MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580

Total Repeats: 103009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016854	ACG	2	6	186239	186244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4002	NC_016854	AGA	2	6	186246	186251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443611
4003	NC_016854	CCG	2	6	186328	186333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4004	NC_016854	A	6	6	186341	186346	100 %	0 %	0 %	0 %	378443611
4005	NC_016854	TCACCG	2	12	186347	186358	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378443611
4006	NC_016854	CGA	2	6	186387	186392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4007	NC_016854	TC	4	8	186393	186400	0 %	50 %	0 %	50 %	378443611
4008	NC_016854	CAAA	2	8	186510	186517	75 %	0 %	0 %	25 %	378443611
4009	NC_016854	A	6	6	186532	186537	100 %	0 %	0 %	0 %	378443611
4010	NC_016854	GTG	2	6	186565	186570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443611
4011	NC_016854	TTC	2	6	186579	186584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443611
4012	NC_016854	GCG	3	9	186653	186661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4013	NC_016854	CGG	2	6	186672	186677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4014	NC_016854	TCT	2	6	186692	186697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443611
4015	NC_016854	GC	3	6	186719	186724	0 %	0 %	50 %	50 %	378443611
4016	NC_016854	GTGC	2	8	186865	186872	0 %	25 %	50 %	25 %	378443611
4017	NC_016854	GGT	2	6	186874	186879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443611
4018	NC_016854	ACC	2	6	186910	186915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443611
4019	NC_016854	AGC	2	6	186982	186987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4020	NC_016854	GGTC	2	8	187014	187021	0 %	25 %	50 %	25 %	378443611
4021	NC_016854	TCCG	2	8	187043	187050	0 %	25 %	25 %	50 %	378443611
4022	NC_016854	TAC	2	6	187095	187100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443611
4023	NC_016854	CGA	2	6	187116	187121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4024	NC_016854	CCG	2	6	187151	187156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4025	NC_016854	CAC	2	6	187212	187217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443611
4026	NC_016854	CAC	2	6	187219	187224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443611
4027	NC_016854	TC	3	6	187259	187264	0 %	50 %	0 %	50 %	378443611
4028	NC_016854	TGC	3	9	187307	187315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4029	NC_016854	CGG	2	6	187332	187337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4030	NC_016854	CGG	2	6	187376	187381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4031	NC_016854	TCTGG	2	10	187384	187393	0 %	40 %	40 %	20 %	378443611
4032	NC_016854	GCC	2	6	187402	187407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4033	NC_016854	CTG	2	6	187534	187539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4034	NC_016854	GAA	2	6	187548	187553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443611
4035	NC_016854	TCT	2	6	187568	187573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443611
4036	NC_016854	CCG	2	6	187646	187651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4037	NC_016854	TTG	2	6	187697	187702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443611
4038	NC_016854	CTG	2	6	187726	187731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4039	NC_016854	GAT	2	6	187737	187742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443611
4040	NC_016854	CCG	2	6	187761	187766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4041	NC_016854	CGT	2	6	187777	187782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4042	NC_016854	TGGC	2	8	187801	187808	0 %	25 %	50 %	25 %	378443611
4043	NC_016854	GCT	2	6	187818	187823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4044	NC_016854	CGG	2	6	187850	187855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4045	NC_016854	GAC	2	6	187915	187920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4046	NC_016854	CTG	2	6	187927	187932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4047	NC_016854	CGA	2	6	187956	187961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4048	NC_016854	GCT	2	6	188016	188021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443611
4049	NC_016854	GCC	2	6	188064	188069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4050	NC_016854	CGC	2	6	188082	188087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443611
4051	NC_016854	GAA	2	6	188098	188103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443611
4052	NC_016854	TAC	2	6	188107	188112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443611
4053	NC_016854	GGT	2	6	188202	188207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443611
4054	NC_016854	GGC	2	6	188280	188285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4055	NC_016854	GCG	2	6	188290	188295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4056	NC_016854	CGG	2	6	188357	188362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443611
4057	NC_016854	TATTTT	2	12	188530	188541	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	378443612
4058	NC_016854	CTT	2	6	188544	188549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443612
4059	NC_016854	CT	3	6	188566	188571	0 %	50 %	0 %	50 %	378443612
4060	NC_016854	TA	3	6	188576	188581	50 %	50 %	0 %	0 %	378443612
4061	NC_016854	GTAT	2	8	188654	188661	25 %	50 %	25 %	0 %	378443612
4062	NC_016854	TGG	2	6	188672	188677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443612
4063	NC_016854	TAT	2	6	188764	188769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443612
4064	NC_016854	TCA	2	6	188849	188854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443612
4065	NC_016854	T	6	6	188895	188900	0 %	100 %	0 %	0 %	378443612
4066	NC_016854	GGTT	2	8	189005	189012	0 %	50 %	50 %	0 %	378443612
4067	NC_016854	ATG	2	6	189047	189052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443612
4068	NC_016854	TGC	2	6	189058	189063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443612
4069	NC_016854	T	6	6	189087	189092	0 %	100 %	0 %	0 %	378443612
4070	NC_016854	ATT	2	6	189094	189099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443612
4071	NC_016854	CAT	2	6	189108	189113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443612
4072	NC_016854	TAT	2	6	189139	189144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443612
4073	NC_016854	TTG	2	6	189187	189192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443612
4074	NC_016854	GT	3	6	189195	189200	0 %	50 %	50 %	0 %	378443612
4075	NC_016854	T	6	6	189244	189249	0 %	100 %	0 %	0 %	378443612
4076	NC_016854	TGTT	2	8	189278	189285	0 %	75 %	25 %	0 %	378443612
4077	NC_016854	AAG	2	6	189310	189315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443612
4078	NC_016854	CTATA	2	10	189359	189368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4079	NC_016854	TAA	2	6	189376	189381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016854	TAC	2	6	189412	189417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_016854	TCT	2	6	189476	189481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_016854	T	7	7	189516	189522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_016854	GGT	2	6	189662	189667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443613
4084	NC_016854	CG	3	6	189731	189736	0 %	0 %	50 %	50 %	378443613
4085	NC_016854	TGGA	2	8	189792	189799	25 %	25 %	50 %	0 %	378443613
4086	NC_016854	GAA	2	6	189804	189809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443613
4087	NC_016854	TGA	2	6	189811	189816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443613
4088	NC_016854	TTA	2	6	189869	189874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443613
4089	NC_016854	AG	3	6	189881	189886	50 %	0 %	50 %	0 %	378443613
4090	NC_016854	GGA	2	6	189905	189910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378443613
4091	NC_016854	GTC	2	6	189921	189926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443613
4092	NC_016854	CT	3	6	189962	189967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_016854	T	6	6	190058	190063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_016854	T	6	6	190076	190081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_016854	TTA	2	6	190087	190092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_016854	TTGA	2	8	190134	190141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_016854	CAA	2	6	190170	190175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_016854	A	6	6	190203	190208	100 %	0 %	0 %	0 %	378443614
4099	NC_016854	CGG	2	6	190226	190231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443614
4100	NC_016854	ATG	2	6	190233	190238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443614
4101	NC_016854	CGG	2	6	190298	190303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443614
4102	NC_016854	CTG	2	6	190356	190361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443614
4103	NC_016854	GCG	2	6	190507	190512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443614
4104	NC_016854	TGC	2	6	190556	190561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443614
4105	NC_016854	ATG	2	6	190621	190626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443614
4106	NC_016854	CTTT	2	8	190630	190637	0 %	75 %	0 %	25 %	378443614
4107	NC_016854	GAT	2	6	190640	190645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443614
4108	NC_016854	TGG	2	6	190690	190695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443614
4109	NC_016854	T	6	6	190757	190762	0 %	100 %	0 %	0 %	378443614
4110	NC_016854	GGC	2	6	190770	190775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443614
4111	NC_016854	GCT	2	6	190778	190783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443614
4112	NC_016854	CTTT	2	8	190789	190796	0 %	75 %	0 %	25 %	378443614
4113	NC_016854	GGGC	2	8	190810	190817	0 %	0 %	75 %	25 %	378443614
4114	NC_016854	CGTT	2	8	190879	190886	0 %	50 %	25 %	25 %	378443614
4115	NC_016854	GCG	2	6	190944	190949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443614
4116	NC_016854	CGC	2	6	190981	190986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443614
4117	NC_016854	TCGC	2	8	191010	191017	0 %	25 %	25 %	50 %	378443614
4118	NC_016854	GCT	2	6	191028	191033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443614
4119	NC_016854	CCGCT	2	10	191035	191044	0 %	20 %	20 %	60 %	378443614
4120	NC_016854	GCC	2	6	191049	191054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443614
4121	NC_016854	CAC	2	6	191063	191068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443614
4122	NC_016854	CCT	2	6	191092	191097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378443614
4123	NC_016854	A	6	6	191106	191111	100 %	0 %	0 %	0 %	378443614
4124	NC_016854	CTT	2	6	191125	191130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443614
4125	NC_016854	GAT	2	6	191165	191170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443615
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4131	NC_016854	CGG	2	6	191427	191432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443615
4132	NC_016854	GC	3	6	191437	191442	0 %	0 %	50 %	50 %	378443615
4133	NC_016854	CGC	3	9	191467	191475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443615
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4136	NC_016854	CTTA	2	8	191671	191678	25 %	50 %	0 %	25 %	378443615
4137	NC_016854	TCG	2	6	191709	191714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443615
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4140	NC_016854	GCT	2	6	191782	191787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443615
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4156	NC_016854	TGG	2	6	192508	192513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443616
4157	NC_016854	CAT	2	6	192620	192625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443616
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4159	NC_016854	CAGGCG	2	12	192681	192692	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378443616
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4164	NC_016854	GCCA	2	8	193091	193098	25 %	0 %	25 %	50 %	378443616
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4220	NC_016854	T	6	6	196028	196033	0 %	100 %	0 %	0 %	378443620
4221	NC_016854	A	6	6	196139	196144	100 %	0 %	0 %	0 %	378443620
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4224	NC_016854	TAT	2	6	196387	196392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4225	NC_016854	TATTG	2	10	196420	196429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4226	NC_016854	GCCGC	2	10	196593	196602	0 %	0 %	40 %	60 %	378443621
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4232	NC_016854	CGC	2	6	196927	196932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443621
4233	NC_016854	CTG	2	6	196936	196941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443621
4234	NC_016854	CGA	2	6	197059	197064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443621
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4237	NC_016854	CCG	3	9	197136	197144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443621
4238	NC_016854	GCT	2	6	197164	197169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443621
4239	NC_016854	CTAT	2	8	197181	197188	25 %	50 %	0 %	25 %	378443621
4240	NC_016854	GCA	2	6	197191	197196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443621
4241	NC_016854	GGCT	2	8	197210	197217	0 %	25 %	50 %	25 %	378443621
4242	NC_016854	GC	3	6	197246	197251	0 %	0 %	50 %	50 %	378443621
4243	NC_016854	CGC	2	6	197263	197268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443621
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4245	NC_016854	CTG	2	6	197312	197317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443621
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4326	NC_016854	ATCCA	2	10	201943	201952	40 %	20 %	0 %	40 %	378443624
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4333	NC_016854	AT	3	6	202137	202142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4334	NC_016854	AAGT	2	8	202159	202166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4335	NC_016854	CAA	2	6	202196	202201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378443625
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4337	NC_016854	CGG	2	6	202219	202224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443625
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4351	NC_016854	TAT	2	6	202795	202800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443625
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4354	NC_016854	GAGC	2	8	202999	203006	25 %	0 %	50 %	25 %	378443625
4355	NC_016854	TAA	2	6	203032	203037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443625
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4357	NC_016854	ATG	2	6	203098	203103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443625
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4359	NC_016854	TCA	2	6	203192	203197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443626
4360	NC_016854	TAT	2	6	203214	203219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443626
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4362	NC_016854	CGT	2	6	203336	203341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443626
4363	NC_016854	T	6	6	203344	203349	0 %	100 %	0 %	0 %	378443626
4364	NC_016854	CTG	2	6	203380	203385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443626
4365	NC_016854	ATC	2	6	203410	203415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443626
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4367	NC_016854	GC	3	6	203440	203445	0 %	0 %	50 %	50 %	378443626
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4489	NC_016854	A	7	7	209235	209241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_016854	CAT	2	6	209250	209255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4491	NC_016854	GGA	2	6	209274	209279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4492	NC_016854	AAG	2	6	209349	209354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443631
4493	NC_016854	ATG	2	6	209424	209429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443631
4494	NC_016854	TG	3	6	209428	209433	0 %	50 %	50 %	0 %	378443631
4495	NC_016854	CGGCG	2	10	209489	209498	0 %	0 %	60 %	40 %	378443631
4496	NC_016854	TGA	2	6	209518	209523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443631
4497	NC_016854	GGA	2	6	209576	209581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378443631
4498	NC_016854	GC	3	6	209644	209649	0 %	0 %	50 %	50 %	378443631
4499	NC_016854	CAG	3	9	209673	209681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443631
4500	NC_016854	TGC	2	6	209701	209706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443631

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