MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580

Total Repeats: 103009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016854	GTTT	2	8	116588	116595	0 %	75 %	25 %	0 %	378443553
2503	NC_016854	TAAT	2	8	116596	116603	50 %	50 %	0 %	0 %	378443553
2504	NC_016854	ATA	2	6	116653	116658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016854	TAAA	2	8	116679	116686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016854	TCG	2	6	116706	116711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_016854	CT	3	6	116716	116721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2508	NC_016854	TAATT	2	10	116725	116734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_016854	ATTTT	2	10	116751	116760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016854	CGGGTG	2	12	116767	116778	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2511	NC_016854	T	6	6	116913	116918	0 %	100 %	0 %	0 %	378443554
2512	NC_016854	ACAGA	2	10	116934	116943	60 %	0 %	20 %	20 %	378443554
2513	NC_016854	ATT	2	6	116958	116963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443554
2514	NC_016854	T	7	7	116978	116984	0 %	100 %	0 %	0 %	378443554
2515	NC_016854	A	6	6	117005	117010	100 %	0 %	0 %	0 %	378443554
2516	NC_016854	ATT	2	6	117027	117032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443554
2517	NC_016854	CAA	2	6	117064	117069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378443554
2518	NC_016854	TTC	2	6	117084	117089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443554
2519	NC_016854	GGAA	2	8	117098	117105	50 %	0 %	50 %	0 %	378443554
2520	NC_016854	ATT	2	6	117132	117137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443554
2521	NC_016854	AT	3	6	117185	117190	50 %	50 %	0 %	0 %	378443554
2522	NC_016854	TCA	2	6	117203	117208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443554
2523	NC_016854	C	6	6	117214	117219	0 %	0 %	0 %	100 %	378443554
2524	NC_016854	CAG	2	6	117293	117298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443555
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2540	NC_016854	CAGCG	2	10	118109	118118	20 %	0 %	40 %	40 %	378443556
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2542	NC_016854	GC	3	6	118236	118241	0 %	0 %	50 %	50 %	378443556
2543	NC_016854	GCCA	2	8	118243	118250	25 %	0 %	25 %	50 %	378443556
2544	NC_016854	GCG	2	6	118332	118337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443556
2545	NC_016854	CAG	2	6	118363	118368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443556
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2549	NC_016854	GGAC	2	8	118510	118517	25 %	0 %	50 %	25 %	378443556
2550	NC_016854	AC	3	6	118516	118521	50 %	0 %	0 %	50 %	378443556
2551	NC_016854	CGAGC	2	10	118534	118543	20 %	0 %	40 %	40 %	378443556
2552	NC_016854	TCC	2	6	118580	118585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378443556
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2554	NC_016854	GCG	2	6	118643	118648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443556
2555	NC_016854	TGC	2	6	118685	118690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443556
2556	NC_016854	GTA	2	6	118748	118753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443556
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2558	NC_016854	CGC	2	6	118810	118815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443556
2559	NC_016854	GGCG	2	8	118855	118862	0 %	0 %	75 %	25 %	378443556
2560	NC_016854	GCT	2	6	118873	118878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443556
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2564	NC_016854	GTCA	2	8	119005	119012	25 %	25 %	25 %	25 %	378443556
2565	NC_016854	GAC	2	6	119140	119145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443556
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2567	NC_016854	CG	3	6	119165	119170	0 %	0 %	50 %	50 %	378443556
2568	NC_016854	CCG	2	6	119192	119197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443556
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2571	NC_016854	AGT	2	6	119279	119284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443556
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2584	NC_016854	GCG	2	6	120095	120100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443557
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2587	NC_016854	CTGG	2	8	120188	120195	0 %	25 %	50 %	25 %	378443557
2588	NC_016854	TGC	2	6	120222	120227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443557
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2590	NC_016854	CGC	2	6	120487	120492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443557
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2604	NC_016854	CG	3	6	121135	121140	0 %	0 %	50 %	50 %	378443557
2605	NC_016854	GAT	2	6	121141	121146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443557
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2609	NC_016854	TCG	2	6	121224	121229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443557
2610	NC_016854	GC	3	6	121254	121259	0 %	0 %	50 %	50 %	378443557
2611	NC_016854	CAATTG	2	12	121285	121296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378443557
2612	NC_016854	TCCA	2	8	121309	121316	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_016854	AG	3	6	121341	121346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_016854	CAGG	2	8	121363	121370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_016854	AATGCT	2	12	121393	121404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2616	NC_016854	TCA	2	6	121545	121550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_016854	GTC	2	6	121581	121586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_016854	TCT	2	6	121610	121615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_016854	G	6	6	121625	121630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_016854	T	7	7	121739	121745	0 %	100 %	0 %	0 %	378443558
2621	NC_016854	ATCG	2	8	121746	121753	25 %	25 %	25 %	25 %	378443558
2622	NC_016854	AT	3	6	121772	121777	50 %	50 %	0 %	0 %	378443558
2623	NC_016854	TAA	3	9	121811	121819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443558
2624	NC_016854	TGTC	2	8	121832	121839	0 %	50 %	25 %	25 %	378443558
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2742	NC_016854	T	7	7	126660	126666	0 %	100 %	0 %	0 %	378443562
2743	NC_016854	GC	4	8	126768	126775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2744	NC_016854	TAGTG	2	10	126806	126815	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_016854	GCA	2	6	126829	126834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2993	NC_016854	T	6	6	139451	139456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_016854	CTTT	2	8	139462	139469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2995	NC_016854	TTGTT	2	10	139526	139535	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_016854	TCG	2	6	139552	139557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_016854	CGG	2	6	139732	139737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2998	NC_016854	T	7	7	139749	139755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_016854	T	6	6	139837	139842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3000	NC_016854	CTTG	2	8	139862	139869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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