MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016856	GGT	2	6	542365	542370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448823
11502	NC_016856	GGC	3	9	542410	542418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11503	NC_016856	GC	3	6	542417	542422	0 %	0 %	50 %	50 %	378448823
11504	NC_016856	GCT	2	6	542440	542445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448823
11505	NC_016856	CTG	2	6	542462	542467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448823
11506	NC_016856	GGC	2	6	542518	542523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11507	NC_016856	TAT	2	6	542582	542587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448823
11508	NC_016856	GTT	2	6	542593	542598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448823
11509	NC_016856	CGG	2	6	542633	542638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11510	NC_016856	CGC	2	6	542709	542714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448823
11511	NC_016856	CGG	2	6	542742	542747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11512	NC_016856	CGC	3	9	542754	542762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448823
11513	NC_016856	GCA	2	6	542767	542772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448823
11514	NC_016856	CGC	2	6	542787	542792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448823
11515	NC_016856	GGC	2	6	542836	542841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11516	NC_016856	GC	3	6	542840	542845	0 %	0 %	50 %	50 %	378448823
11517	NC_016856	GC	4	8	542857	542864	0 %	0 %	50 %	50 %	378448823
11518	NC_016856	CAAAA	2	10	542875	542884	80 %	0 %	0 %	20 %	378448823
11519	NC_016856	A	6	6	542881	542886	100 %	0 %	0 %	0 %	378448823
11520	NC_016856	CG	4	8	542909	542916	0 %	0 %	50 %	50 %	378448823
11521	NC_016856	GC	3	6	542972	542977	0 %	0 %	50 %	50 %	378448823
11522	NC_016856	AAAG	2	8	543010	543017	75 %	0 %	25 %	0 %	378448823
11523	NC_016856	CCA	2	6	543036	543041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448823
11524	NC_016856	GTA	2	6	543047	543052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448823
11525	NC_016856	GTG	2	6	543065	543070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448823
11526	NC_016856	A	6	6	543108	543113	100 %	0 %	0 %	0 %	378448823
11527	NC_016856	GGC	2	6	543124	543129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11528	NC_016856	GGC	2	6	543136	543141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11529	NC_016856	GCG	2	6	543167	543172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11530	NC_016856	CTTT	2	8	543185	543192	0 %	75 %	0 %	25 %	378448823
11531	NC_016856	TGG	2	6	543201	543206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448823
11532	NC_016856	GCG	2	6	543294	543299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448823
11533	NC_016856	GCA	2	6	543301	543306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448823
11534	NC_016856	ACG	2	6	543341	543346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448823
11535	NC_016856	GAT	2	6	543368	543373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448823
11536	NC_016856	CGC	2	6	543390	543395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448823
11537	NC_016856	ATT	2	6	543449	543454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448823
11538	NC_016856	ATA	2	6	543459	543464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448823
11539	NC_016856	TTC	2	6	543485	543490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448823
11540	NC_016856	AG	3	6	543508	543513	50 %	0 %	50 %	0 %	378448823
11541	NC_016856	AG	5	10	543562	543571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_016856	TGA	2	6	543603	543608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448824
11543	NC_016856	CAG	2	6	543617	543622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448824
11544	NC_016856	A	6	6	543630	543635	100 %	0 %	0 %	0 %	378448824
11545	NC_016856	GC	3	6	543717	543722	0 %	0 %	50 %	50 %	378448824
11546	NC_016856	GCC	2	6	543729	543734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448824
11547	NC_016856	CTG	2	6	543755	543760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448824
11548	NC_016856	GCG	2	6	543812	543817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448824
11549	NC_016856	CGC	2	6	543818	543823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448824
11550	NC_016856	AGA	2	6	543843	543848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448824
11551	NC_016856	GCC	2	6	543877	543882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448824
11552	NC_016856	GCG	2	6	544016	544021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448825
11553	NC_016856	GTG	2	6	544156	544161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448825
11554	NC_016856	CGC	2	6	544241	544246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448825
11555	NC_016856	GAT	2	6	544264	544269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448825
11556	NC_016856	A	6	6	544307	544312	100 %	0 %	0 %	0 %	378448825
11557	NC_016856	GGC	2	6	544435	544440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448825
11558	NC_016856	ACG	2	6	544462	544467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448825
11559	NC_016856	ATT	2	6	544498	544503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448825
11560	NC_016856	GGC	2	6	544519	544524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_016856	TTG	2	6	544602	544607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448826
11562	NC_016856	TCAG	2	8	544646	544653	25 %	25 %	25 %	25 %	378448826
11563	NC_016856	TGA	2	6	544675	544680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448826
11564	NC_016856	GCG	2	6	544743	544748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448826
11565	NC_016856	TGA	2	6	544880	544885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448826
11566	NC_016856	CGTA	2	8	545033	545040	25 %	25 %	25 %	25 %	378448826
11567	NC_016856	AGGCGA	2	12	545090	545101	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378448826
11568	NC_016856	GAA	2	6	545259	545264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448826
11569	NC_016856	CAA	2	6	545300	545305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378448826
11570	NC_016856	GAC	2	6	545346	545351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11571	NC_016856	CTG	2	6	545448	545453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11572	NC_016856	GTAC	2	8	545516	545523	25 %	25 %	25 %	25 %	378448826
11573	NC_016856	TGAT	2	8	545590	545597	25 %	50 %	25 %	0 %	378448826
11574	NC_016856	GAC	2	6	545715	545720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11575	NC_016856	AAG	2	6	545767	545772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448826
11576	NC_016856	CGG	2	6	545776	545781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448826
11577	NC_016856	AAG	2	6	545890	545895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448826
11578	NC_016856	A	6	6	545902	545907	100 %	0 %	0 %	0 %	378448826
11579	NC_016856	CTA	2	6	545909	545914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448826
11580	NC_016856	GCG	3	9	545934	545942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448826
11581	NC_016856	CTG	2	6	545964	545969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11582	NC_016856	TGC	3	9	545989	545997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11583	NC_016856	CGA	2	6	546011	546016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11584	NC_016856	GAT	2	6	546020	546025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448826
11585	NC_016856	GTCG	2	8	546062	546069	0 %	25 %	50 %	25 %	378448826
11586	NC_016856	CGA	2	6	546110	546115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11587	NC_016856	AAG	2	6	546124	546129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448826
11588	NC_016856	CTG	2	6	546171	546176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11589	NC_016856	CAC	2	6	546236	546241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448826
11590	NC_016856	CGC	2	6	546281	546286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448826
11591	NC_016856	GCT	3	9	546401	546409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448826
11592	NC_016856	CCG	2	6	546464	546469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448826
11593	NC_016856	AGCGCC	2	12	546573	546584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_016856	T	6	6	546593	546598	0 %	100 %	0 %	0 %	378448827
11595	NC_016856	ATA	2	6	546599	546604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448827
11596	NC_016856	GGC	2	6	546649	546654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448827
11597	NC_016856	TGG	2	6	546676	546681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448827
11598	NC_016856	A	6	6	546700	546705	100 %	0 %	0 %	0 %	378448827
11599	NC_016856	TAT	2	6	546740	546745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448827
11600	NC_016856	TCA	2	6	546790	546795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448827
11601	NC_016856	TGC	2	6	546835	546840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448828
11602	NC_016856	GC	3	6	546839	546844	0 %	0 %	50 %	50 %	378448828
11603	NC_016856	CTG	2	6	546978	546983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448828
11604	NC_016856	AAG	2	6	547024	547029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448828
11605	NC_016856	GTC	2	6	547099	547104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448828
11606	NC_016856	CGC	2	6	547112	547117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448828
11607	NC_016856	CCG	2	6	547149	547154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448828
11608	NC_016856	ACC	2	6	547194	547199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448828
11609	NC_016856	TGG	2	6	547237	547242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448828
11610	NC_016856	ATC	2	6	547246	547251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448828
11611	NC_016856	CGC	2	6	547261	547266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448828
11612	NC_016856	CTA	2	6	547274	547279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448828
11613	NC_016856	AGAA	2	8	547282	547289	75 %	0 %	25 %	0 %	378448828
11614	NC_016856	GC	3	6	547349	547354	0 %	0 %	50 %	50 %	378448828
11615	NC_016856	A	6	6	547363	547368	100 %	0 %	0 %	0 %	378448828
11616	NC_016856	T	6	6	547380	547385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_016856	CTG	2	6	547410	547415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448829
11618	NC_016856	GGC	2	6	547467	547472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448829
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11982	NC_016856	TCA	2	6	563911	563916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448845
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11997	NC_016856	CAT	2	6	564542	564547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448845
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11999	NC_016856	GAT	2	6	564633	564638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12000	NC_016856	GAC	2	6	564665	564670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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