MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016857	CAT	2	6	680363	680368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_016857	CCA	2	6	680422	680427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699836
14503	NC_016857	GCC	2	6	680470	680475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699836
14504	NC_016857	AGT	2	6	680476	680481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699836
14505	NC_016857	CAG	2	6	680573	680578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699836
14506	NC_016857	GTT	2	6	680587	680592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699836
14507	NC_016857	GCA	2	6	680638	680643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699836
14508	NC_016857	ACCAGT	2	12	680697	680708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379699836
14509	NC_016857	GA	3	6	680728	680733	50 %	0 %	50 %	0 %	379699836
14510	NC_016857	ACC	2	6	680808	680813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699836
14511	NC_016857	TGT	2	6	680848	680853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699836
14512	NC_016857	CAG	2	6	680909	680914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699836
14513	NC_016857	TGA	2	6	680932	680937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699836
14514	NC_016857	CCA	2	6	680943	680948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699836
14515	NC_016857	CTAAG	2	10	680962	680971	40 %	20 %	20 %	20 %	379699836
14516	NC_016857	T	6	6	681021	681026	0 %	100 %	0 %	0 %	379699836
14517	NC_016857	CGC	2	6	681031	681036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699836
14518	NC_016857	AAT	2	6	681119	681124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699836
14519	NC_016857	CAGC	2	8	681155	681162	25 %	0 %	25 %	50 %	379699836
14520	NC_016857	CAT	2	6	681263	681268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699836
14521	NC_016857	CCG	2	6	681282	681287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699836
14522	NC_016857	GCG	2	6	681290	681295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699836
14523	NC_016857	GCG	2	6	681328	681333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699836
14524	NC_016857	TGA	2	6	681343	681348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699836
14525	NC_016857	CCG	2	6	681363	681368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699836
14526	NC_016857	GGAG	2	8	681383	681390	25 %	0 %	75 %	0 %	379699836
14527	NC_016857	GCGT	2	8	681442	681449	0 %	25 %	50 %	25 %	379699836
14528	NC_016857	GCG	2	6	681482	681487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699836
14529	NC_016857	CCAG	2	8	681538	681545	25 %	0 %	25 %	50 %	379699836
14530	NC_016857	GTG	2	6	681549	681554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699836
14531	NC_016857	TGC	2	6	681646	681651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699836
14532	NC_016857	ATC	2	6	681723	681728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699836
14533	NC_016857	CGA	2	6	681730	681735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699836
14534	NC_016857	GCG	2	6	681760	681765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699836
14535	NC_016857	AAC	2	6	681789	681794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699836
14536	NC_016857	CAC	2	6	681806	681811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699836
14537	NC_016857	CAA	2	6	681821	681826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699836
14538	NC_016857	AT	3	6	681832	681837	50 %	50 %	0 %	0 %	379699836
14539	NC_016857	CAG	2	6	681939	681944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14540	NC_016857	GCC	2	6	682032	682037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699837
14541	NC_016857	CTG	2	6	682038	682043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14542	NC_016857	TAA	2	6	682044	682049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699837
14543	NC_016857	CTG	3	9	682059	682067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14544	NC_016857	CCGCC	2	10	682085	682094	0 %	0 %	20 %	80 %	379699837
14545	NC_016857	GCGAC	2	10	682097	682106	20 %	0 %	40 %	40 %	379699837
14546	NC_016857	CAG	3	9	682131	682139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14547	NC_016857	AGC	2	6	682150	682155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14548	NC_016857	CGCTTC	2	12	682233	682244	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	379699837
14549	NC_016857	CG	4	8	682247	682254	0 %	0 %	50 %	50 %	379699837
14550	NC_016857	GTT	2	6	682305	682310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699837
14551	NC_016857	CG	3	6	682322	682327	0 %	0 %	50 %	50 %	379699837
14552	NC_016857	CGG	3	9	682349	682357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699837
14553	NC_016857	GCG	2	6	682375	682380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699837
14554	NC_016857	GGC	2	6	682403	682408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699837
14555	NC_016857	GGC	2	6	682413	682418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699837
14556	NC_016857	TGC	2	6	682442	682447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14557	NC_016857	CGCC	2	8	682463	682470	0 %	0 %	25 %	75 %	379699837
14558	NC_016857	GCT	2	6	682486	682491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699837
14559	NC_016857	GGC	2	6	682537	682542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699837
14560	NC_016857	GC	3	6	682640	682645	0 %	0 %	50 %	50 %	379699837
14561	NC_016857	GC	3	6	682705	682710	0 %	0 %	50 %	50 %	379699837
14562	NC_016857	CAT	2	6	682785	682790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699837
14563	NC_016857	GCA	2	6	682791	682796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699838
14564	NC_016857	TCAG	2	8	682820	682827	25 %	25 %	25 %	25 %	379699838
14565	NC_016857	CG	3	6	682844	682849	0 %	0 %	50 %	50 %	379699838
14566	NC_016857	CAG	2	6	682873	682878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699838
14567	NC_016857	GCG	2	6	682882	682887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699838
14568	NC_016857	GGC	2	6	682905	682910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699838
14569	NC_016857	CCG	2	6	682929	682934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699838
14570	NC_016857	CAG	2	6	683029	683034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699838
14571	NC_016857	CGG	2	6	683138	683143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699838
14572	NC_016857	CCA	2	6	683175	683180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699838
14573	NC_016857	AGTGG	2	10	683195	683204	20 %	20 %	60 %	0 %	379699838
14574	NC_016857	GC	3	6	683222	683227	0 %	0 %	50 %	50 %	379699838
14575	NC_016857	CTTG	2	8	683231	683238	0 %	50 %	25 %	25 %	379699838
14576	NC_016857	TC	3	6	683239	683244	0 %	50 %	0 %	50 %	379699838
14577	NC_016857	AGC	2	6	683258	683263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699838
14578	NC_016857	CGT	2	6	683277	683282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699838
14579	NC_016857	CAC	2	6	683335	683340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699839
14580	NC_016857	CGGT	2	8	683384	683391	0 %	25 %	50 %	25 %	379699839
14581	NC_016857	GC	3	6	683427	683432	0 %	0 %	50 %	50 %	379699839
14582	NC_016857	GCT	2	6	683471	683476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699839
14583	NC_016857	CAGC	2	8	683487	683494	25 %	0 %	25 %	50 %	379699839
14584	NC_016857	GGT	2	6	683569	683574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699839
14585	NC_016857	GCG	2	6	683613	683618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699839
14586	NC_016857	CGA	2	6	683619	683624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699839
14587	NC_016857	GCC	2	6	683636	683641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699839
14588	NC_016857	CGG	2	6	683646	683651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699839
14589	NC_016857	CCG	2	6	683663	683668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699839
14590	NC_016857	CGC	2	6	683673	683678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699839
14591	NC_016857	GC	3	6	683736	683741	0 %	0 %	50 %	50 %	379699839
14592	NC_016857	ACC	2	6	683747	683752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699839
14593	NC_016857	TGG	2	6	683919	683924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699839
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14597	NC_016857	TTTG	2	8	684139	684146	0 %	75 %	25 %	0 %	379699839
14598	NC_016857	CTT	2	6	684156	684161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699839
14599	NC_016857	GATCA	2	10	684172	684181	40 %	20 %	20 %	20 %	379699839
14600	NC_016857	GCA	2	6	684222	684227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699839
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14604	NC_016857	CCG	2	6	684407	684412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699839
14605	NC_016857	CAGC	2	8	684435	684442	25 %	0 %	25 %	50 %	379699839
14606	NC_016857	TTC	2	6	684457	684462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699839
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14613	NC_016857	GCT	2	6	684803	684808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699839
14614	NC_016857	T	7	7	684846	684852	0 %	100 %	0 %	0 %	379699839
14615	NC_016857	TTC	2	6	684859	684864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699840
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14987	NC_016857	GTT	2	6	701484	701489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699858
14988	NC_016857	ATG	2	6	701500	701505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699858
14989	NC_016857	GCC	2	6	701550	701555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699858
14990	NC_016857	GAT	2	6	701565	701570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699858
14991	NC_016857	TCA	2	6	701612	701617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699858
14992	NC_016857	CGC	2	6	701706	701711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699858
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14994	NC_016857	GCCGT	2	10	701746	701755	0 %	20 %	40 %	40 %	379699858
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14999	NC_016857	CCAT	2	8	702110	702117	25 %	25 %	0 %	50 %	379699858
15000	NC_016857	CGAT	2	8	702127	702134	25 %	25 %	25 %	25 %	379699858

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