MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016857	TGAT	2	8	612841	612848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_016857	GGC	2	6	612861	612866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_016857	CTTCA	2	10	613032	613041	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13004	NC_016857	GC	3	6	613115	613120	0 %	0 %	50 %	50 %	379699774
13005	NC_016857	CTT	2	6	613144	613149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699774
13006	NC_016857	TCC	2	6	613154	613159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379699774
13007	NC_016857	CAT	2	6	613188	613193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699774
13008	NC_016857	GTC	2	6	613204	613209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699774
13009	NC_016857	CAC	2	6	613267	613272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699774
13010	NC_016857	TGA	2	6	613299	613304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_016857	GCTC	2	8	613336	613343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_016857	TC	3	6	613410	613415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_016857	ACG	2	6	613499	613504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_016857	TCAT	2	8	613613	613620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13015	NC_016857	T	8	8	613652	613659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016857	CGG	2	6	613704	613709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_016857	ATC	2	6	613721	613726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_016857	TGG	2	6	613749	613754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_016857	CTT	2	6	613771	613776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_016857	GTA	2	6	613799	613804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_016857	GCG	2	6	613820	613825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_016857	CT	3	6	613912	613917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_016857	TGG	2	6	614060	614065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016857	T	6	6	614161	614166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016857	CTT	2	6	614188	614193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_016857	CGC	2	6	614243	614248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_016857	TGG	2	6	614260	614265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016857	ATTA	2	8	614274	614281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016857	ATT	2	6	614299	614304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699775
13030	NC_016857	CGCC	2	8	614397	614404	0 %	0 %	25 %	75 %	379699775
13031	NC_016857	TCT	2	6	614435	614440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699775
13032	NC_016857	TCA	2	6	614506	614511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699775
13033	NC_016857	CAG	2	6	614519	614524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699775
13034	NC_016857	TTA	2	6	614530	614535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699775
13035	NC_016857	TA	3	6	614576	614581	50 %	50 %	0 %	0 %	379699775
13036	NC_016857	TA	3	6	614595	614600	50 %	50 %	0 %	0 %	379699775
13037	NC_016857	GTT	2	6	614604	614609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379699775
13038	NC_016857	GTA	2	6	614700	614705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699775
13039	NC_016857	TGCA	2	8	614748	614755	25 %	25 %	25 %	25 %	379699775
13040	NC_016857	TAA	2	6	614770	614775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379699775
13041	NC_016857	TTGT	2	8	614796	614803	0 %	75 %	25 %	0 %	379699775
13042	NC_016857	TAT	2	6	614820	614825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699775
13043	NC_016857	TTC	2	6	614826	614831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699775
13044	NC_016857	GTTT	2	8	614842	614849	0 %	75 %	25 %	0 %	379699775
13045	NC_016857	TGA	2	6	614865	614870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699775
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13047	NC_016857	A	6	6	614902	614907	100 %	0 %	0 %	0 %	379699775
13048	NC_016857	GTA	2	6	614920	614925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699775
13049	NC_016857	ATAA	2	8	614930	614937	75 %	25 %	0 %	0 %	379699775
13050	NC_016857	CAA	2	6	614975	614980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699775
13051	NC_016857	CTG	2	6	615025	615030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699775
13052	NC_016857	GCA	2	6	615064	615069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699775
13053	NC_016857	TGC	2	6	615110	615115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699775
13054	NC_016857	TAG	2	6	615144	615149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699775
13055	NC_016857	TAT	2	6	615150	615155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379699775
13056	NC_016857	TTGTA	2	10	615255	615264	20 %	60 %	20 %	0 %	379699775
13057	NC_016857	CAG	2	6	615291	615296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699775
13058	NC_016857	ATTT	2	8	615344	615351	25 %	75 %	0 %	0 %	379699775
13059	NC_016857	GAT	2	6	615433	615438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699775
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13061	NC_016857	AT	3	6	615486	615491	50 %	50 %	0 %	0 %	379699775
13062	NC_016857	TA	3	6	615501	615506	50 %	50 %	0 %	0 %	379699775
13063	NC_016857	CAA	2	6	615548	615553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699775
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13065	NC_016857	ATC	2	6	615613	615618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699775
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13071	NC_016857	T	8	8	615966	615973	0 %	100 %	0 %	0 %	379699776
13072	NC_016857	AT	3	6	615995	616000	50 %	50 %	0 %	0 %	379699776
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13082	NC_016857	TGA	2	6	616734	616739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379699776
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13088	NC_016857	GC	3	6	617046	617051	0 %	0 %	50 %	50 %	379699777
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13090	NC_016857	CGAT	2	8	617177	617184	25 %	25 %	25 %	25 %	379699777
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13092	NC_016857	TTA	2	6	617320	617325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016857	GTT	2	6	617333	617338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016857	AGT	2	6	617367	617372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13096	NC_016857	GTA	2	6	617456	617461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_016857	TTG	2	6	617472	617477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_016857	GC	3	6	617537	617542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_016857	GCG	3	9	617582	617590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_016857	CTC	2	6	617660	617665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_016857	ATT	2	6	617696	617701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_016857	GTC	2	6	617735	617740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_016857	TCA	2	6	617836	617841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_016857	A	7	7	617909	617915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_016857	TAA	2	6	617967	617972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_016857	ATA	2	6	617978	617983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_016857	GTT	2	6	617989	617994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_016857	ATT	2	6	618033	618038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_016857	GGGA	2	8	618218	618225	25 %	0 %	75 %	0 %	379699778
13110	NC_016857	CAA	2	6	618293	618298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379699778
13111	NC_016857	GTC	2	6	618312	618317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699778
13112	NC_016857	CTT	2	6	618320	618325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699778
13113	NC_016857	CGG	2	6	618351	618356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699778
13114	NC_016857	AG	3	6	618375	618380	50 %	0 %	50 %	0 %	379699778
13115	NC_016857	GCA	2	6	618401	618406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699778
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13119	NC_016857	TCG	2	6	618677	618682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699779
13120	NC_016857	GCG	2	6	618712	618717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_016857	GC	3	6	618757	618762	0 %	0 %	50 %	50 %	379699780
13122	NC_016857	AGA	2	6	618824	618829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699780
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13124	NC_016857	ATCACC	2	12	618858	618869	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379699780
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13221	NC_016857	CTTTT	2	10	623542	623551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13223	NC_016857	TAACGT	2	12	623581	623592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13230	NC_016857	GCT	2	6	624241	624246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699785
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13235	NC_016857	A	6	6	624414	624419	100 %	0 %	0 %	0 %	379699785
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13241	NC_016857	GTCGC	2	10	624602	624611	0 %	20 %	40 %	40 %	379699785
13242	NC_016857	GCG	2	6	624627	624632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699785
13243	NC_016857	TGG	2	6	624759	624764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379699785
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13360	NC_016857	TTACC	2	10	630242	630251	20 %	40 %	0 %	40 %	379699788
13361	NC_016857	TGC	2	6	630301	630306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699788
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13485	NC_016857	CGG	2	6	635442	635447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699793
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