MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016856	TGA	2	6	45790	45795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448321
1002	NC_016856	GCT	2	6	45871	45876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448321
1003	NC_016856	TAC	2	6	45941	45946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448321
1004	NC_016856	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	378448321
1005	NC_016856	ATC	2	6	46034	46039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_016856	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_016856	A	6	6	46056	46061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016856	A	6	6	46090	46095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016856	TCA	2	6	46104	46109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016856	TA	3	6	46110	46115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016856	TAG	2	6	46150	46155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016856	GAA	2	6	46160	46165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_016856	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016856	T	6	6	46208	46213	0 %	100 %	0 %	0 %	378448322
1015	NC_016856	AGC	2	6	46214	46219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448322
1016	NC_016856	CAT	2	6	46234	46239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448322
1017	NC_016856	TCA	2	6	46242	46247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448322
1018	NC_016856	CGC	2	6	46249	46254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448322
1019	NC_016856	CAA	2	6	46354	46359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448322
1020	NC_016856	TGT	2	6	46368	46373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448322
1021	NC_016856	GCC	2	6	46487	46492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448322
1022	NC_016856	CGG	2	6	46495	46500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448322
1023	NC_016856	GAT	2	6	46501	46506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448322
1024	NC_016856	ACT	2	6	46536	46541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448322
1025	NC_016856	GGGCT	2	10	46561	46570	0 %	20 %	60 %	20 %	378448322
1026	NC_016856	ATC	2	6	46670	46675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448322
1027	NC_016856	GAT	2	6	46676	46681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448322
1028	NC_016856	TTA	2	6	46695	46700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448322
1029	NC_016856	GGC	2	6	46747	46752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448322
1030	NC_016856	GCT	2	6	46774	46779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448322
1031	NC_016856	GCG	2	6	46788	46793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448322
1032	NC_016856	TA	3	6	46809	46814	50 %	50 %	0 %	0 %	378448322
1033	NC_016856	CGG	2	6	46839	46844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448322
1034	NC_016856	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	378448322
1035	NC_016856	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	378448322
1036	NC_016856	TGC	2	6	47049	47054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448322
1037	NC_016856	ATT	2	6	47063	47068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448322
1038	NC_016856	CTG	2	6	47075	47080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448322
1039	NC_016856	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	378448322
1040	NC_016856	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	378448322
1041	NC_016856	TTA	2	6	47259	47264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448322
1042	NC_016856	GTG	2	6	47309	47314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448322
1043	NC_016856	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	378448322
1044	NC_016856	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016856	TAT	2	6	47451	47456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448323
1046	NC_016856	AAG	2	6	47473	47478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448323
1047	NC_016856	CGC	2	6	47515	47520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448323
1048	NC_016856	TGT	2	6	47701	47706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448323
1049	NC_016856	CAG	2	6	47747	47752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448323
1050	NC_016856	GCG	2	6	47763	47768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448323
1051	NC_016856	GTG	3	9	47769	47777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448323
1052	NC_016856	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	378448323
1053	NC_016856	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	378448323
1054	NC_016856	GCA	2	6	47888	47893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448323
1055	NC_016856	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	378448323
1056	NC_016856	GTT	2	6	48035	48040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448323
1057	NC_016856	TGA	2	6	48089	48094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448323
1058	NC_016856	GAA	2	6	48219	48224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448323
1059	NC_016856	GA	3	6	48243	48248	50 %	0 %	50 %	0 %	378448323
1060	NC_016856	CGG	2	6	48262	48267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448323
1061	NC_016856	ACT	2	6	48289	48294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448323
1062	NC_016856	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_016856	CAG	2	6	48381	48386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448324
1064	NC_016856	GCGTA	2	10	48437	48446	20 %	20 %	40 %	20 %	378448324
1065	NC_016856	CCT	2	6	48460	48465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448324
1066	NC_016856	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	378448324
1067	NC_016856	CAG	2	6	48561	48566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448324
1068	NC_016856	TCC	2	6	48670	48675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448324
1069	NC_016856	CCA	2	6	48928	48933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448324
1070	NC_016856	CCG	2	6	48940	48945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448324
1071	NC_016856	CGT	2	6	48951	48956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448324
1072	NC_016856	CCA	2	6	48957	48962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448324
1073	NC_016856	GCA	2	6	48994	48999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448324
1074	NC_016856	GAG	2	6	49024	49029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448324
1075	NC_016856	GACCA	2	10	49042	49051	40 %	0 %	20 %	40 %	378448324
1076	NC_016856	A	6	6	49134	49139	100 %	0 %	0 %	0 %	378448324
1077	NC_016856	CCGGC	2	10	49184	49193	0 %	0 %	40 %	60 %	378448324
1078	NC_016856	GTCGTA	2	12	49209	49220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378448324
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1080	NC_016856	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	378448324
1081	NC_016856	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	378448324
1082	NC_016856	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	378448324
1083	NC_016856	AAG	2	6	49564	49569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448324
1084	NC_016856	GCG	2	6	49599	49604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448324
1085	NC_016856	CAG	2	6	49626	49631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448324
1086	NC_016856	CAT	2	6	49689	49694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448324
1087	NC_016856	CGG	2	6	49695	49700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448324
1088	NC_016856	AGT	2	6	49763	49768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448324
1089	NC_016856	GTT	2	6	49839	49844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448324
1090	NC_016856	T	6	6	49973	49978	0 %	100 %	0 %	0 %	378448324
1091	NC_016856	GAT	2	6	50083	50088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448324
1092	NC_016856	TG	3	6	50141	50146	0 %	50 %	50 %	0 %	378448324
1093	NC_016856	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	378448324
1094	NC_016856	TGG	2	6	50218	50223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448324
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1096	NC_016856	CAGAC	2	10	50374	50383	40 %	0 %	20 %	40 %	378448324
1097	NC_016856	TTG	2	6	50394	50399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448324
1098	NC_016856	TGG	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448324
1099	NC_016856	TCT	2	6	50483	50488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448325
1100	NC_016856	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	378448325
1101	NC_016856	AGT	2	6	50518	50523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448325
1102	NC_016856	GCA	2	6	50593	50598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448325
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1104	NC_016856	GGC	2	6	50820	50825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448325
1105	NC_016856	TGT	2	6	50840	50845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448325
1106	NC_016856	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	378448325
1107	NC_016856	CAT	2	6	50859	50864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448325
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1109	NC_016856	CAG	2	6	50886	50891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1110	NC_016856	AAG	2	6	50932	50937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448325
1111	NC_016856	GAT	2	6	50946	50951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448325
1112	NC_016856	TCG	2	6	50966	50971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448325
1113	NC_016856	ATA	2	6	51024	51029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448325
1114	NC_016856	GCT	2	6	51047	51052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448325
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1116	NC_016856	CGC	2	6	51117	51122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448325
1117	NC_016856	T	7	7	51128	51134	0 %	100 %	0 %	0 %	378448325
1118	NC_016856	GC	3	6	51209	51214	0 %	0 %	50 %	50 %	378448325
1119	NC_016856	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	378448325
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1122	NC_016856	TAA	2	6	51312	51317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448325
1123	NC_016856	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	378448325
1124	NC_016856	TCA	2	6	51383	51388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448325
1125	NC_016856	GTG	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448325
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1127	NC_016856	GC	3	6	51509	51514	0 %	0 %	50 %	50 %	378448325
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1249	NC_016856	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	378448332
1250	NC_016856	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448332
1251	NC_016856	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448332
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1487	NC_016856	TAA	2	6	68437	68442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_016856	AGA	2	6	69188	69193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448343

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