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378983133
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13225	NC_016860	GGT	2	6	628543	628548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378983133
13226	NC_016860	ATG	2	6	628565	628570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378983133
13227	NC_016860	CCGCC	2	10	628626	628635	0 %	0 %	20 %	80 %	378983133
13228	NC_016860	AGAC	2	8	628669	628676	50 %	0 %	25 %	25 %	378983133
13229	NC_016860	AGC	2	6	628693	628698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983133
13230	NC_016860	T	8	8	628766	628773	0 %	100 %	0 %	0 %	378983133
13231	NC_016860	GCA	2	6	628823	628828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983133
13232	NC_016860	GCC	2	6	628897	628902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983133
13233	NC_016860	TTCG	2	8	628911	628918	0 %	50 %	25 %	25 %	378983133
13234	NC_016860	ATA	2	6	628921	628926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378983133
13235	NC_016860	CGA	2	6	628989	628994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983133
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13237	NC_016860	ACG	2	6	629092	629097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13238	NC_016860	AAAAT	2	10	629130	629139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13239	NC_016860	A	7	7	629161	629167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13240	NC_016860	ATTT	2	8	629178	629185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13241	NC_016860	TAAA	2	8	629215	629222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13242	NC_016860	T	6	6	629227	629232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13243	NC_016860	GTT	2	6	629259	629264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_016860	TAA	2	6	629278	629283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_016860	AT	3	6	629322	629327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13248	NC_016860	ATT	2	6	629390	629395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_016860	GTT	2	6	629401	629406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13359	NC_016860	TTTA	2	8	634098	634105	25 %	75 %	0 %	0 %	378983138
13360	NC_016860	GA	3	6	634158	634163	50 %	0 %	50 %	0 %	378983138
13361	NC_016860	GACGT	2	10	634185	634194	20 %	20 %	40 %	20 %	378983138
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13365	NC_016860	ACTG	2	8	634392	634399	25 %	25 %	25 %	25 %	378983138
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13485	NC_016860	CAG	2	6	640099	640104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983145
13486	NC_016860	ACA	2	6	640113	640118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378983145
13487	NC_016860	CAGC	2	8	640135	640142	25 %	0 %	25 %	50 %	378983145
13488	NC_016860	TCG	2	6	640168	640173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378983145
13489	NC_016860	GGA	2	6	640197	640202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378983145
13490	NC_016860	CAG	2	6	640324	640329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983145
13491	NC_016860	GAG	2	6	640332	640337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378983145
13492	NC_016860	CGG	2	6	640380	640385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378983145
13493	NC_016860	GAT	2	6	640465	640470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_016860	ACG	2	6	640542	640547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983146
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13497	NC_016860	CGC	2	6	640829	640834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378983147
13498	NC_016860	CG	4	8	640857	640864	0 %	0 %	50 %	50 %	378983147
13499	NC_016860	ACG	2	6	640882	640887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378983147
13500	NC_016860	ATCA	2	8	640929	640936	50 %	25 %	0 %	25 %	378983147

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