MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. D23580

Total Repeats: 103009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016854	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016854	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016854	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016854	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378443455
5	NC_016854	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443455
6	NC_016854	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443455
7	NC_016854	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016854	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016854	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016854	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
11	NC_016854	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378443456
12	NC_016854	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443456
13	NC_016854	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	378443456
14	NC_016854	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
15	NC_016854	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	378443456
16	NC_016854	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378443456
17	NC_016854	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443456
18	NC_016854	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
19	NC_016854	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	378443456
20	NC_016854	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378443456
21	NC_016854	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
22	NC_016854	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
23	NC_016854	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443456
24	NC_016854	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
25	NC_016854	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
26	NC_016854	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443456
27	NC_016854	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443456
28	NC_016854	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378443456
29	NC_016854	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443456
30	NC_016854	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378443456
31	NC_016854	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443456
32	NC_016854	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
33	NC_016854	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
34	NC_016854	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443456
35	NC_016854	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378443456
36	NC_016854	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378443456
37	NC_016854	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378443456
38	NC_016854	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
39	NC_016854	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443456
40	NC_016854	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443456
41	NC_016854	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443456
42	NC_016854	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378443456
43	NC_016854	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443456
44	NC_016854	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378443456
45	NC_016854	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443456
46	NC_016854	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443456
47	NC_016854	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
48	NC_016854	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
49	NC_016854	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443456
50	NC_016854	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
51	NC_016854	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443456
52	NC_016854	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443456
53	NC_016854	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443456
54	NC_016854	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
55	NC_016854	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443456
56	NC_016854	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443456
57	NC_016854	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378443456
58	NC_016854	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378443456
59	NC_016854	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378443456
60	NC_016854	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378443456
61	NC_016854	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443456
62	NC_016854	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443456
63	NC_016854	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443456
64	NC_016854	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378443456
65	NC_016854	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443456
66	NC_016854	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443456
67	NC_016854	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443456
68	NC_016854	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443456
69	NC_016854	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443457
70	NC_016854	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443457
71	NC_016854	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	378443457
72	NC_016854	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443457
73	NC_016854	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443457
74	NC_016854	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378443457
75	NC_016854	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443457
76	NC_016854	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443457
77	NC_016854	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443457
78	NC_016854	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443457
79	NC_016854	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443457
80	NC_016854	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443457
81	NC_016854	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378443457
82	NC_016854	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443457
83	NC_016854	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443457
84	NC_016854	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378443457
85	NC_016854	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378443457
86	NC_016854	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443457
87	NC_016854	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443457
88	NC_016854	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443458
89	NC_016854	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	378443458
90	NC_016854	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443458
91	NC_016854	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443458
92	NC_016854	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378443458
93	NC_016854	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443458
94	NC_016854	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443458
95	NC_016854	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378443458
96	NC_016854	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443458
97	NC_016854	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378443458
98	NC_016854	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443458
99	NC_016854	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443458
100	NC_016854	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443458
101	NC_016854	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443458
102	NC_016854	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443458
103	NC_016854	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443458
104	NC_016854	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443458
105	NC_016854	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378443458
106	NC_016854	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378443458
107	NC_016854	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	378443458
108	NC_016854	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378443458
109	NC_016854	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443458
110	NC_016854	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378443458
111	NC_016854	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443458
112	NC_016854	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443458
113	NC_016854	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378443458
114	NC_016854	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443458
115	NC_016854	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	378443458
116	NC_016854	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443458
117	NC_016854	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443458
118	NC_016854	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378443458
119	NC_016854	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443458
120	NC_016854	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378443458
121	NC_016854	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016854	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378443459
123	NC_016854	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443459
124	NC_016854	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378443459
125	NC_016854	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443459
126	NC_016854	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378443459
127	NC_016854	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	378443459
128	NC_016854	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443459
129	NC_016854	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443459
130	NC_016854	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378443459
131	NC_016854	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378443459
132	NC_016854	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378443459
133	NC_016854	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378443459
134	NC_016854	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378443459
135	NC_016854	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378443459
136	NC_016854	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443459
137	NC_016854	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378443459
138	NC_016854	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378443459
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140	NC_016854	A	7	7	5924	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016854	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016854	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378443460
143	NC_016854	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443460
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166	NC_016854	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016854	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_016854	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_016854	TTA	2	6	11332	11337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_016854	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_016854	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
251	NC_016854	A	6	6	11423	11428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016854	T	6	6	11429	11434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016854	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_016854	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016854	A	8	8	11498	11505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_016854	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_016854	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016854	ATT	2	6	11602	11607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378443466
259	NC_016854	TAC	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443466
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261	NC_016854	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	378443466
262	NC_016854	GCC	2	6	11813	11818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378443466
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267	NC_016854	GAA	2	6	11961	11966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378443466
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397	NC_016854	GAT	2	6	17769	17774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
398	NC_016854	T	6	6	17791	17796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_016854	ACT	2	6	17909	17914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378443472
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