MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_016856	ATGA	2	8	613163	613170	50 %	25 %	25 %	0 %	378448897
13003	NC_016856	TCCTT	2	10	613205	613214	0 %	60 %	0 %	40 %	378448897
13004	NC_016856	CCA	2	6	613232	613237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448897
13005	NC_016856	CTC	2	6	613242	613247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13006	NC_016856	ATG	2	6	613257	613262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016856	AT	3	6	613268	613273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016856	CAT	2	6	613307	613312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_016856	A	7	7	613325	613331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016856	ATT	2	6	613354	613359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_016856	TACT	2	8	613401	613408	25 %	50 %	0 %	25 %	378448898
13012	NC_016856	AT	3	6	613434	613439	50 %	50 %	0 %	0 %	378448898
13013	NC_016856	CTG	2	6	613448	613453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448898
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13015	NC_016856	GAAAGT	2	12	613515	613526	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378448898
13016	NC_016856	AGT	2	6	613612	613617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448898
13017	NC_016856	CAT	2	6	613696	613701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448898
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13021	NC_016856	CAGC	2	8	613821	613828	25 %	0 %	25 %	50 %	378448898
13022	NC_016856	ATC	3	9	613838	613846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448898
13023	NC_016856	TATC	2	8	613873	613880	25 %	50 %	0 %	25 %	378448898
13024	NC_016856	TCT	2	6	613881	613886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448898
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13029	NC_016856	A	7	7	613997	614003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13032	NC_016856	CTTCA	2	10	614238	614247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13033	NC_016856	GC	3	6	614321	614326	0 %	0 %	50 %	50 %	378448900
13034	NC_016856	CTT	2	6	614350	614355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448900
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13041	NC_016856	TC	3	6	614616	614621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_016856	ACG	2	6	614705	614710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13044	NC_016856	T	8	8	614858	614865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_016856	CGG	2	6	614910	614915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_016856	ATC	2	6	614927	614932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13048	NC_016856	CTT	2	6	614977	614982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_016856	GTA	2	6	615005	615010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13051	NC_016856	CT	3	6	615118	615123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_016856	TGG	2	6	615266	615271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13054	NC_016856	CTT	2	6	615394	615399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448901
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13056	NC_016856	TGG	2	6	615466	615471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13058	NC_016856	ATT	2	6	615505	615510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448902
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13091	NC_016856	TA	3	6	616707	616712	50 %	50 %	0 %	0 %	378448902
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13106	NC_016856	AAG	2	6	617397	617402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448903
13107	NC_016856	TTCC	2	8	617406	617413	0 %	50 %	0 %	50 %	378448903
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13118	NC_016856	AC	3	6	618335	618340	50 %	0 %	0 %	50 %	378448904
13119	NC_016856	CGAT	2	8	618383	618390	25 %	25 %	25 %	25 %	378448904
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13121	NC_016856	TTA	2	6	618526	618531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13123	NC_016856	AGT	2	6	618573	618578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13125	NC_016856	GTA	2	6	618662	618667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13127	NC_016856	GC	3	6	618743	618748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13128	NC_016856	GCG	3	9	618788	618796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_016856	CTC	2	6	618866	618871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13245	NC_016856	GCT	2	6	624489	624494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448911
13246	NC_016856	TGA	2	6	624534	624539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448911
13247	NC_016856	TGA	2	6	624552	624557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448911
13248	NC_016856	A	6	6	624640	624645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_016856	GC	3	6	624739	624744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13250	NC_016856	CTTTT	2	10	624748	624757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13251	NC_016856	T	7	7	624774	624780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13252	NC_016856	TAACGT	2	12	624787	624798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13253	NC_016856	GAA	2	6	624943	624948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448912
13254	NC_016856	GCG	2	6	625005	625010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448912
13255	NC_016856	TTG	2	6	625073	625078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448912
13256	NC_016856	CGG	2	6	625266	625271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448912
13257	NC_016856	GCG	3	9	625319	625327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448912
13258	NC_016856	T	6	6	625328	625333	0 %	100 %	0 %	0 %	378448912
13259	NC_016856	GCT	2	6	625447	625452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448912
13260	NC_016856	CGG	2	6	625465	625470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448912
13261	NC_016856	TTC	2	6	625511	625516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448912
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13263	NC_016856	GC	3	6	625607	625612	0 %	0 %	50 %	50 %	378448912
13264	NC_016856	A	6	6	625620	625625	100 %	0 %	0 %	0 %	378448912
13265	NC_016856	GGT	2	6	625648	625653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448912
13266	NC_016856	TGG	2	6	625686	625691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448912
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13270	NC_016856	GTCGC	2	10	625808	625817	0 %	20 %	40 %	40 %	378448912
13271	NC_016856	GCG	2	6	625833	625838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448912
13272	NC_016856	TGG	2	6	625965	625970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448912
13273	NC_016856	CG	3	6	626081	626086	0 %	0 %	50 %	50 %	378448912
13274	NC_016856	CGT	2	6	626093	626098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448912
13275	NC_016856	CCG	2	6	626136	626141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448912
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13277	NC_016856	T	6	6	626289	626294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13278	NC_016856	GC	3	6	626352	626357	0 %	0 %	50 %	50 %	378448913
13279	NC_016856	TGA	2	6	626381	626386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448913
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13281	NC_016856	ACG	2	6	626465	626470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448913
13282	NC_016856	TGG	2	6	626564	626569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448913
13283	NC_016856	GCG	2	6	626617	626622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448913
13284	NC_016856	GTT	2	6	626652	626657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448913
13285	NC_016856	TGA	2	6	626678	626683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448913
13286	NC_016856	TCA	3	9	626735	626743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448913
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13289	NC_016856	TGG	2	6	626862	626867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448913
13290	NC_016856	TAT	2	6	626874	626879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448913
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13292	NC_016856	CAG	2	6	627097	627102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448913
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13309	NC_016856	TC	3	6	627579	627584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13310	NC_016856	CAG	2	6	627594	627599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13316	NC_016856	CGT	2	6	627850	627855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13317	NC_016856	CAA	2	6	627862	627867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13318	NC_016856	CGCTGG	2	12	627927	627938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378448915
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13320	NC_016856	TAA	2	6	628006	628011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448915
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13325	NC_016856	ATA	2	6	628161	628166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448915
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13333	NC_016856	GCG	2	6	628442	628447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448915
13334	NC_016856	GCG	2	6	628463	628468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448915
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13346	NC_016856	CAG	2	6	629009	629014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448915
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13349	NC_016856	ATA	2	6	629118	629123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448915
13350	NC_016856	CTG	2	6	629165	629170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448915
13351	NC_016856	ATG	2	6	629226	629231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448915
13352	NC_016856	GCC	2	6	629246	629251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448915
13353	NC_016856	GACCG	2	10	629446	629455	20 %	0 %	40 %	40 %	378448915
13354	NC_016856	TGC	2	6	629457	629462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448915
13355	NC_016856	CAT	2	6	629596	629601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448915
13356	NC_016856	ATTA	2	8	629618	629625	50 %	50 %	0 %	0 %	378448915
13357	NC_016856	GAT	2	6	629642	629647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448915
13358	NC_016856	CGG	2	6	629662	629667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448915
13359	NC_016856	TGA	2	6	629855	629860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448915
13360	NC_016856	AGGG	2	8	629867	629874	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13361	NC_016856	CGTT	2	8	629882	629889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13362	NC_016856	AGTA	2	8	629933	629940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_016856	CGT	2	6	629969	629974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13364	NC_016856	GCA	2	6	630142	630147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448916
13365	NC_016856	TTA	2	6	630148	630153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448916
13366	NC_016856	TAA	2	6	630164	630169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448916
13367	NC_016856	AGC	2	6	630181	630186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448916
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13370	NC_016856	CGT	2	6	630240	630245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448916
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13372	NC_016856	GCT	2	6	630323	630328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448916
13373	NC_016856	GGC	2	6	630374	630379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448916
13374	NC_016856	TGC	3	9	630409	630417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448916
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13376	NC_016856	TAA	2	6	630536	630541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448916
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13378	NC_016856	CAGA	2	8	630598	630605	50 %	0 %	25 %	25 %	378448916
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13385	NC_016856	CTG	2	6	631101	631106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448916
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13392	NC_016856	GAG	2	6	631521	631526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448916
13393	NC_016856	CTG	2	6	631560	631565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448916
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13447	NC_016856	TAA	2	6	633925	633930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13485	NC_016856	CGA	2	6	635237	635242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448919
13486	NC_016856	CGA	2	6	635252	635257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448919
13487	NC_016856	GGT	2	6	635316	635321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448919
13488	NC_016856	CCCG	2	8	635323	635330	0 %	0 %	25 %	75 %	378448919
13489	NC_016856	TGC	2	6	635411	635416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448919
13490	NC_016856	CTG	2	6	635418	635423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448919
13491	NC_016856	CGG	2	6	635444	635449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448919
13492	NC_016856	AGA	2	6	635471	635476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448919
13493	NC_016856	TCC	3	9	635566	635574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448919
13494	NC_016856	GCG	2	6	635612	635617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448919
13495	NC_016856	GC	3	6	635650	635655	0 %	0 %	50 %	50 %	378448919
13496	NC_016856	CGG	2	6	635663	635668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448919
13497	NC_016856	TGC	2	6	635722	635727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448919
13498	NC_016856	CGT	2	6	635831	635836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448919
13499	NC_016856	TCACT	2	10	635852	635861	20 %	40 %	0 %	40 %	378448919
13500	NC_016856	CCT	2	6	635872	635877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448920

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