MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella sonnei 53G plasmid A

Total Repeats: 4547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016833	TAG	2	6	213683	213688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_016833	ATA	2	6	213958	213963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_016833	AGG	2	6	214064	214069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_016833	TGA	2	6	214112	214117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_016833	GTT	2	6	214135	214140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_016833	TGAT	2	8	214158	214165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_016833	GA	3	6	214177	214182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_016833	AAG	2	6	214185	214190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_016833	AGGT	2	8	214247	214254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_016833	T	8	8	214299	214306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_016833	AATA	2	8	214323	214330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_016833	TAA	2	6	214334	214339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_016833	TTAA	2	8	214371	214378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_016833	AAT	2	6	214379	214384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_016833	AAG	2	6	214414	214419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_016833	A	6	6	214438	214443	100 %	0 %	0 %	0 %	383181985
4517	NC_016833	TAC	2	6	214503	214508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181985
4518	NC_016833	ACTA	2	8	214519	214526	50 %	25 %	0 %	25 %	383181985
4519	NC_016833	ACA	2	6	214544	214549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383181985
4520	NC_016833	CAAAA	2	10	214584	214593	80 %	0 %	0 %	20 %	383181985
4521	NC_016833	ATC	2	6	214604	214609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181985
4522	NC_016833	AAGG	2	8	214612	214619	50 %	0 %	50 %	0 %	383181985
4523	NC_016833	G	6	6	214618	214623	0 %	0 %	100 %	0 %	383181985
4524	NC_016833	ACTGG	2	10	214638	214647	20 %	20 %	40 %	20 %	383181985
4525	NC_016833	ACT	2	6	214729	214734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383181985
4526	NC_016833	AGCA	2	8	214749	214756	50 %	0 %	25 %	25 %	383181985
4527	NC_016833	GACC	2	8	214800	214807	25 %	0 %	25 %	50 %	383181985
4528	NC_016833	GGTT	2	8	214867	214874	0 %	50 %	50 %	0 %	383181985
4529	NC_016833	AAT	2	6	214879	214884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181985
4530	NC_016833	AG	3	6	214920	214925	50 %	0 %	50 %	0 %	383181985
4531	NC_016833	GGGA	2	8	214947	214954	25 %	0 %	75 %	0 %	383181985
4532	NC_016833	G	6	6	214975	214980	0 %	0 %	100 %	0 %	383181985
4533	NC_016833	A	6	6	214990	214995	100 %	0 %	0 %	0 %	383181985
4534	NC_016833	GTG	2	6	215009	215014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383181985
4535	NC_016833	GTTC	2	8	215125	215132	0 %	50 %	25 %	25 %	383181985
4536	NC_016833	A	6	6	215184	215189	100 %	0 %	0 %	0 %	383181985
4537	NC_016833	TGC	2	6	215208	215213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383181985
4538	NC_016833	TA	3	6	215251	215256	50 %	50 %	0 %	0 %	383181985
4539	NC_016833	TAA	2	6	215280	215285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383181985
4540	NC_016833	A	6	6	215284	215289	100 %	0 %	0 %	0 %	383181985
4541	NC_016833	AT	3	6	215321	215326	50 %	50 %	0 %	0 %	383181985
4542	NC_016833	AT	3	6	215358	215363	50 %	50 %	0 %	0 %	383181985
4543	NC_016833	T	6	6	215396	215401	0 %	100 %	0 %	0 %	383181985
4544	NC_016833	GCC	2	6	215445	215450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_016833	A	6	6	215593	215598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_016833	ATC	2	6	215671	215676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_016833	CTA	2	6	215728	215733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.