MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

< Previous12...3233343536373839404142...205206Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016856	GGT	2	6	837889	837894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378449133
18003	NC_016856	CAT	2	6	837901	837906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449133
18004	NC_016856	GCC	2	6	837938	837943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449133
18005	NC_016856	TGGT	2	8	838196	838203	0 %	50 %	50 %	0 %	378449133
18006	NC_016856	TCA	2	6	838322	838327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449133
18007	NC_016856	AAT	2	6	838340	838345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449133
18008	NC_016856	GCG	2	6	838378	838383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449133
18009	NC_016856	CCG	2	6	838403	838408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449133
18010	NC_016856	AGA	2	6	838607	838612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378449133
18011	NC_016856	ACC	2	6	838637	838642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449133
18012	NC_016856	CATA	2	8	838744	838751	50 %	25 %	0 %	25 %	378449134
18013	NC_016856	ACA	2	6	838840	838845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378449134
18014	NC_016856	GCC	3	9	838857	838865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449134
18015	NC_016856	CGC	2	6	838877	838882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449134
18016	NC_016856	ATC	2	6	838950	838955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449134
18017	NC_016856	GC	3	6	839018	839023	0 %	0 %	50 %	50 %	378449134
18018	NC_016856	GC	3	6	839040	839045	0 %	0 %	50 %	50 %	378449134
18019	NC_016856	GCT	2	6	839144	839149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449134
18020	NC_016856	GAA	2	6	839151	839156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378449134
18021	NC_016856	CGG	2	6	839182	839187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449134
18022	NC_016856	TAT	2	6	839189	839194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378449134
18023	NC_016856	CCA	2	6	839204	839209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449134
18024	NC_016856	TGA	2	6	839231	839236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449134
18025	NC_016856	CAC	2	6	839238	839243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449134
18026	NC_016856	CAAT	2	8	839290	839297	50 %	25 %	0 %	25 %	378449134
18027	NC_016856	CAG	2	6	839298	839303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449134
18028	NC_016856	T	6	6	839313	839318	0 %	100 %	0 %	0 %	378449134
18029	NC_016856	GC	3	6	839405	839410	0 %	0 %	50 %	50 %	378449134
18030	NC_016856	GCT	2	6	839432	839437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449134
18031	NC_016856	GGA	2	6	839472	839477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378449134
18032	NC_016856	TGA	2	6	839510	839515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378449134
18033	NC_016856	CGC	2	6	839525	839530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449134
18034	NC_016856	GTT	2	6	839538	839543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449134
18035	NC_016856	GCT	2	6	839546	839551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449134
18036	NC_016856	CGC	2	6	839567	839572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449134
18037	NC_016856	CTG	2	6	839589	839594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449134
18038	NC_016856	CGG	2	6	839654	839659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449134
18039	NC_016856	GTACG	2	10	839669	839678	20 %	20 %	40 %	20 %	378449134
18040	NC_016856	TCG	2	6	839680	839685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449134
18041	NC_016856	CG	3	6	839684	839689	0 %	0 %	50 %	50 %	378449134
18042	NC_016856	CAT	2	6	839741	839746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449134
18043	NC_016856	GC	4	8	839834	839841	0 %	0 %	50 %	50 %	378449134
18044	NC_016856	CG	3	6	839900	839905	0 %	0 %	50 %	50 %	378449135
18045	NC_016856	ACGG	2	8	839981	839988	25 %	0 %	50 %	25 %	378449135
18046	NC_016856	GCA	2	6	839998	840003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449135
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18048	NC_016856	GTGC	2	8	840019	840026	0 %	25 %	50 %	25 %	378449135
18049	NC_016856	TTC	2	6	840044	840049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378449135
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18051	NC_016856	GGAA	2	8	840088	840095	50 %	0 %	50 %	0 %	378449135
18052	NC_016856	CGCCAG	2	12	840137	840148	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378449135
18053	NC_016856	AG	3	6	840147	840152	50 %	0 %	50 %	0 %	378449135
18054	NC_016856	GCT	2	6	840157	840162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449135
18055	NC_016856	CGC	2	6	840227	840232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449135
18056	NC_016856	CAC	2	6	840242	840247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449135
18057	NC_016856	GCCA	2	8	840249	840256	25 %	0 %	25 %	50 %	378449135
18058	NC_016856	CCA	2	6	840313	840318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449135
18059	NC_016856	GCT	2	6	840331	840336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378449135
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18063	NC_016856	CG	4	8	840601	840608	0 %	0 %	50 %	50 %	378449135
18064	NC_016856	CA	3	6	840745	840750	50 %	0 %	0 %	50 %	378449135
18065	NC_016856	GCA	2	6	840775	840780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449135
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18069	NC_016856	TGCCAG	2	12	840952	840963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378449136
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18071	NC_016856	TAAT	2	8	841081	841088	50 %	50 %	0 %	0 %	378449136
18072	NC_016856	ACG	2	6	841204	841209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449136
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18074	NC_016856	GCGA	2	8	841291	841298	25 %	0 %	50 %	25 %	378449136
18075	NC_016856	CGA	2	6	841303	841308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449136
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18085	NC_016856	GCA	2	6	841874	841879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449136
18086	NC_016856	ACC	2	6	841914	841919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378449136
18087	NC_016856	TATGG	2	10	841956	841965	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_016856	TAA	2	6	842006	842011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_016856	AC	3	6	842028	842033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18091	NC_016856	A	7	7	842109	842115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_016856	ACGG	2	8	842141	842148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18093	NC_016856	T	6	6	842166	842171	0 %	100 %	0 %	0 %	378449137
18094	NC_016856	CGA	2	6	842207	842212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449137
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18096	NC_016856	GCG	2	6	842305	842310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449137
18097	NC_016856	AGCGT	2	10	842352	842361	20 %	20 %	40 %	20 %	378449137
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18099	NC_016856	TTCA	2	8	842502	842509	25 %	50 %	0 %	25 %	378449137
18100	NC_016856	GGC	2	6	842538	842543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378449137
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18103	NC_016856	AAT	2	6	842598	842603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449137
18104	NC_016856	CTT	2	6	842645	842650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378449137
18105	NC_016856	T	6	6	842695	842700	0 %	100 %	0 %	0 %	378449137
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18109	NC_016856	CATT	2	8	842753	842760	25 %	50 %	0 %	25 %	378449137
18110	NC_016856	CCG	2	6	842828	842833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378449137
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18121	NC_016856	ATA	2	6	843230	843235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378449138
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18239	NC_016856	GC	3	6	848773	848778	0 %	0 %	50 %	50 %	378449145
18240	NC_016856	CG	3	6	848907	848912	0 %	0 %	50 %	50 %	378449145
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18243	NC_016856	ACG	2	6	848993	848998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449145
18244	NC_016856	TCA	2	6	849029	849034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449145
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18246	NC_016856	ATCA	2	8	849073	849080	50 %	25 %	0 %	25 %	378449145
18247	NC_016856	GCA	2	6	849160	849165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378449145
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18252	NC_016856	TAA	2	6	849378	849383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18281	NC_016856	ACT	2	6	850679	850684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449147
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18354	NC_016856	A	7	7	854453	854459	100 %	0 %	0 %	0 %	378449150
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18488	NC_016856	TGT	2	6	860644	860649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378449154
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18490	NC_016856	GGA	2	6	860815	860820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378449154
18491	NC_016856	TAC	2	6	860955	860960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449154
18492	NC_016856	ATC	2	6	861000	861005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378449154
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