MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 4547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016833	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016833	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016833	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016833	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016833	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016833	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	383181733
7	NC_016833	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181733
8	NC_016833	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181733
9	NC_016833	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181733
10	NC_016833	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181733
11	NC_016833	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	383181734
12	NC_016833	AAT	2	6	728	733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181734
13	NC_016833	TTG	2	6	774	779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181734
14	NC_016833	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181734
15	NC_016833	GAT	2	6	928	933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181734
16	NC_016833	TAT	2	6	962	967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016833	GTAG	2	8	968	975	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016833	AAT	2	6	1012	1017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016833	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016833	T	7	7	1076	1082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016833	AAG	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016833	ATG	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016833	AT	3	6	1156	1161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016833	ATA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
25	NC_016833	A	6	6	1271	1276	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
26	NC_016833	TCA	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181735
27	NC_016833	AGC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181735
28	NC_016833	T	7	7	1309	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	383181735
29	NC_016833	GA	3	6	1318	1323	50 %	0 %	50 %	0 %	383181735
30	NC_016833	ATG	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181735
31	NC_016833	TCTA	2	8	1349	1356	25 %	50 %	0 %	25 %	383181735
32	NC_016833	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181735
33	NC_016833	A	6	6	1423	1428	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
34	NC_016833	TAA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
35	NC_016833	ATG	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181735
36	NC_016833	TGC	3	9	1514	1522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181735
37	NC_016833	A	7	7	1535	1541	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
38	NC_016833	TAA	2	6	1583	1588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
39	NC_016833	TCA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181735
40	NC_016833	ACAA	2	8	1658	1665	75 %	0 %	0 %	25 %	383181735
41	NC_016833	CTG	2	6	1771	1776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181735
42	NC_016833	TCTT	2	8	1781	1788	0 %	75 %	0 %	25 %	383181735
43	NC_016833	CT	3	6	1799	1804	0 %	50 %	0 %	50 %	383181735
44	NC_016833	T	7	7	1808	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	383181735
45	NC_016833	A	7	7	1844	1850	100 %	0 %	0 %	0 %	383181735
46	NC_016833	CTG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181735
47	NC_016833	AAG	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181735
48	NC_016833	TAT	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181735
49	NC_016833	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181735
50	NC_016833	TAG	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016833	ATC	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016833	ATA	2	6	2144	2149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016833	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016833	CAT	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016833	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016833	TTA	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016833	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016833	T	6	6	2301	2306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016833	T	6	6	2320	2325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016833	ATC	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016833	AATT	2	8	2345	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016833	AAAT	2	8	2362	2369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016833	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181736
64	NC_016833	T	6	6	2393	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	383181736
65	NC_016833	CAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181736
66	NC_016833	CCG	2	6	2497	2502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181736
67	NC_016833	AGT	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181736
68	NC_016833	CGCT	2	8	2560	2567	0 %	25 %	25 %	50 %	383181736
69	NC_016833	TAC	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181736
70	NC_016833	GTT	2	6	2688	2693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181736
71	NC_016833	TAC	2	6	2702	2707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181736
72	NC_016833	TTAT	2	8	2771	2778	25 %	75 %	0 %	0 %	383181736
73	NC_016833	TTGG	2	8	2855	2862	0 %	50 %	50 %	0 %	383181736
74	NC_016833	GTT	2	6	3007	3012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181736
75	NC_016833	ATA	2	6	3023	3028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181736
76	NC_016833	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	383181736
77	NC_016833	GAA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181736
78	NC_016833	AGG	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016833	CAC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181737
80	NC_016833	GCAGAA	2	12	3250	3261	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383181737
81	NC_016833	TTA	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181737
82	NC_016833	TGC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181737
83	NC_016833	GAT	2	6	3289	3294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181737
84	NC_016833	CAC	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016833	AT	3	6	3452	3457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016833	T	6	6	3498	3503	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
87	NC_016833	A	6	6	3507	3512	100 %	0 %	0 %	0 %	383181738
88	NC_016833	CATTG	2	10	3539	3548	20 %	40 %	20 %	20 %	383181738
89	NC_016833	T	6	6	3584	3589	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
90	NC_016833	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383181738
91	NC_016833	TAAG	2	8	3655	3662	50 %	25 %	25 %	0 %	383181738
92	NC_016833	CAT	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181738
93	NC_016833	TTG	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181738
94	NC_016833	AAATT	2	10	3735	3744	60 %	40 %	0 %	0 %	383181738
95	NC_016833	TAAA	2	8	3752	3759	75 %	25 %	0 %	0 %	383181738
96	NC_016833	T	6	6	3773	3778	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
97	NC_016833	TGA	2	6	3804	3809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181738
98	NC_016833	T	7	7	3814	3820	0 %	100 %	0 %	0 %	383181738
99	NC_016833	GAT	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181739
100	NC_016833	CA	3	6	4007	4012	50 %	0 %	0 %	50 %	383181739
101	NC_016833	CAG	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181739
102	NC_016833	AGC	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181739
103	NC_016833	AGGA	2	8	4126	4133	50 %	0 %	50 %	0 %	383181739
104	NC_016833	CTG	2	6	4141	4146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181739
105	NC_016833	GCC	2	6	4149	4154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181739
106	NC_016833	GTT	2	6	4164	4169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181739
107	NC_016833	TGC	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181739
108	NC_016833	CTC	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383181739
109	NC_016833	AAG	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181739
110	NC_016833	A	6	6	4283	4288	100 %	0 %	0 %	0 %	383181739
111	NC_016833	TGGA	2	8	4400	4407	25 %	25 %	50 %	0 %	383181740
112	NC_016833	GCC	2	6	4410	4415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181740
113	NC_016833	GTC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
114	NC_016833	TGA	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181740
115	NC_016833	TCG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
116	NC_016833	CTG	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
117	NC_016833	GAAA	2	8	4654	4661	75 %	0 %	25 %	0 %	383181740
118	NC_016833	CTG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
119	NC_016833	GA	4	8	4710	4717	50 %	0 %	50 %	0 %	383181740
120	NC_016833	CTG	2	6	4741	4746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
121	NC_016833	GCACT	2	10	4757	4766	20 %	20 %	20 %	40 %	383181740
122	NC_016833	CGG	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181740
123	NC_016833	CGC	2	6	4832	4837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181740
124	NC_016833	CGT	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181740
125	NC_016833	AGTGG	2	10	4864	4873	20 %	20 %	60 %	0 %	383181740
126	NC_016833	GAA	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181740
127	NC_016833	CGG	2	6	4953	4958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181740
128	NC_016833	AG	3	6	4987	4992	50 %	0 %	50 %	0 %	383181740
129	NC_016833	GCA	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181740
130	NC_016833	TCGC	2	8	5122	5129	0 %	25 %	25 %	50 %	383181740
131	NC_016833	ATCC	2	8	5201	5208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016833	T	8	8	5234	5241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016833	GAA	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016833	ATC	2	6	5507	5512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016833	GGT	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016833	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016833	A	6	6	5677	5682	100 %	0 %	0 %	0 %	383181741
138	NC_016833	TATT	2	8	5693	5700	25 %	75 %	0 %	0 %	383181741
139	NC_016833	T	7	7	5714	5720	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
140	NC_016833	TCT	2	6	5723	5728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181741
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142	NC_016833	TAC	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181741
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172	NC_016833	T	6	6	7051	7056	0 %	100 %	0 %	0 %	383181741
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197	NC_016833	T	6	6	8520	8525	0 %	100 %	0 %	0 %	383181742
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243	NC_016833	CCA	2	6	10596	10601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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249	NC_016833	A	6	6	10842	10847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_016833	T	6	6	10950	10955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_016833	GTCTG	2	10	11761	11770	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_016833	TCC	2	6	11773	11778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_016833	AAT	2	6	11790	11795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_016833	CAT	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_016833	GAA	2	6	11870	11875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181748
274	NC_016833	CTGT	2	8	11925	11932	0 %	50 %	25 %	25 %	383181748
275	NC_016833	CTT	2	6	12011	12016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181748
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409	NC_016833	CAG	2	6	18778	18783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181757
410	NC_016833	CGG	2	6	18815	18820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383181757
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427	NC_016833	TCT	2	6	19679	19684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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429	NC_016833	A	6	6	19730	19735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_016833	TGG	2	6	21380	21385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_016833	AAAC	2	8	21636	21643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
458	NC_016833	ACA	2	6	21669	21674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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460	NC_016833	GTT	2	6	21691	21696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_016833	CAT	2	6	21840	21845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_016833	ACGC	2	8	21879	21886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
464	NC_016833	GAT	3	9	21937	21945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
465	NC_016833	CGG	2	6	22046	22051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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