MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 14028S plasmid unnamed

Total Repeats: 2048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016855	GCT	2	6	46225	46230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448091
1002	NC_016855	TCA	2	6	46254	46259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448091
1003	NC_016855	GCCT	2	8	46310	46317	0 %	25 %	25 %	50 %	378448091
1004	NC_016855	ATG	2	6	46374	46379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448091
1005	NC_016855	GTA	2	6	46430	46435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448091
1006	NC_016855	CGG	2	6	46516	46521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448091
1007	NC_016855	CTGC	2	8	46543	46550	0 %	25 %	25 %	50 %	378448091
1008	NC_016855	CTG	2	6	46590	46595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448091
1009	NC_016855	CTG	2	6	46604	46609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448091
1010	NC_016855	G	6	6	46613	46618	0 %	0 %	100 %	0 %	378448091
1011	NC_016855	TCC	2	6	46626	46631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448091
1012	NC_016855	TC	3	6	46670	46675	0 %	50 %	0 %	50 %	378448091
1013	NC_016855	TGA	2	6	46699	46704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448091
1014	NC_016855	CG	3	6	46715	46720	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
1015	NC_016855	CTT	2	6	46760	46765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448091
1016	NC_016855	TCC	2	6	46794	46799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448091
1017	NC_016855	CAG	2	6	46814	46819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448091
1018	NC_016855	CGTT	2	8	46826	46833	0 %	50 %	25 %	25 %	378448091
1019	NC_016855	GC	3	6	46897	46902	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
1020	NC_016855	GGTC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	50 %	25 %	378448091
1021	NC_016855	GAAC	2	8	46959	46966	50 %	0 %	25 %	25 %	378448091
1022	NC_016855	T	7	7	47207	47213	0 %	100 %	0 %	0 %	378448091
1023	NC_016855	GC	3	6	47225	47230	0 %	0 %	50 %	50 %	378448091
1024	NC_016855	GTT	2	6	47246	47251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448091
1025	NC_016855	ACC	2	6	47259	47264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448091
1026	NC_016855	CAC	2	6	47380	47385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378448092
1027	NC_016855	TTC	2	6	47401	47406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378448092
1028	NC_016855	GCA	2	6	47439	47444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448092
1029	NC_016855	TTTC	2	8	47574	47581	0 %	75 %	0 %	25 %	378448092
1030	NC_016855	GAA	2	6	47605	47610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448092
1031	NC_016855	TCC	2	6	47654	47659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378448092
1032	NC_016855	CGG	2	6	47670	47675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448092
1033	NC_016855	CCG	2	6	47691	47696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448092
1034	NC_016855	TA	3	6	47793	47798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016855	ATT	2	6	47803	47808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016855	TAA	2	6	47906	47911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016855	GGA	2	6	47918	47923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016855	TCC	2	6	47953	47958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_016855	TGT	2	6	47981	47986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016855	ACGGG	2	10	48056	48065	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1041	NC_016855	CGT	2	6	48072	48077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016855	CGA	2	6	48147	48152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016855	CGA	2	6	48205	48210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_016855	CCT	2	6	48249	48254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_016855	GCG	2	6	48362	48367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448093
1046	NC_016855	TGA	2	6	48456	48461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448093
1047	NC_016855	TGA	2	6	48564	48569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448093
1048	NC_016855	TGC	2	6	48577	48582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448093
1049	NC_016855	CTGG	2	8	48591	48598	0 %	25 %	50 %	25 %	378448093
1050	NC_016855	GCG	2	6	48649	48654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448093
1051	NC_016855	ATG	2	6	48677	48682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448093
1052	NC_016855	ATA	2	6	48744	48749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378448093
1053	NC_016855	TTG	2	6	48774	48779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378448094
1054	NC_016855	ATG	2	6	48809	48814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378448094
1055	NC_016855	TGG	2	6	48884	48889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448094
1056	NC_016855	CAT	2	6	48958	48963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448094
1057	NC_016855	TGAA	2	8	49132	49139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016855	ATG	2	6	49142	49147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016855	CTC	2	6	49156	49161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_016855	T	6	6	49162	49167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016855	CGG	2	6	49180	49185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_016855	CCGG	2	8	49223	49230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_016855	ACGGG	2	10	49233	49242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1064	NC_016855	TAT	2	6	49274	49279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016855	TGA	2	6	49299	49304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016855	CCT	2	6	49453	49458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_016855	GC	3	6	49531	49536	0 %	0 %	50 %	50 %	378448095
1068	NC_016855	GACC	2	8	49552	49559	25 %	0 %	25 %	50 %	378448095
1069	NC_016855	CGA	2	6	49618	49623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448095
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1071	NC_016855	GCT	2	6	49675	49680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448095
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1073	NC_016855	ACT	2	6	49776	49781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378448095
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1077	NC_016855	GC	3	6	50104	50109	0 %	0 %	50 %	50 %	378448095
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1081	NC_016855	GC	3	6	50226	50231	0 %	0 %	50 %	50 %	378448096
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1083	NC_016855	CTG	2	6	50323	50328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448096
1084	NC_016855	GCG	2	6	50398	50403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_016855	GCC	2	6	50406	50411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_016855	ATG	2	6	50435	50440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016855	GAACT	2	10	50456	50465	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1088	NC_016855	ACG	2	6	50490	50495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_016855	CTG	2	6	50507	50512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_016855	CTG	2	6	50702	50707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016855	CGGG	2	8	50728	50735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_016855	GGA	2	6	50746	50751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016855	GGCCT	2	10	50758	50767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_016855	CTGGCG	2	12	50831	50842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_016855	ACC	2	6	50852	50857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_016855	CGGG	2	8	50871	50878	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_016855	ATCA	2	8	50881	50888	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_016855	AAC	2	6	50911	50916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_016855	GTG	2	6	51022	51027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448097
1100	NC_016855	GGCT	2	8	51031	51038	0 %	25 %	50 %	25 %	378448097
1101	NC_016855	TGC	2	6	51060	51065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448097
1102	NC_016855	GAC	2	6	51081	51086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378448097
1103	NC_016855	CTG	2	6	51124	51129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448097
1104	NC_016855	CTG	2	6	51280	51285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448097
1105	NC_016855	CGG	2	6	51350	51355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448097
1106	NC_016855	AGGACG	2	12	51455	51466	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378448097
1107	NC_016855	TGC	2	6	51521	51526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448097
1108	NC_016855	GGA	2	6	51546	51551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378448097
1109	NC_016855	GCC	2	6	51562	51567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448097
1110	NC_016855	GAACC	2	10	51601	51610	40 %	0 %	20 %	40 %	378448097
1111	NC_016855	CCG	2	6	51624	51629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448097
1112	NC_016855	TG	3	6	51691	51696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016855	GAAA	2	8	51727	51734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016855	T	6	6	51758	51763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016855	CGA	2	6	51785	51790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016855	GAC	2	6	51798	51803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016855	GCCG	2	8	51863	51870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_016855	CATC	2	8	51926	51933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_016855	CGG	2	6	51972	51977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_016855	TCCT	2	8	51986	51993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_016855	TTA	2	6	52211	52216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448098
1122	NC_016855	GAA	2	6	52222	52227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378448098
1123	NC_016855	GCTG	2	8	52275	52282	0 %	25 %	50 %	25 %	378448098
1124	NC_016855	A	6	6	52306	52311	100 %	0 %	0 %	0 %	378448098
1125	NC_016855	GGT	2	6	52330	52335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378448098
1126	NC_016855	GGC	2	6	52363	52368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378448098
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1128	NC_016855	ATT	2	6	52456	52461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378448098
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1130	NC_016855	CCG	2	6	52482	52487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448098
1131	NC_016855	TGC	2	6	52538	52543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378448098
1132	NC_016855	CGC	2	6	52599	52604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378448098
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1135	NC_016855	TCAT	2	8	52653	52660	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1382	NC_016855	ATT	2	6	63301	63306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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