MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S chromosome

Total Repeats: 102934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_016856	GGC	2	6	4724522	4724527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100002	NC_016856	CAT	2	6	4724567	4724572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100003	NC_016856	ATT	2	6	4724579	4724584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378453433
100004	NC_016856	TCA	2	6	4724638	4724643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378453433
100005	NC_016856	TCG	2	6	4724674	4724679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378453433
100006	NC_016856	T	7	7	4724720	4724726	0 %	100 %	0 %	0 %	378453433
100007	NC_016856	TCA	2	6	4724743	4724748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378453433
100008	NC_016856	GCAG	2	8	4724755	4724762	25 %	0 %	50 %	25 %	378453433
100009	NC_016856	CAT	2	6	4724802	4724807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378453433
100010	NC_016856	GCA	2	6	4724831	4724836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453433
100011	NC_016856	GCC	2	6	4724952	4724957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378453433
100012	NC_016856	CAG	2	6	4725007	4725012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453433
100013	NC_016856	CGG	2	6	4725053	4725058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378453433
100014	NC_016856	TTA	2	6	4725082	4725087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378453433
100015	NC_016856	CG	3	6	4725088	4725093	0 %	0 %	50 %	50 %	378453433
100016	NC_016856	CAGC	2	8	4725230	4725237	25 %	0 %	25 %	50 %	378453433
100017	NC_016856	CGA	2	6	4725242	4725247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453433
100018	NC_016856	CG	3	6	4725365	4725370	0 %	0 %	50 %	50 %	378453433
100019	NC_016856	CCA	2	6	4725452	4725457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378453433
100020	NC_016856	TTC	2	6	4725465	4725470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378453433
100021	NC_016856	GGC	2	6	4725501	4725506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378453433
100022	NC_016856	A	6	6	4725556	4725561	100 %	0 %	0 %	0 %	378453433
100023	NC_016856	GAT	2	6	4725637	4725642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100024	NC_016856	CGG	2	6	4725698	4725703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100025	NC_016856	AGC	2	6	4725775	4725780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453434
100026	NC_016856	GAA	2	6	4725783	4725788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378453434
100027	NC_016856	ATT	2	6	4725798	4725803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378453434
100028	NC_016856	TGGAAG	2	12	4725946	4725957	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378453434
100029	NC_016856	TTG	2	6	4725974	4725979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378453434
100030	NC_016856	TGA	2	6	4726039	4726044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378453434
100031	NC_016856	ATG	2	6	4726060	4726065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378453434
100032	NC_016856	ACG	2	6	4726072	4726077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453434
100033	NC_016856	TGA	2	6	4726118	4726123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378453434
100034	NC_016856	CGA	2	6	4726124	4726129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453434
100035	NC_016856	GAC	2	6	4726146	4726151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453434
100036	NC_016856	GCGT	2	8	4726153	4726160	0 %	25 %	50 %	25 %	378453434
100037	NC_016856	CTG	2	6	4726196	4726201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378453435
100038	NC_016856	T	7	7	4726207	4726213	0 %	100 %	0 %	0 %	378453435
100039	NC_016856	CT	3	6	4726244	4726249	0 %	50 %	0 %	50 %	378453435
100040	NC_016856	CGC	2	6	4726278	4726283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378453435
100041	NC_016856	GCT	2	6	4726423	4726428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378453435
100042	NC_016856	GCCGGA	2	12	4726471	4726482	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378453435
100043	NC_016856	TTG	2	6	4726485	4726490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378453435
100044	NC_016856	TGA	2	6	4726531	4726536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378453435
100045	NC_016856	ACGC	2	8	4726690	4726697	25 %	0 %	25 %	50 %	378453435
100046	NC_016856	CTGG	2	8	4726783	4726790	0 %	25 %	50 %	25 %	378453435
100047	NC_016856	TC	3	6	4726813	4726818	0 %	50 %	0 %	50 %	378453435
100048	NC_016856	CTGGCG	2	12	4726856	4726867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378453435
100049	NC_016856	CAG	2	6	4726868	4726873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378453435
100050	NC_016856	CCG	2	6	4726878	4726883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378453435
100051	NC_016856	GC	3	6	4726895	4726900	0 %	0 %	50 %	50 %	378453435
100052	NC_016856	GCG	2	6	4726968	4726973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378453435
100053	NC_016856	GCC	2	6	4726979	4726984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378453435
100054	NC_016856	CTG	2	6	4727065	4727070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378453436
100055	NC_016856	CCTGC	2	10	4727116	4727125	0 %	20 %	20 %	60 %	378453436
100056	NC_016856	GGCA	2	8	4727126	4727133	25 %	0 %	50 %	25 %	378453436
100057	NC_016856	ACTC	2	8	4727140	4727147	25 %	25 %	0 %	50 %	378453436
100058	NC_016856	CAT	2	6	4727192	4727197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100059	NC_016856	TACT	2	8	4727221	4727228	25 %	50 %	0 %	25 %	378453437
100060	NC_016856	CAA	2	6	4727265	4727270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378453437
100061	NC_016856	GTTT	2	8	4727273	4727280	0 %	75 %	25 %	0 %	378453437
100062	NC_016856	TTG	2	6	4727285	4727290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378453437
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100066	NC_016856	TCG	2	6	4727364	4727369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378453437
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100068	NC_016856	ACAG	2	8	4727407	4727414	50 %	0 %	25 %	25 %	378453437
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100070	NC_016856	T	7	7	4727496	4727502	0 %	100 %	0 %	0 %	378453437
100071	NC_016856	T	7	7	4727555	4727561	0 %	100 %	0 %	0 %	378453437
100072	NC_016856	CTT	2	6	4727574	4727579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378453437
100073	NC_016856	TAA	2	6	4727667	4727672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378453437
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100076	NC_016856	ATT	2	6	4727765	4727770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100077	NC_016856	ATA	2	6	4727784	4727789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100078	NC_016856	ATAA	2	8	4727800	4727807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100083	NC_016856	T	6	6	4728046	4728051	0 %	100 %	0 %	0 %	378453438
100084	NC_016856	CGC	4	12	4728094	4728105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378453438
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100087	NC_016856	ACC	2	6	4728129	4728134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378453438
100088	NC_016856	CGG	2	6	4728211	4728216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378453438
100089	NC_016856	CGG	2	6	4728271	4728276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378453438
100090	NC_016856	GGCGA	2	10	4728303	4728312	20 %	0 %	60 %	20 %	378453438
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100093	NC_016856	ATTT	2	8	4728343	4728350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100094	NC_016856	ACC	2	6	4728366	4728371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100095	NC_016856	TAT	2	6	4728476	4728481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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100097	NC_016856	TTG	2	6	4728613	4728618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378453439
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100100	NC_016856	GT	3	6	4728746	4728751	0 %	50 %	50 %	0 %	378453439
100101	NC_016856	TAT	2	6	4728762	4728767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378453439
100102	NC_016856	CT	4	8	4728781	4728788	0 %	50 %	0 %	50 %	378453439
100103	NC_016856	TTA	2	6	4728832	4728837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378453439
100104	NC_016856	ATT	2	6	4728844	4728849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378453439
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