MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 chromosome

Total Repeats: 103148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016857	CGC	2	6	474274	474279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699642
10003	NC_016857	GCC	2	6	474287	474292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699642
10004	NC_016857	TTC	2	6	474305	474310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699642
10005	NC_016857	TGC	2	6	474330	474335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699642
10006	NC_016857	GTC	2	6	474359	474364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699642
10007	NC_016857	CGC	2	6	474422	474427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699642
10008	NC_016857	CGT	2	6	474571	474576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699642
10009	NC_016857	TCG	2	6	474618	474623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699642
10010	NC_016857	GA	3	6	474666	474671	50 %	0 %	50 %	0 %	379699642
10011	NC_016857	GT	3	6	474686	474691	0 %	50 %	50 %	0 %	379699642
10012	NC_016857	CGAT	2	8	474720	474727	25 %	25 %	25 %	25 %	379699642
10013	NC_016857	AGTAG	2	10	474797	474806	40 %	20 %	40 %	0 %	379699642
10014	NC_016857	ACG	2	6	474813	474818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699642
10015	NC_016857	GCC	2	6	474827	474832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699642
10016	NC_016857	GCG	2	6	474846	474851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699642
10017	NC_016857	TGC	2	6	474864	474869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699642
10018	NC_016857	CCA	2	6	474919	474924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379699642
10019	NC_016857	GGC	2	6	474977	474982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699642
10020	NC_016857	CA	3	6	474988	474993	50 %	0 %	0 %	50 %	379699642
10021	NC_016857	CCG	2	6	475029	475034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699642
10022	NC_016857	TTC	2	6	475176	475181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699642
10023	NC_016857	TTC	2	6	475286	475291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699642
10024	NC_016857	T	6	6	475338	475343	0 %	100 %	0 %	0 %	379699642
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10028	NC_016857	CGG	2	6	475507	475512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699642
10029	NC_016857	CA	3	6	475532	475537	50 %	0 %	0 %	50 %	379699642
10030	NC_016857	GCG	2	6	475544	475549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699642
10031	NC_016857	CTT	2	6	475558	475563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699642
10032	NC_016857	CCG	2	6	475567	475572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699642
10033	NC_016857	ATACCG	2	12	475581	475592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379699642
10034	NC_016857	TGGAGG	2	12	475600	475611	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	379699642
10035	NC_016857	CGA	2	6	475704	475709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379699642
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10039	NC_016857	CT	3	6	475899	475904	0 %	50 %	0 %	50 %	379699642
10040	NC_016857	AGGGT	2	10	475947	475956	20 %	20 %	60 %	0 %	379699642
10041	NC_016857	TTTA	2	8	476001	476008	25 %	75 %	0 %	0 %	379699643
10042	NC_016857	GGTA	2	8	476151	476158	25 %	25 %	50 %	0 %	379699643
10043	NC_016857	GCT	2	6	476169	476174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699643
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10047	NC_016857	CGG	2	6	476334	476339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699643
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10049	NC_016857	GCC	2	6	476411	476416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699643
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10052	NC_016857	CGATCG	2	12	476489	476500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379699643
10053	NC_016857	ATCGTC	2	12	476623	476634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379699643
10054	NC_016857	GTC	2	6	476647	476652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699643
10055	NC_016857	CCG	2	6	476685	476690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699643
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10057	NC_016857	GCT	2	6	476883	476888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699643
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10062	NC_016857	CGC	2	6	477060	477065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699644
10063	NC_016857	GCTC	2	8	477093	477100	0 %	25 %	25 %	50 %	379699644
10064	NC_016857	GGCG	2	8	477118	477125	0 %	0 %	75 %	25 %	379699644
10065	NC_016857	TTC	2	6	477134	477139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379699644
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10068	NC_016857	GTGATA	2	12	477249	477260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10070	NC_016857	GCC	2	6	477348	477353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_016857	TGCG	2	8	477675	477682	0 %	25 %	50 %	25 %	379699645
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10074	NC_016857	TGGAAG	2	12	477808	477819	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379699645
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10086	NC_016857	CCAG	2	8	478234	478241	25 %	0 %	25 %	50 %	379699645
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10088	NC_016857	GAA	3	9	478440	478448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379699645
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10101	NC_016857	GCGCC	2	10	478926	478935	0 %	0 %	40 %	60 %	379699646
10102	NC_016857	CGGT	2	8	478952	478959	0 %	25 %	50 %	25 %	379699646
10103	NC_016857	CGT	2	6	478984	478989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699646
10104	NC_016857	CGG	2	6	478996	479001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699646
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10109	NC_016857	CGG	2	6	479154	479159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379699646
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10115	NC_016857	GCC	2	6	479671	479676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379699647
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10121	NC_016857	TCA	2	6	480092	480097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379699647
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10484	NC_016857	CGT	2	6	496061	496066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379699662
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