MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016856	GATATG	2	12	656946	656957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448942
14002	NC_016856	TTC	2	6	657012	657017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448942
14003	NC_016856	CAG	2	6	657108	657113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14004	NC_016856	CAG	2	6	657123	657128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14005	NC_016856	TGG	2	6	657169	657174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448942
14006	NC_016856	CGT	2	6	657202	657207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14007	NC_016856	AGC	2	6	657253	657258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14008	NC_016856	TGACGG	2	12	657292	657303	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448942
14009	NC_016856	CG	3	6	657351	657356	0 %	0 %	50 %	50 %	378448942
14010	NC_016856	CGCCA	2	10	657368	657377	20 %	0 %	20 %	60 %	378448942
14011	NC_016856	GTG	2	6	657390	657395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448942
14012	NC_016856	GATA	2	8	657407	657414	50 %	25 %	25 %	0 %	378448942
14013	NC_016856	CAC	2	6	657416	657421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448942
14014	NC_016856	AGTT	2	8	657476	657483	25 %	50 %	25 %	0 %	378448942
14015	NC_016856	GGC	2	6	657510	657515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448942
14016	NC_016856	CTG	2	6	657519	657524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14017	NC_016856	TGC	2	6	657541	657546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14018	NC_016856	CTG	2	6	657642	657647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14019	NC_016856	GCA	2	6	657715	657720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14020	NC_016856	CAC	2	6	657755	657760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448942
14021	NC_016856	CTG	2	6	657837	657842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448942
14022	NC_016856	TCA	2	6	657872	657877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448942
14023	NC_016856	GGC	2	6	657930	657935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448942
14024	NC_016856	CT	3	6	658089	658094	0 %	50 %	0 %	50 %	378448942
14025	NC_016856	GAT	2	6	658130	658135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448943
14026	NC_016856	CCG	2	6	658172	658177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448943
14027	NC_016856	CGG	2	6	658252	658257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14028	NC_016856	GC	3	6	658271	658276	0 %	0 %	50 %	50 %	378448943
14029	NC_016856	GGA	2	6	658538	658543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448943
14030	NC_016856	GTG	2	6	658584	658589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448943
14031	NC_016856	ACG	3	9	658600	658608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14032	NC_016856	GGC	2	6	658640	658645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14033	NC_016856	CTG	2	6	658672	658677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14034	NC_016856	CGG	2	6	658703	658708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14035	NC_016856	TAC	2	6	658709	658714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448943
14036	NC_016856	TAC	2	6	658755	658760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448943
14037	NC_016856	GCA	2	6	658771	658776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14038	NC_016856	CGC	2	6	658826	658831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448943
14039	NC_016856	GC	3	6	658858	658863	0 %	0 %	50 %	50 %	378448943
14040	NC_016856	TCTT	2	8	658870	658877	0 %	75 %	0 %	25 %	378448943
14041	NC_016856	GCC	2	6	658970	658975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448943
14042	NC_016856	GGC	2	6	659013	659018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14043	NC_016856	CGG	2	6	659054	659059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14044	NC_016856	CG	3	6	659060	659065	0 %	0 %	50 %	50 %	378448943
14045	NC_016856	GCC	2	6	659082	659087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448943
14046	NC_016856	GCA	2	6	659117	659122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14047	NC_016856	GAC	2	6	659217	659222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14048	NC_016856	GTGG	2	8	659228	659235	0 %	25 %	75 %	0 %	378448943
14049	NC_016856	GCC	2	6	659258	659263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448943
14050	NC_016856	GTC	2	6	659275	659280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14051	NC_016856	TGA	2	6	659281	659286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448943
14052	NC_016856	CG	3	6	659287	659292	0 %	0 %	50 %	50 %	378448943
14053	NC_016856	GATCT	2	10	659376	659385	20 %	40 %	20 %	20 %	378448943
14054	NC_016856	AGATC	2	10	659429	659438	40 %	20 %	20 %	20 %	378448943
14055	NC_016856	GCG	2	6	659446	659451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14056	NC_016856	AGA	2	6	659452	659457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448943
14057	NC_016856	GCC	2	6	659460	659465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448943
14058	NC_016856	GGT	2	6	659498	659503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448943
14059	NC_016856	GCG	2	6	659511	659516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448943
14060	NC_016856	CTG	2	6	659538	659543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448943
14061	NC_016856	A	6	6	659548	659553	100 %	0 %	0 %	0 %	378448943
14062	NC_016856	TGG	2	6	659566	659571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448943
14063	NC_016856	TGCGT	2	10	659658	659667	0 %	40 %	40 %	20 %	378448943
14064	NC_016856	A	6	6	659700	659705	100 %	0 %	0 %	0 %	378448943
14065	NC_016856	AG	3	6	659752	659757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14068	NC_016856	GCT	2	6	659853	659858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448944
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14071	NC_016856	CAT	2	6	659965	659970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448944
14072	NC_016856	CG	3	6	660019	660024	0 %	0 %	50 %	50 %	378448944
14073	NC_016856	CAG	2	6	660070	660075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448944
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14085	NC_016856	ATG	2	6	660499	660504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448944
14086	NC_016856	GC	3	6	660514	660519	0 %	0 %	50 %	50 %	378448944
14087	NC_016856	TGG	2	6	660583	660588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448944
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14089	NC_016856	CGGGG	2	10	660656	660665	0 %	0 %	80 %	20 %	378448945
14090	NC_016856	GT	3	6	660817	660822	0 %	50 %	50 %	0 %	378448945
14091	NC_016856	A	6	6	660826	660831	100 %	0 %	0 %	0 %	378448945
14092	NC_016856	CGC	2	6	660857	660862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448945
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14100	NC_016856	CAG	2	6	661200	661205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448945
14101	NC_016856	GCCA	2	8	661311	661318	25 %	0 %	25 %	50 %	378448945
14102	NC_016856	GTG	2	6	661338	661343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448945
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14111	NC_016856	GGC	2	6	661695	661700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448946
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14115	NC_016856	GAA	2	6	661821	661826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_016856	TGTAA	2	10	661848	661857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_016856	A	6	6	661856	661861	100 %	0 %	0 %	0 %	378448947
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14119	NC_016856	GTT	2	6	661894	661899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448947
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14126	NC_016856	GGC	2	6	662288	662293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448948
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14222	NC_016856	CG	3	6	666449	666454	0 %	0 %	50 %	50 %	378448951
14223	NC_016856	A	6	6	666473	666478	100 %	0 %	0 %	0 %	378448951
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14232	NC_016856	CG	5	10	666931	666940	0 %	0 %	50 %	50 %	378448952
14233	NC_016856	GCC	2	6	666957	666962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448952
14234	NC_016856	CTC	2	6	667082	667087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448952
14235	NC_016856	ACC	2	6	667101	667106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448952
14236	NC_016856	AGC	2	6	667146	667151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448952
14237	NC_016856	T	6	6	667154	667159	0 %	100 %	0 %	0 %	378448952
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