MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_016832	GCG	2	6	1066325	1066330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959135
23003	NC_016832	CAT	2	6	1066413	1066418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959135
23004	NC_016832	TGT	2	6	1066449	1066454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959135
23005	NC_016832	ATG	3	9	1066460	1066468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959135
23006	NC_016832	GCG	2	6	1066528	1066533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959135
23007	NC_016832	TGA	2	6	1066683	1066688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959135
23008	NC_016832	GGC	2	6	1066692	1066697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959135
23009	NC_016832	TGC	2	6	1066711	1066716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23010	NC_016832	CGG	2	6	1066724	1066729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23011	NC_016832	ATT	2	6	1066750	1066755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959136
23012	NC_016832	GAT	2	6	1066858	1066863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959136
23013	NC_016832	ATC	2	6	1066906	1066911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959136
23014	NC_016832	GAA	2	6	1066959	1066964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378959136
23015	NC_016832	GC	3	6	1066993	1066998	0 %	0 %	50 %	50 %	378959136
23016	NC_016832	CGC	2	6	1067013	1067018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959136
23017	NC_016832	GTC	2	6	1067074	1067079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959136
23018	NC_016832	GCAG	2	8	1067151	1067158	25 %	0 %	50 %	25 %	378959136
23019	NC_016832	CGC	2	6	1067160	1067165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959136
23020	NC_016832	ATT	2	6	1067266	1067271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959137
23021	NC_016832	TAAT	2	8	1067314	1067321	50 %	50 %	0 %	0 %	378959137
23022	NC_016832	GGCG	2	8	1067348	1067355	0 %	0 %	75 %	25 %	378959137
23023	NC_016832	TTC	2	6	1067441	1067446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959137
23024	NC_016832	CTT	2	6	1067482	1067487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959137
23025	NC_016832	CGGG	2	8	1067568	1067575	0 %	0 %	75 %	25 %	378959137
23026	NC_016832	ATG	2	6	1067586	1067591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959137
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23028	NC_016832	CGA	2	6	1067628	1067633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959137
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23030	NC_016832	CCA	2	6	1067713	1067718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378959137
23031	NC_016832	TCA	2	6	1067724	1067729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959137
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23033	NC_016832	T	6	6	1067858	1067863	0 %	100 %	0 %	0 %	378959137
23034	NC_016832	ATT	2	6	1067878	1067883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23035	NC_016832	AAAT	2	8	1067886	1067893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23036	NC_016832	TATT	2	8	1067900	1067907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23037	NC_016832	TTG	2	6	1067984	1067989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23038	NC_016832	GGA	2	6	1068015	1068020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23039	NC_016832	GGT	2	6	1068026	1068031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23040	NC_016832	CT	3	6	1068049	1068054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23041	NC_016832	ACG	2	6	1068071	1068076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959138
23042	NC_016832	TGA	2	6	1068081	1068086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959138
23043	NC_016832	TAT	2	6	1068138	1068143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959138
23044	NC_016832	TTA	2	6	1068155	1068160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959138
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23049	NC_016832	A	7	7	1068411	1068417	100 %	0 %	0 %	0 %	378959138
23050	NC_016832	GAT	2	6	1068426	1068431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959138
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23052	NC_016832	GCTG	2	8	1068479	1068486	0 %	25 %	50 %	25 %	378959138
23053	NC_016832	GTT	2	6	1068492	1068497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959138
23054	NC_016832	AT	5	10	1068509	1068518	50 %	50 %	0 %	0 %	378959138
23055	NC_016832	TGA	2	6	1068522	1068527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959138
23056	NC_016832	GCA	2	6	1068571	1068576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959138
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23058	NC_016832	TAG	2	6	1068615	1068620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959138
23059	NC_016832	TAT	2	6	1068640	1068645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959138
23060	NC_016832	TGT	2	6	1068735	1068740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959138
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23063	NC_016832	TTA	2	6	1068790	1068795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959139
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23069	NC_016832	ATT	2	6	1069149	1069154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959139
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23081	NC_016832	GTAA	2	8	1069668	1069675	50 %	25 %	25 %	0 %	378959139
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23088	NC_016832	ATG	2	6	1070067	1070072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959140
23089	NC_016832	TGA	2	6	1070083	1070088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959140
23090	NC_016832	GGT	2	6	1070107	1070112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959140
23091	NC_016832	GCC	2	6	1070203	1070208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959140
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23100	NC_016832	CTG	2	6	1070552	1070557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959140
23101	NC_016832	TTC	2	6	1070573	1070578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959140
23102	NC_016832	GGC	3	9	1070605	1070613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959140
23103	NC_016832	CGC	2	6	1070688	1070693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959140
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23108	NC_016832	AC	3	6	1070829	1070834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23109	NC_016832	TCA	2	6	1070854	1070859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959141
23110	NC_016832	CAG	2	6	1070873	1070878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959141
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23112	NC_016832	CGCC	2	8	1070977	1070984	0 %	0 %	25 %	75 %	378959141
23113	NC_016832	CG	3	6	1071012	1071017	0 %	0 %	50 %	50 %	378959141
23114	NC_016832	GCG	2	6	1071021	1071026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959141
23115	NC_016832	CAG	2	6	1071035	1071040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959141
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23117	NC_016832	AGA	2	6	1071196	1071201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378959141
23118	NC_016832	TG	3	6	1071349	1071354	0 %	50 %	50 %	0 %	378959141
23119	NC_016832	CAG	3	9	1071422	1071430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959141
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23122	NC_016832	CAT	2	6	1071581	1071586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959141
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23127	NC_016832	GC	3	6	1071765	1071770	0 %	0 %	50 %	50 %	378959142
23128	NC_016832	ATG	2	6	1071784	1071789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959142
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23136	NC_016832	AG	3	6	1072312	1072317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23137	NC_016832	AAACT	2	10	1072359	1072368	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23138	NC_016832	GAT	2	6	1072437	1072442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23173	NC_016832	TGTTT	2	10	1074772	1074781	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23174	NC_016832	TG	3	6	1074782	1074787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23175	NC_016832	CAG	2	6	1074830	1074835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23220	NC_016832	TAC	2	6	1077231	1077236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959146
23221	NC_016832	GTT	2	6	1077267	1077272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959146
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23231	NC_016832	TCA	2	6	1077799	1077804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959147
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23243	NC_016832	T	8	8	1078445	1078452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23335	NC_016832	GA	3	6	1082214	1082219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23352	NC_016832	CGG	2	6	1082771	1082776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959150
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23461	NC_016832	CGG	2	6	1088357	1088362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959156
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23464	NC_016832	ATCGCC	2	12	1088595	1088606	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378959156
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23466	NC_016832	ATTC	2	8	1088745	1088752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23467	NC_016832	GC	3	6	1088877	1088882	0 %	0 %	50 %	50 %	378959157
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23469	NC_016832	GCT	2	6	1089033	1089038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959157
23470	NC_016832	CCA	2	6	1089042	1089047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378959157
23471	NC_016832	GCG	2	6	1089105	1089110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959157
23472	NC_016832	TGG	2	6	1089194	1089199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959157
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23474	NC_016832	GGCGG	2	10	1089242	1089251	0 %	0 %	80 %	20 %	378959157
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23482	NC_016832	TTTA	2	8	1089530	1089537	25 %	75 %	0 %	0 %	378959158
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23488	NC_016832	ATTG	2	8	1089842	1089849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23489	NC_016832	CTT	2	6	1089903	1089908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959159
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23499	NC_016832	CTGG	2	8	1090360	1090367	0 %	25 %	50 %	25 %	378959160
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