MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_016856	GCGATG	2	12	635934	635945	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448920
13503	NC_016856	GCG	2	6	635964	635969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448920
13504	NC_016856	AGCCC	2	10	635977	635986	20 %	0 %	20 %	60 %	378448920
13505	NC_016856	TGC	2	6	636004	636009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448920
13506	NC_016856	CAT	2	6	636014	636019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448920
13507	NC_016856	TAA	2	6	636082	636087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448920
13508	NC_016856	CGG	2	6	636118	636123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448920
13509	NC_016856	AGC	2	6	636177	636182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448920
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13512	NC_016856	CAGAC	2	10	636489	636498	40 %	0 %	20 %	40 %	378448920
13513	NC_016856	ATC	2	6	636531	636536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448920
13514	NC_016856	AGC	2	6	636588	636593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448920
13515	NC_016856	CGG	2	6	636648	636653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448921
13516	NC_016856	CTG	2	6	636754	636759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448921
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13518	NC_016856	CGA	2	6	636819	636824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448921
13519	NC_016856	CGG	2	6	636837	636842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448921
13520	NC_016856	CAC	2	6	636853	636858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448921
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13529	NC_016856	TGG	2	6	637171	637176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448922
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13531	NC_016856	GCCA	2	8	637247	637254	25 %	0 %	25 %	50 %	378448922
13532	NC_016856	GTGACG	2	12	637265	637276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378448922
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13537	NC_016856	GCT	2	6	637387	637392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448922
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13539	NC_016856	TCG	2	6	637443	637448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448922
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13542	NC_016856	TGGC	2	8	637497	637504	0 %	25 %	50 %	25 %	378448922
13543	NC_016856	TTAT	2	8	637588	637595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_016856	A	6	6	637686	637691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_016856	ATG	2	6	637794	637799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448923
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13548	NC_016856	CAG	2	6	637920	637925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448923
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13551	NC_016856	CGA	2	6	638078	638083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448923
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13553	NC_016856	CCA	2	6	638129	638134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448923
13554	NC_016856	CGTT	2	8	638158	638165	0 %	50 %	25 %	25 %	378448923
13555	NC_016856	CG	3	6	638198	638203	0 %	0 %	50 %	50 %	378448923
13556	NC_016856	CTT	2	6	638210	638215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448923
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13561	NC_016856	TGGT	2	8	638385	638392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13564	NC_016856	CT	3	6	638496	638501	0 %	50 %	0 %	50 %	378448924
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13573	NC_016856	CG	4	8	638917	638924	0 %	0 %	50 %	50 %	378448925
13574	NC_016856	TTG	2	6	638935	638940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448925
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13584	NC_016856	GTCGC	2	10	639470	639479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13585	NC_016856	ACTC	2	8	639546	639553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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13587	NC_016856	TTA	2	6	639632	639637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448926
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13591	NC_016856	CGTG	2	8	639871	639878	0 %	25 %	50 %	25 %	378448927
13592	NC_016856	GGC	2	6	639895	639900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448927
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13599	NC_016856	AAACA	2	10	640136	640145	80 %	0 %	0 %	20 %	378448928
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13604	NC_016856	T	6	6	640471	640476	0 %	100 %	0 %	0 %	378448929
13605	NC_016856	GC	3	6	640522	640527	0 %	0 %	50 %	50 %	378448929
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13609	NC_016856	TA	3	6	640650	640655	50 %	50 %	0 %	0 %	378448929
13610	NC_016856	CAG	2	6	640696	640701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448929
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13615	NC_016856	A	6	6	640932	640937	100 %	0 %	0 %	0 %	378448929
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