MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_016856	AGC	3	9	861478	861486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449154
18502	NC_016856	TGA	2	6	861505	861510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449154
18503	NC_016856	GAT	2	6	861522	861527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449154
18504	NC_016856	CAA	2	6	861557	861562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378449155
18505	NC_016856	CGA	2	6	861568	861573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18506	NC_016856	GCC	2	6	861609	861614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449155
18507	NC_016856	GCTG	2	8	861642	861649	0 %	25 %	50 %	25 %	378449155
18508	NC_016856	ATT	2	6	861719	861724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449155
18509	NC_016856	GCG	2	6	861765	861770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449155
18510	NC_016856	AGG	2	6	861816	861821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378449155
18511	NC_016856	CG	3	6	861848	861853	0 %	0 %	50 %	50 %	378449155
18512	NC_016856	CTG	2	6	861854	861859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18513	NC_016856	GCG	2	6	861875	861880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449155
18514	NC_016856	A	8	8	861908	861915	100 %	0 %	0 %	0 %	378449155
18515	NC_016856	CTG	2	6	861953	861958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18516	NC_016856	CGC	2	6	861989	861994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449155
18517	NC_016856	GCA	2	6	862012	862017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18518	NC_016856	TGG	2	6	862059	862064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449155
18519	NC_016856	GC	3	6	862098	862103	0 %	0 %	50 %	50 %	378449155
18520	NC_016856	CAT	2	6	862136	862141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449155
18521	NC_016856	GTTG	2	8	862150	862157	0 %	50 %	50 %	0 %	378449155
18522	NC_016856	ATG	2	6	862158	862163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449155
18523	NC_016856	GGGGC	2	10	862192	862201	0 %	0 %	80 %	20 %	378449155
18524	NC_016856	CTG	2	6	862204	862209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18525	NC_016856	G	6	6	862215	862220	0 %	0 %	100 %	0 %	378449155
18526	NC_016856	TGG	2	6	862236	862241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449155
18527	NC_016856	GCG	2	6	862269	862274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449155
18528	NC_016856	TGCTC	2	10	862281	862290	0 %	40 %	20 %	40 %	378449155
18529	NC_016856	CTG	2	6	862310	862315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18530	NC_016856	GCC	2	6	862351	862356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449155
18531	NC_016856	CAGGCG	2	12	862361	862372	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378449155
18532	NC_016856	GGT	2	6	862409	862414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449155
18533	NC_016856	CGC	2	6	862432	862437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449155
18534	NC_016856	CAA	2	6	862565	862570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378449155
18535	NC_016856	CGCC	2	8	862592	862599	0 %	0 %	25 %	75 %	378449155
18536	NC_016856	GC	3	6	862619	862624	0 %	0 %	50 %	50 %	378449155
18537	NC_016856	TTAACG	2	12	862631	862642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378449155
18538	NC_016856	CTG	2	6	862673	862678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18539	NC_016856	TGC	2	6	862683	862688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449155
18540	NC_016856	GCG	3	9	862716	862724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449156
18541	NC_016856	GGCCG	2	10	862728	862737	0 %	0 %	60 %	40 %	378449156
18542	NC_016856	GCA	2	6	862766	862771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449156
18543	NC_016856	GCT	2	6	862787	862792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449156
18544	NC_016856	GCC	2	6	862807	862812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449156
18545	NC_016856	GT	3	6	862822	862827	0 %	50 %	50 %	0 %	378449156
18546	NC_016856	TGC	2	6	862915	862920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449156
18547	NC_016856	GGC	2	6	862940	862945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449156
18548	NC_016856	CCTGG	2	10	863003	863012	0 %	20 %	40 %	40 %	378449156
18549	NC_016856	GTG	2	6	863030	863035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449156
18550	NC_016856	CGG	2	6	863084	863089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449156
18551	NC_016856	GTG	2	6	863091	863096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449156
18552	NC_016856	ACC	2	6	863103	863108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449156
18553	NC_016856	GGCG	2	8	863221	863228	0 %	0 %	75 %	25 %	378449156
18554	NC_016856	TACTGA	2	12	863463	863474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378449157
18555	NC_016856	CAG	2	6	863622	863627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449157
18556	NC_016856	CGA	2	6	863700	863705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449157
18557	NC_016856	CGG	2	6	863723	863728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449157
18558	NC_016856	GCAG	2	8	863760	863767	25 %	0 %	50 %	25 %	378449157
18559	NC_016856	GCGG	2	8	863788	863795	0 %	0 %	75 %	25 %	378449157
18560	NC_016856	CT	3	6	863809	863814	0 %	50 %	0 %	50 %	378449157
18561	NC_016856	AGC	2	6	863849	863854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449157
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18564	NC_016856	GCC	2	6	863973	863978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449157
18565	NC_016856	GC	3	6	863981	863986	0 %	0 %	50 %	50 %	378449157
18566	NC_016856	CGC	2	6	864013	864018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449157
18567	NC_016856	GGC	2	6	864075	864080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449157
18568	NC_016856	GACAG	2	10	864081	864090	40 %	0 %	40 %	20 %	378449157
18569	NC_016856	CTT	2	6	864141	864146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18570	NC_016856	CTG	2	6	864163	864168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18571	NC_016856	T	6	6	864169	864174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18572	NC_016856	AAT	2	6	864257	864262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449158
18573	NC_016856	T	9	9	864282	864290	0 %	100 %	0 %	0 %	378449158
18574	NC_016856	GGC	2	6	864327	864332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449158
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18576	NC_016856	AAGG	2	8	864508	864515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18577	NC_016856	TCA	2	6	864538	864543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18579	NC_016856	CTG	2	6	864595	864600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449159
18580	NC_016856	T	6	6	864686	864691	0 %	100 %	0 %	0 %	378449159
18581	NC_016856	T	6	6	864701	864706	0 %	100 %	0 %	0 %	378449159
18582	NC_016856	CGT	2	6	864837	864842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449160
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18586	NC_016856	ACT	2	6	865054	865059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449160
18587	NC_016856	GTG	3	9	865182	865190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449160
18588	NC_016856	ATG	2	6	865242	865247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449160
18589	NC_016856	GC	3	6	865280	865285	0 %	0 %	50 %	50 %	378449160
18590	NC_016856	GCG	2	6	865360	865365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449160
18591	NC_016856	GAC	2	6	865395	865400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449160
18592	NC_016856	TGA	2	6	865424	865429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449160
18593	NC_016856	CTAT	2	8	865498	865505	25 %	50 %	0 %	25 %	378449160
18594	NC_016856	CGC	2	6	865525	865530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449160
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18596	NC_016856	GCT	2	6	865610	865615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449160
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18599	NC_016856	CGGGC	2	10	865721	865730	0 %	0 %	60 %	40 %	378449160
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18602	NC_016856	CTG	2	6	865773	865778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449160
18603	NC_016856	TGA	2	6	865784	865789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449160
18604	NC_016856	GC	3	6	865839	865844	0 %	0 %	50 %	50 %	378449160
18605	NC_016856	GAG	2	6	865911	865916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378449160
18606	NC_016856	CTAT	2	8	865939	865946	25 %	50 %	0 %	25 %	378449160
18607	NC_016856	TGA	2	6	865988	865993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449160
18608	NC_016856	GGT	2	6	865994	865999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449160
18609	NC_016856	CGAC	2	8	866013	866020	25 %	0 %	25 %	50 %	378449160
18610	NC_016856	GCT	2	6	866024	866029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449160
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18614	NC_016856	ATC	2	6	866235	866240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449160
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18618	NC_016856	GC	3	6	866393	866398	0 %	0 %	50 %	50 %	378449160
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18984	NC_016856	TTCA	2	8	884111	884118	25 %	50 %	0 %	25 %	378449182
18985	NC_016856	CAG	2	6	884120	884125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449182
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18987	NC_016856	CGCC	2	8	884188	884195	0 %	0 %	25 %	75 %	378449182
18988	NC_016856	CAACGC	2	12	884239	884250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378449182
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18991	NC_016856	CAA	2	6	884378	884383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378449182
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