MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016857	CGG	2	6	1002975	1002980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700131
21502	NC_016857	ATT	2	6	1002986	1002991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700131
21503	NC_016857	CG	3	6	1003080	1003085	0 %	0 %	50 %	50 %	379700131
21504	NC_016857	GCG	2	6	1003140	1003145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700131
21505	NC_016857	CG	4	8	1003144	1003151	0 %	0 %	50 %	50 %	379700131
21506	NC_016857	TCG	2	6	1003413	1003418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700131
21507	NC_016857	TCG	2	6	1003439	1003444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700131
21508	NC_016857	CCT	2	6	1003512	1003517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379700131
21509	NC_016857	AAC	2	6	1003626	1003631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379700131
21510	NC_016857	GGAC	2	8	1003643	1003650	25 %	0 %	50 %	25 %	379700131
21511	NC_016857	AAG	2	6	1003653	1003658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379700131
21512	NC_016857	GAG	2	6	1003718	1003723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379700131
21513	NC_016857	CCA	2	6	1003765	1003770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379700131
21514	NC_016857	CGC	2	6	1003867	1003872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700131
21515	NC_016857	GATC	2	8	1003900	1003907	25 %	25 %	25 %	25 %	379700131
21516	NC_016857	GCC	2	6	1004039	1004044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700131
21517	NC_016857	CAA	2	6	1004095	1004100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379700131
21518	NC_016857	CGC	2	6	1004160	1004165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700131
21519	NC_016857	ATG	2	6	1004168	1004173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379700131
21520	NC_016857	GAC	2	6	1004257	1004262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379700131
21521	NC_016857	T	6	6	1004361	1004366	0 %	100 %	0 %	0 %	379700132
21522	NC_016857	CCG	2	6	1004450	1004455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700132
21523	NC_016857	GCGG	2	8	1004469	1004476	0 %	0 %	75 %	25 %	379700132
21524	NC_016857	CTA	2	6	1004522	1004527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379700132
21525	NC_016857	TC	3	6	1004528	1004533	0 %	50 %	0 %	50 %	379700132
21526	NC_016857	GCG	2	6	1004584	1004589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700132
21527	NC_016857	TGG	2	6	1004617	1004622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379700132
21528	NC_016857	GC	3	6	1004677	1004682	0 %	0 %	50 %	50 %	379700132
21529	NC_016857	A	6	6	1004820	1004825	100 %	0 %	0 %	0 %	379700132
21530	NC_016857	GCTG	2	8	1004834	1004841	0 %	25 %	50 %	25 %	379700132
21531	NC_016857	CG	4	8	1004857	1004864	0 %	0 %	50 %	50 %	379700132
21532	NC_016857	GCC	2	6	1004908	1004913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700132
21533	NC_016857	ACC	2	6	1004925	1004930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379700132
21534	NC_016857	AGG	2	6	1004950	1004955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379700132
21535	NC_016857	TGA	2	6	1004990	1004995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379700133
21536	NC_016857	GGT	2	6	1005025	1005030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379700133
21537	NC_016857	TCTGGC	2	12	1005039	1005050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21538	NC_016857	TGA	2	6	1005053	1005058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379700133
21539	NC_016857	GC	3	6	1005069	1005074	0 %	0 %	50 %	50 %	379700133
21540	NC_016857	GCA	2	6	1005081	1005086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21541	NC_016857	TGC	2	6	1005149	1005154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21542	NC_016857	GC	3	6	1005171	1005176	0 %	0 %	50 %	50 %	379700133
21543	NC_016857	T	6	6	1005241	1005246	0 %	100 %	0 %	0 %	379700133
21544	NC_016857	CGG	2	6	1005252	1005257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700133
21545	NC_016857	GGCT	2	8	1005262	1005269	0 %	25 %	50 %	25 %	379700133
21546	NC_016857	GCC	2	6	1005291	1005296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700133
21547	NC_016857	CGT	2	6	1005339	1005344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21548	NC_016857	GAT	2	6	1005354	1005359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379700133
21549	NC_016857	CGC	2	6	1005413	1005418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700133
21550	NC_016857	CTT	2	6	1005423	1005428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379700133
21551	NC_016857	CTG	3	9	1005466	1005474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21552	NC_016857	TTG	2	6	1005508	1005513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379700133
21553	NC_016857	TGG	2	6	1005536	1005541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379700133
21554	NC_016857	TGG	2	6	1005554	1005559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379700133
21555	NC_016857	CGA	2	6	1005581	1005586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21556	NC_016857	CAG	2	6	1005601	1005606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21557	NC_016857	TGC	2	6	1005656	1005661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21558	NC_016857	GCG	3	9	1005664	1005672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700133
21559	NC_016857	TGC	2	6	1005676	1005681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700133
21560	NC_016857	CT	3	6	1005727	1005732	0 %	50 %	0 %	50 %	379700133
21561	NC_016857	ATTG	2	8	1005762	1005769	25 %	50 %	25 %	0 %	379700133
21562	NC_016857	GCC	2	6	1005877	1005882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21563	NC_016857	AGA	2	6	1005934	1005939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21564	NC_016857	TAA	2	6	1006004	1006009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21565	NC_016857	AT	3	6	1006039	1006044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21566	NC_016857	AAATC	2	10	1006062	1006071	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21567	NC_016857	ATG	2	6	1006134	1006139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21568	NC_016857	CCCGT	2	10	1006188	1006197	0 %	20 %	20 %	60 %	379700134
21569	NC_016857	TTG	2	6	1006223	1006228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379700134
21570	NC_016857	TTAA	2	8	1006364	1006371	50 %	50 %	0 %	0 %	379700134
21571	NC_016857	TAT	2	6	1006394	1006399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700134
21572	NC_016857	CGC	2	6	1006417	1006422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700134
21573	NC_016857	TGG	2	6	1006446	1006451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379700134
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21575	NC_016857	CTG	2	6	1006565	1006570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700134
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21578	NC_016857	CCTT	2	8	1006602	1006609	0 %	50 %	0 %	50 %	379700134
21579	NC_016857	ATT	2	6	1006615	1006620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700134
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21582	NC_016857	TAT	2	6	1006801	1006806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700134
21583	NC_016857	GGC	2	6	1007029	1007034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700134
21584	NC_016857	GCG	2	6	1007063	1007068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700134
21585	NC_016857	GGCCTG	2	12	1007095	1007106	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	379700134
21586	NC_016857	ACC	2	6	1007121	1007126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379700134
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21588	NC_016857	TGC	2	6	1007194	1007199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700134
21589	NC_016857	ATT	2	6	1007214	1007219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700134
21590	NC_016857	CTG	2	6	1007228	1007233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700134
21591	NC_016857	TAT	2	6	1007236	1007241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700134
21592	NC_016857	TTTA	2	8	1007258	1007265	25 %	75 %	0 %	0 %	379700134
21593	NC_016857	CTG	2	6	1007267	1007272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700134
21594	NC_016857	AAT	2	6	1007386	1007391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21595	NC_016857	AAAAT	2	10	1007421	1007430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21596	NC_016857	CTC	2	6	1007454	1007459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21597	NC_016857	TC	3	6	1007465	1007470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21598	NC_016857	ACA	2	6	1007575	1007580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379700135
21599	NC_016857	TTA	2	6	1007596	1007601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379700135
21600	NC_016857	TGT	2	6	1007621	1007626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379700135
21601	NC_016857	TCT	2	6	1007659	1007664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379700135
21602	NC_016857	CATTG	2	10	1007864	1007873	20 %	40 %	20 %	20 %	379700135
21603	NC_016857	CGT	2	6	1007918	1007923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700135
21604	NC_016857	TTGT	2	8	1007949	1007956	0 %	75 %	25 %	0 %	379700135
21605	NC_016857	GTT	2	6	1008000	1008005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379700135
21606	NC_016857	TGT	2	6	1008050	1008055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379700135
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21608	NC_016857	TGG	2	6	1008182	1008187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379700135
21609	NC_016857	AGA	2	6	1008193	1008198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379700135
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21611	NC_016857	TTAT	2	8	1008418	1008425	25 %	75 %	0 %	0 %	379700135
21612	NC_016857	CGC	2	6	1008452	1008457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379700135
21613	NC_016857	AT	3	6	1008515	1008520	50 %	50 %	0 %	0 %	379700135
21614	NC_016857	AAC	2	6	1008636	1008641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379700135
21615	NC_016857	GCT	2	6	1008653	1008658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379700135
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21854	NC_016857	GGC	2	6	1019969	1019974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379700144
21855	NC_016857	GAT	2	6	1020071	1020076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379700144
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