MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016832	GTC	2	6	117247	117252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_016832	GGA	2	6	117301	117306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016832	TGT	3	9	117313	117321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958243
2504	NC_016832	CG	3	6	117353	117358	0 %	0 %	50 %	50 %	378958243
2505	NC_016832	CGC	2	6	117432	117437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958243
2506	NC_016832	GCC	2	6	117465	117470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958243
2507	NC_016832	CG	3	6	117483	117488	0 %	0 %	50 %	50 %	378958243
2508	NC_016832	TGT	2	6	117496	117501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958243
2509	NC_016832	CG	3	6	117599	117604	0 %	0 %	50 %	50 %	378958243
2510	NC_016832	CTGA	2	8	117615	117622	25 %	25 %	25 %	25 %	378958243
2511	NC_016832	ATAGCG	2	12	117631	117642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378958243
2512	NC_016832	ATG	2	6	117673	117678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958243
2513	NC_016832	ATGA	2	8	117712	117719	50 %	25 %	25 %	0 %	378958243
2514	NC_016832	GTTC	2	8	117720	117727	0 %	50 %	25 %	25 %	378958243
2515	NC_016832	ATG	2	6	117811	117816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_016832	TA	3	6	117821	117826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_016832	CAG	2	6	117827	117832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_016832	TTTA	2	8	117869	117876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_016832	A	6	6	117984	117989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_016832	T	6	6	117996	118001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_016832	GTTT	2	8	118002	118009	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_016832	TAAT	2	8	118010	118017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_016832	ATA	2	6	118067	118072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016832	TAAA	2	8	118093	118100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016832	TCG	2	6	118120	118125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_016832	CT	3	6	118130	118135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_016832	TAATT	2	10	118139	118148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_016832	ATTTT	2	10	118165	118174	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_016832	CGGGTG	2	12	118181	118192	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2530	NC_016832	T	6	6	118327	118332	0 %	100 %	0 %	0 %	378958244
2531	NC_016832	ACAGA	2	10	118348	118357	60 %	0 %	20 %	20 %	378958244
2532	NC_016832	ATT	2	6	118372	118377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958244
2533	NC_016832	T	7	7	118392	118398	0 %	100 %	0 %	0 %	378958244
2534	NC_016832	ATT	2	6	118441	118446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958244
2535	NC_016832	CAA	2	6	118478	118483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958244
2536	NC_016832	TTC	2	6	118498	118503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958244
2537	NC_016832	GGAA	2	8	118512	118519	50 %	0 %	50 %	0 %	378958244
2538	NC_016832	ATA	2	6	118541	118546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958244
2539	NC_016832	AT	3	6	118599	118604	50 %	50 %	0 %	0 %	378958244
2540	NC_016832	TCA	2	6	118617	118622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958244
2541	NC_016832	C	6	6	118628	118633	0 %	0 %	0 %	100 %	378958244
2542	NC_016832	CAG	2	6	118707	118712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958245
2543	NC_016832	TGC	2	6	118717	118722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958245
2544	NC_016832	GCG	2	6	118736	118741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958245
2545	NC_016832	GGC	2	6	118748	118753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958245
2546	NC_016832	AGA	2	6	118754	118759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958245
2547	NC_016832	CTT	2	6	118775	118780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958245
2548	NC_016832	GCG	2	6	118870	118875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958245
2549	NC_016832	CAA	2	6	118901	118906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958245
2550	NC_016832	GTGG	2	8	118998	119005	0 %	25 %	75 %	0 %	378958245
2551	NC_016832	GT	3	6	119065	119070	0 %	50 %	50 %	0 %	378958245
2552	NC_016832	TGC	2	6	119075	119080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958245
2553	NC_016832	GAC	2	6	119128	119133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958245
2554	NC_016832	ACC	3	9	119176	119184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958245
2555	NC_016832	CGC	2	6	119240	119245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958245
2556	NC_016832	TCT	2	6	119341	119346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958245
2557	NC_016832	CAGCG	2	10	119523	119532	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
2558	NC_016832	ATCA	2	8	119564	119571	50 %	25 %	0 %	25 %	378958246
2559	NC_016832	GC	3	6	119650	119655	0 %	0 %	50 %	50 %	378958246
2560	NC_016832	GCCA	2	8	119657	119664	25 %	0 %	25 %	50 %	378958246
2561	NC_016832	GCG	2	6	119746	119751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958246
2562	NC_016832	CAG	2	6	119777	119782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2563	NC_016832	CGA	2	6	119815	119820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2564	NC_016832	GCCGG	2	10	119823	119832	0 %	0 %	60 %	40 %	378958246
2565	NC_016832	GCC	2	6	119870	119875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2566	NC_016832	AC	3	6	119930	119935	50 %	0 %	0 %	50 %	378958246
2567	NC_016832	CGAGC	2	10	119948	119957	20 %	0 %	40 %	40 %	378958246
2568	NC_016832	TCC	2	6	119994	119999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958246
2569	NC_016832	GCC	2	6	120011	120016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2570	NC_016832	GCG	2	6	120057	120062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958246
2571	NC_016832	CTG	2	6	120098	120103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2572	NC_016832	GTT	2	6	120133	120138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958246
2573	NC_016832	AGT	3	9	120161	120169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958246
2574	NC_016832	GCC	2	6	120182	120187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2575	NC_016832	GC	3	6	120221	120226	0 %	0 %	50 %	50 %	378958246
2576	NC_016832	GGCG	2	8	120269	120276	0 %	0 %	75 %	25 %	378958246
2577	NC_016832	GCT	2	6	120287	120292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2578	NC_016832	TCGCCG	2	12	120321	120332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378958246
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2580	NC_016832	ATTTG	2	10	120391	120400	20 %	60 %	20 %	0 %	378958246
2581	NC_016832	GTCA	2	8	120419	120426	25 %	25 %	25 %	25 %	378958246
2582	NC_016832	GAC	2	6	120554	120559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2583	NC_016832	TGC	2	6	120564	120569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958246
2584	NC_016832	CG	3	6	120579	120584	0 %	0 %	50 %	50 %	378958246
2585	NC_016832	GCC	2	6	120605	120610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958246
2586	NC_016832	GGTTCA	2	12	120622	120633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378958246
2587	NC_016832	GCG	2	6	120666	120671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958246
2588	NC_016832	AGT	2	6	120693	120698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958246
2589	NC_016832	ACC	2	6	120762	120767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958246
2590	NC_016832	GCTG	2	8	120946	120953	0 %	25 %	50 %	25 %	378958246
2591	NC_016832	TGT	2	6	121069	121074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958247
2592	NC_016832	CTG	2	6	121092	121097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2593	NC_016832	GCG	2	6	121101	121106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2594	NC_016832	GGC	2	6	121185	121190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2595	NC_016832	CGG	2	6	121220	121225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2596	NC_016832	GCG	2	6	121234	121239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2597	NC_016832	CGA	2	6	121265	121270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2598	NC_016832	GCA	2	6	121296	121301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2599	NC_016832	GCC	2	6	121335	121340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958247
2600	NC_016832	GC	5	10	121396	121405	0 %	0 %	50 %	50 %	378958247
2601	NC_016832	CAC	2	6	121533	121538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958247
2602	NC_016832	GCT	2	6	121595	121600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2603	NC_016832	CTGG	2	8	121602	121609	0 %	25 %	50 %	25 %	378958247
2604	NC_016832	TGC	2	6	121636	121641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
2605	NC_016832	GTT	2	6	121649	121654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958247
2606	NC_016832	CAC	2	6	121740	121745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958247
2607	NC_016832	CGC	2	6	121901	121906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958247
2608	NC_016832	CAC	2	6	121914	121919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958247
2609	NC_016832	CGG	2	6	121979	121984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
2610	NC_016832	TCA	2	6	122041	122046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958247
2611	NC_016832	AAG	2	6	122047	122052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958247
2612	NC_016832	GGC	2	6	122059	122064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
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2616	NC_016832	CA	3	6	122171	122176	50 %	0 %	0 %	50 %	378958247
2617	NC_016832	CGG	2	6	122192	122197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
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2619	NC_016832	AGT	2	6	122285	122290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958247
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2622	NC_016832	CGG	2	6	122342	122347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958247
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2624	NC_016832	CG	3	6	122549	122554	0 %	0 %	50 %	50 %	378958247
2625	NC_016832	GAT	2	6	122555	122560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958247
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2629	NC_016832	TCG	2	6	122638	122643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958247
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2631	NC_016832	CAATTG	2	12	122699	122710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378958247
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2633	NC_016832	AG	3	6	122755	122760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_016832	CAGG	2	8	122777	122784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_016832	AATGCT	2	12	122807	122818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2638	NC_016832	TCT	2	6	123024	123029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2639	NC_016832	G	6	6	123039	123044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_016832	T	7	7	123153	123159	0 %	100 %	0 %	0 %	378958248
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2991	NC_016832	CGT	2	6	139428	139433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958263
2992	NC_016832	CG	3	6	139442	139447	0 %	0 %	50 %	50 %	378958263
2993	NC_016832	GAC	2	6	139483	139488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958264
2994	NC_016832	CAGG	2	8	139553	139560	25 %	0 %	50 %	25 %	378958264
2995	NC_016832	CCCAA	2	10	139592	139601	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2996	NC_016832	ATC	2	6	139603	139608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_016832	T	8	8	139617	139624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_016832	AAAGC	2	10	139820	139829	60 %	0 %	20 %	20 %	378958265
2999	NC_016832	CTG	2	6	140030	140035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958265
3000	NC_016832	CCG	2	6	140132	140137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958265

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