MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 4547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016833	CTA	2	6	118002	118007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181870
2502	NC_016833	AAC	2	6	118022	118027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_016833	AAAC	2	8	118048	118055	75 %	0 %	0 %	25 %	383181871
2504	NC_016833	ACG	2	6	118122	118127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2505	NC_016833	CTG	2	6	118154	118159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2506	NC_016833	TGA	2	6	118162	118167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383181871
2507	NC_016833	A	6	6	118210	118215	100 %	0 %	0 %	0 %	383181871
2508	NC_016833	TGCC	2	8	118216	118223	0 %	25 %	25 %	50 %	383181871
2509	NC_016833	CTG	2	6	118298	118303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2510	NC_016833	A	6	6	118506	118511	100 %	0 %	0 %	0 %	383181871
2511	NC_016833	AGC	2	6	118607	118612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2512	NC_016833	CAA	2	6	118668	118673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181871
2513	NC_016833	CAG	2	6	118674	118679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2514	NC_016833	CA	3	6	118710	118715	50 %	0 %	0 %	50 %	383181871
2515	NC_016833	AGC	2	6	118766	118771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181871
2516	NC_016833	A	6	6	118773	118778	100 %	0 %	0 %	0 %	383181871
2517	NC_016833	AAGTT	2	10	118800	118809	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_016833	CGT	2	6	119038	119043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_016833	TGG	2	6	119122	119127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181872
2520	NC_016833	GCC	2	6	119227	119232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181872
2521	NC_016833	GTG	2	6	119285	119290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181872
2522	NC_016833	GCC	2	6	119320	119325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181872
2523	NC_016833	CTG	2	6	119358	119363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181872
2524	NC_016833	CCG	2	6	119382	119387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181872
2525	NC_016833	GGA	2	6	119524	119529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383181873
2526	NC_016833	CTGC	2	8	119542	119549	0 %	25 %	25 %	50 %	383181873
2527	NC_016833	TGC	2	6	119622	119627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181873
2528	NC_016833	TGC	2	6	119632	119637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181873
2529	NC_016833	GCA	2	6	119685	119690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181873
2530	NC_016833	T	7	7	119755	119761	0 %	100 %	0 %	0 %	383181873
2531	NC_016833	CTGA	2	8	119797	119804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_016833	ATC	2	6	119900	119905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_016833	AT	3	6	119919	119924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_016833	AC	3	6	119932	119937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_016833	GGT	2	6	119968	119973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_016833	GGT	2	6	120029	120034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_016833	TAG	2	6	120047	120052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_016833	G	6	6	120085	120090	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_016833	GCA	2	6	120194	120199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_016833	TTCATT	2	12	120248	120259	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2541	NC_016833	AAC	2	6	120332	120337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_016833	CGG	2	6	120390	120395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_016833	CTT	2	6	120401	120406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_016833	GCA	2	6	120408	120413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_016833	GTT	2	6	120416	120421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_016833	GACA	2	8	120438	120445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2547	NC_016833	CAC	2	6	120450	120455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_016833	GCA	2	6	120459	120464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_016833	TCA	2	6	120539	120544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_016833	C	6	6	120636	120641	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2551	NC_016833	GTT	2	6	120689	120694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_016833	TGC	2	6	120709	120714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_016833	GTTT	2	8	120721	120728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_016833	TA	3	6	120767	120772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_016833	ATT	2	6	120800	120805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_016833	CAT	2	6	120821	120826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_016833	ATA	2	6	120933	120938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_016833	TAT	3	9	120944	120952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_016833	T	7	7	120972	120978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_016833	CAA	2	6	120998	121003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_016833	A	6	6	121010	121015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_016833	A	6	6	121030	121035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_016833	AT	3	6	121113	121118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_016833	ATT	3	9	121123	121131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_016833	TAA	2	6	121148	121153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_016833	A	6	6	121239	121244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_016833	A	7	7	121251	121257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_016833	CTT	2	6	121276	121281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_016833	AAG	2	6	121290	121295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_016833	A	6	6	121296	121301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_016833	CAT	2	6	121373	121378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_016833	CAA	2	6	121391	121396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_016833	CCA	2	6	121398	121403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_016833	ACCC	2	8	121453	121460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2575	NC_016833	AAT	2	6	121483	121488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_016833	GAA	2	6	121489	121494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_016833	TCAT	2	8	121513	121520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2578	NC_016833	A	6	6	121541	121546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_016833	AAT	2	6	121596	121601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_016833	TATCA	2	10	121621	121630	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2581	NC_016833	CTA	2	6	121648	121653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_016833	AG	3	6	121825	121830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_016833	GTT	2	6	121873	121878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_016833	TTG	3	9	121884	121892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_016833	ATT	2	6	121905	121910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_016833	ATA	2	6	121921	121926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_016833	AAACA	2	10	121933	121942	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2588	NC_016833	CAG	2	6	122001	122006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_016833	TAA	2	6	122051	122056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_016833	ATTC	2	8	122116	122123	25 %	50 %	0 %	25 %	383181874
2591	NC_016833	TTC	2	6	122126	122131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181874
2592	NC_016833	T	6	6	122133	122138	0 %	100 %	0 %	0 %	383181874
2593	NC_016833	T	6	6	122195	122200	0 %	100 %	0 %	0 %	383181874
2594	NC_016833	GCC	2	6	122271	122276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181874
2595	NC_016833	TTC	2	6	122290	122295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181875
2596	NC_016833	TCG	2	6	122320	122325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181875
2597	NC_016833	GCT	2	6	122398	122403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181875
2598	NC_016833	TGC	2	6	122428	122433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181875
2599	NC_016833	TGG	2	6	122524	122529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_016833	CAG	2	6	122623	122628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181876
2601	NC_016833	TTC	2	6	122729	122734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383181876
2602	NC_016833	GCC	2	6	122756	122761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181876
2603	NC_016833	CCTG	2	8	122895	122902	0 %	25 %	25 %	50 %	383181876
2604	NC_016833	TGC	2	6	122927	122932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_016833	GAC	3	9	122958	122966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_016833	CAC	2	6	123244	123249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383181877
2607	NC_016833	A	6	6	123368	123373	100 %	0 %	0 %	0 %	383181877
2608	NC_016833	CTG	2	6	123382	123387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181878
2609	NC_016833	CAT	2	6	123478	123483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181878
2610	NC_016833	GAA	2	6	123525	123530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181878
2611	NC_016833	GTT	2	6	123594	123599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383181878
2612	NC_016833	TTAC	2	8	123782	123789	25 %	50 %	0 %	25 %	383181878
2613	NC_016833	TCCAC	2	10	123845	123854	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2614	NC_016833	TGT	2	6	123861	123866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_016833	AG	3	6	123911	123916	50 %	0 %	50 %	0 %	383181879
2616	NC_016833	CAG	2	6	123944	123949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383181879
2617	NC_016833	TCG	2	6	123960	123965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181879
2618	NC_016833	ACGG	2	8	123994	124001	25 %	0 %	50 %	25 %	383181879
2619	NC_016833	GCCA	2	8	124030	124037	25 %	0 %	25 %	50 %	383181879
2620	NC_016833	TGC	2	6	124173	124178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181879
2621	NC_016833	TAC	2	6	124181	124186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181879
2622	NC_016833	CGTC	2	8	124208	124215	0 %	25 %	25 %	50 %	383181879
2623	NC_016833	CGC	2	6	124360	124365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383181879
2624	NC_016833	GGT	2	6	124424	124429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181879
2625	NC_016833	TG	3	6	124430	124435	0 %	50 %	50 %	0 %	383181879
2626	NC_016833	GAA	2	6	124474	124479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383181879
2627	NC_016833	AAC	2	6	124481	124486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181879
2628	NC_016833	GCTG	2	8	124519	124526	0 %	25 %	50 %	25 %	383181879
2629	NC_016833	AAGGT	2	10	124578	124587	40 %	20 %	40 %	0 %	383181879
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