MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016856	GGC	2	6	474203	474208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448754
10002	NC_016856	GCGCC	2	10	474266	474275	0 %	0 %	40 %	60 %	378448754
10003	NC_016856	ATT	2	6	474291	474296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448755
10004	NC_016856	TTC	2	6	474397	474402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448755
10005	NC_016856	CGGCG	2	10	474421	474430	0 %	0 %	60 %	40 %	378448755
10006	NC_016856	AGC	2	6	474446	474451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448755
10007	NC_016856	GCCA	2	8	474499	474506	25 %	0 %	25 %	50 %	378448755
10008	NC_016856	CAT	2	6	474525	474530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448755
10009	NC_016856	CG	3	6	474618	474623	0 %	0 %	50 %	50 %	378448755
10010	NC_016856	GTT	2	6	474747	474752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448755
10011	NC_016856	AGCGCC	2	12	474758	474769	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378448755
10012	NC_016856	CGT	2	6	474834	474839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448755
10013	NC_016856	TCT	2	6	474857	474862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448755
10014	NC_016856	GTG	2	6	474869	474874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448755
10015	NC_016856	TCG	2	6	475005	475010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448755
10016	NC_016856	ACC	3	9	475013	475021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448755
10017	NC_016856	TCG	2	6	475022	475027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448755
10018	NC_016856	GC	3	6	475047	475052	0 %	0 %	50 %	50 %	378448755
10019	NC_016856	GCT	2	6	475069	475074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448755
10020	NC_016856	A	6	6	475102	475107	100 %	0 %	0 %	0 %	378448755
10021	NC_016856	GCC	2	6	475114	475119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448755
10022	NC_016856	GC	3	6	475127	475132	0 %	0 %	50 %	50 %	378448755
10023	NC_016856	TGA	2	6	475134	475139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448755
10024	NC_016856	GCT	2	6	475147	475152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448755
10025	NC_016856	CT	3	6	475151	475156	0 %	50 %	0 %	50 %	378448755
10026	NC_016856	GCCA	2	8	475327	475334	25 %	0 %	25 %	50 %	378448756
10027	NC_016856	GCG	2	6	475360	475365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448756
10028	NC_016856	CG	3	6	475380	475385	0 %	0 %	50 %	50 %	378448756
10029	NC_016856	CTT	2	6	475388	475393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448756
10030	NC_016856	CGC	2	6	475481	475486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448756
10031	NC_016856	GCC	2	6	475494	475499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448756
10032	NC_016856	TTC	2	6	475512	475517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448756
10033	NC_016856	TGC	2	6	475537	475542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10034	NC_016856	GTC	2	6	475566	475571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10035	NC_016856	CGC	2	6	475629	475634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448756
10036	NC_016856	CGT	2	6	475778	475783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10037	NC_016856	TCG	2	6	475825	475830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10038	NC_016856	GA	3	6	475873	475878	50 %	0 %	50 %	0 %	378448756
10039	NC_016856	GT	3	6	475893	475898	0 %	50 %	50 %	0 %	378448756
10040	NC_016856	CGAT	2	8	475927	475934	25 %	25 %	25 %	25 %	378448756
10041	NC_016856	AGTAG	2	10	476004	476013	40 %	20 %	40 %	0 %	378448756
10042	NC_016856	ACG	2	6	476020	476025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10043	NC_016856	GCC	2	6	476034	476039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448756
10044	NC_016856	GCG	2	6	476053	476058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448756
10045	NC_016856	TGC	2	6	476071	476076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10046	NC_016856	CCA	2	6	476126	476131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448756
10047	NC_016856	GGC	2	6	476184	476189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448756
10048	NC_016856	CA	3	6	476195	476200	50 %	0 %	0 %	50 %	378448756
10049	NC_016856	CCG	2	6	476236	476241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448756
10050	NC_016856	TTC	2	6	476383	476388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448756
10051	NC_016856	TTC	2	6	476493	476498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448756
10052	NC_016856	T	6	6	476545	476550	0 %	100 %	0 %	0 %	378448756
10053	NC_016856	AGA	2	6	476565	476570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448756
10054	NC_016856	GTT	2	6	476604	476609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448756
10055	NC_016856	GC	3	6	476612	476617	0 %	0 %	50 %	50 %	378448756
10056	NC_016856	CGG	2	6	476714	476719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448756
10057	NC_016856	CA	3	6	476739	476744	50 %	0 %	0 %	50 %	378448756
10058	NC_016856	GCG	2	6	476751	476756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448756
10059	NC_016856	CTT	2	6	476765	476770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448756
10060	NC_016856	CCG	2	6	476774	476779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448756
10061	NC_016856	ATACCG	2	12	476788	476799	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378448756
10062	NC_016856	TGGAGG	2	12	476807	476818	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	378448756
10063	NC_016856	CGA	2	6	476911	476916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10064	NC_016856	AGTA	2	8	477067	477074	50 %	25 %	25 %	0 %	378448756
10065	NC_016856	GCG	2	6	477075	477080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448756
10066	NC_016856	TCG	2	6	477085	477090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448756
10067	NC_016856	CT	3	6	477106	477111	0 %	50 %	0 %	50 %	378448756
10068	NC_016856	AGGGT	2	10	477154	477163	20 %	20 %	60 %	0 %	378448756
10069	NC_016856	TTTA	2	8	477208	477215	25 %	75 %	0 %	0 %	378448757
10070	NC_016856	GGTA	2	8	477358	477365	25 %	25 %	50 %	0 %	378448757
10071	NC_016856	GCT	2	6	477376	477381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448757
10072	NC_016856	CAC	2	6	477422	477427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448757
10073	NC_016856	AAGGC	2	10	477453	477462	40 %	0 %	40 %	20 %	378448757
10074	NC_016856	CT	3	6	477468	477473	0 %	50 %	0 %	50 %	378448757
10075	NC_016856	CGG	2	6	477541	477546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448757
10076	NC_016856	GC	3	6	477556	477561	0 %	0 %	50 %	50 %	378448757
10077	NC_016856	GCC	2	6	477618	477623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448757
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10079	NC_016856	ATC	2	6	477684	477689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448757
10080	NC_016856	CGATCG	2	12	477696	477707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378448757
10081	NC_016856	ATCGTC	2	12	477830	477841	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378448757
10082	NC_016856	GTC	2	6	477854	477859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448757
10083	NC_016856	CCG	2	6	477892	477897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448757
10084	NC_016856	TAA	2	6	477983	477988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448757
10085	NC_016856	GCT	2	6	478090	478095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448757
10086	NC_016856	CTG	2	6	478187	478192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448758
10087	NC_016856	TGCC	2	8	478199	478206	0 %	25 %	25 %	50 %	378448758
10088	NC_016856	CGC	2	6	478225	478230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448758
10089	NC_016856	ATTC	2	8	478237	478244	25 %	50 %	0 %	25 %	378448758
10090	NC_016856	CGC	2	6	478267	478272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448758
10091	NC_016856	GCTC	2	8	478300	478307	0 %	25 %	25 %	50 %	378448758
10092	NC_016856	GGCG	2	8	478325	478332	0 %	0 %	75 %	25 %	378448758
10093	NC_016856	TTC	2	6	478341	478346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448758
10094	NC_016856	ATG	2	6	478350	478355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448758
10095	NC_016856	CT	3	6	478365	478370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_016856	GTGATA	2	12	478456	478467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_016856	GCT	2	6	478501	478506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_016856	GCC	2	6	478555	478560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10099	NC_016856	TGCG	2	8	478882	478889	0 %	25 %	50 %	25 %	378448759
10100	NC_016856	GGC	2	6	478945	478950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448759
10101	NC_016856	GC	3	6	478975	478980	0 %	0 %	50 %	50 %	378448759
10102	NC_016856	TGGAAG	2	12	479015	479026	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378448759
10103	NC_016856	CTG	3	9	479035	479043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448759
10104	NC_016856	CGG	2	6	479115	479120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448759
10105	NC_016856	ACT	2	6	479174	479179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448759
10106	NC_016856	CTT	2	6	479181	479186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448759
10107	NC_016856	GGC	2	6	479194	479199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448759
10108	NC_016856	GCG	2	6	479200	479205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448759
10109	NC_016856	GGT	2	6	479298	479303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448759
10110	NC_016856	GAC	2	6	479326	479331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448759
10111	NC_016856	GTG	2	6	479344	479349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448759
10112	NC_016856	ATG	2	6	479359	479364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448759
10113	NC_016856	CG	3	6	479368	479373	0 %	0 %	50 %	50 %	378448759
10114	NC_016856	CCAG	2	8	479441	479448	25 %	0 %	25 %	50 %	378448759
10115	NC_016856	GC	3	6	479542	479547	0 %	0 %	50 %	50 %	378448759
10116	NC_016856	GAA	3	9	479647	479655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448759
10117	NC_016856	GGT	2	6	479682	479687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448759
10118	NC_016856	AGA	2	6	479688	479693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448759
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10120	NC_016856	CAG	2	6	479725	479730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448759
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10228	NC_016856	T	6	6	484811	484816	0 %	100 %	0 %	0 %	378448765
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10231	NC_016856	TGT	2	6	484971	484976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448766
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10233	NC_016856	CAG	2	6	485033	485038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448766
10234	NC_016856	CTG	2	6	485081	485086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448766
10235	NC_016856	GGCAGC	2	12	485090	485101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378448766
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10237	NC_016856	GCG	2	6	485235	485240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448766
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10239	NC_016856	CCGAC	2	10	485286	485295	20 %	0 %	20 %	60 %	378448766
10240	NC_016856	ACC	2	6	485330	485335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448766
10241	NC_016856	TGA	2	6	485353	485358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448766
10242	NC_016856	AGC	2	6	485411	485416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448766
10243	NC_016856	CGG	2	6	485419	485424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448766
10244	NC_016856	GCA	2	6	485441	485446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448766
10245	NC_016856	CGCT	2	8	485558	485565	0 %	25 %	25 %	50 %	378448766
10246	NC_016856	GGA	2	6	485599	485604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448766
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10251	NC_016856	GCT	2	6	485770	485775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448766
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10259	NC_016856	CTG	2	6	486201	486206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448767
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10355	NC_016856	GGTG	2	8	490744	490751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10356	NC_016856	TTTGC	2	10	490762	490771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10357	NC_016856	TCT	2	6	490818	490823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10358	NC_016856	CAA	2	6	490840	490845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10359	NC_016856	GC	3	6	490879	490884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10484	NC_016856	TGA	2	6	496004	496009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448777
10485	NC_016856	GCCA	2	8	496033	496040	25 %	0 %	25 %	50 %	378448777
10486	NC_016856	GGC	2	6	496083	496088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448777
10487	NC_016856	TTTC	2	8	496166	496173	0 %	75 %	0 %	25 %	378448777
10488	NC_016856	CGG	3	9	496230	496238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448777
10489	NC_016856	AGA	2	6	496239	496244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448777
10490	NC_016856	GCG	2	6	496366	496371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448777
10491	NC_016856	CGG	3	9	496373	496381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448777
10492	NC_016856	GCTG	2	8	496418	496425	0 %	25 %	50 %	25 %	378448777
10493	NC_016856	GTAC	2	8	496454	496461	25 %	25 %	25 %	25 %	378448777
10494	NC_016856	CCAGAA	2	12	496494	496505	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378448777
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10496	NC_016856	AGC	2	6	496577	496582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448777
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