MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

< Previous12...4041424344454647484950...200201Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_016832	TTA	2	6	1020694	1020699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22003	NC_016832	ATT	2	6	1020718	1020723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22004	NC_016832	AGC	2	6	1020793	1020798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22005	NC_016832	ACA	2	6	1020852	1020857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22006	NC_016832	T	7	7	1020896	1020902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22007	NC_016832	TTC	2	6	1020995	1021000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959088
22008	NC_016832	TTG	2	6	1021001	1021006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378959088
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22011	NC_016832	TGC	2	6	1021084	1021089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959088
22012	NC_016832	CGT	2	6	1021131	1021136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959088
22013	NC_016832	GGC	2	6	1021165	1021170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959088
22014	NC_016832	AGG	2	6	1021310	1021315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378959088
22015	NC_016832	TTCG	2	8	1021328	1021335	0 %	50 %	25 %	25 %	378959088
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22121	NC_016832	A	8	8	1026979	1026986	100 %	0 %	0 %	0 %	378959094
22122	NC_016832	GCA	2	6	1026988	1026993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
22123	NC_016832	G	6	6	1027046	1027051	0 %	0 %	100 %	0 %	378959094
22124	NC_016832	AGG	2	6	1027085	1027090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378959094
22125	NC_016832	GAC	2	6	1027186	1027191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
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22127	NC_016832	CTGG	2	8	1027337	1027344	0 %	25 %	50 %	25 %	378959094
22128	NC_016832	GCTC	2	8	1027401	1027408	0 %	25 %	25 %	50 %	378959094
22129	NC_016832	TAT	2	6	1027465	1027470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378959094
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22131	NC_016832	GCG	2	6	1027534	1027539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959094
22132	NC_016832	GCA	2	6	1027550	1027555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959094
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22140	NC_016832	CA	3	6	1028261	1028266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22141	NC_016832	TTG	2	6	1028282	1028287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22142	NC_016832	CTGG	2	8	1028295	1028302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22143	NC_016832	GGT	2	6	1028309	1028314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22144	NC_016832	TAA	2	6	1028339	1028344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22145	NC_016832	GCG	2	6	1028400	1028405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22146	NC_016832	A	6	6	1028406	1028411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22149	NC_016832	CTG	2	6	1028535	1028540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22151	NC_016832	CGG	2	6	1028622	1028627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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22153	NC_016832	TG	3	6	1028679	1028684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22154	NC_016832	TCC	2	6	1028721	1028726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22156	NC_016832	CTGC	2	8	1028796	1028803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22157	NC_016832	A	7	7	1028804	1028810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22158	NC_016832	TCA	2	6	1028853	1028858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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22233	NC_016832	TG	3	6	1032586	1032591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22234	NC_016832	TGTAG	2	10	1032602	1032611	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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22236	NC_016832	TAA	2	6	1032703	1032708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22237	NC_016832	ACG	2	6	1032759	1032764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959100
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22240	NC_016832	CAT	2	6	1032904	1032909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378959100
22241	NC_016832	TCC	2	6	1032966	1032971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378959100
22242	NC_016832	TTC	2	6	1032989	1032994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959100
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22249	NC_016832	T	7	7	1033459	1033465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22250	NC_016832	TG	3	6	1033477	1033482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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22252	NC_016832	T	6	6	1033551	1033556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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22350	NC_016832	ATT	2	6	1037744	1037749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22351	NC_016832	AC	3	6	1037784	1037789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22352	NC_016832	TTTA	2	8	1037801	1037808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22353	NC_016832	AGG	2	6	1037863	1037868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22354	NC_016832	ATTA	2	8	1037886	1037893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22355	NC_016832	TAAAA	2	10	1037930	1037939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22356	NC_016832	ATA	2	6	1037957	1037962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22357	NC_016832	TAT	2	6	1037973	1037978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22358	NC_016832	AG	3	6	1037996	1038001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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22360	NC_016832	CAG	2	6	1038038	1038043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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22477	NC_016832	ATG	2	6	1043572	1043577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959112
22478	NC_016832	GTC	2	6	1043616	1043621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959112
22479	NC_016832	GGC	2	6	1043634	1043639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959112
22480	NC_016832	CGG	2	6	1043662	1043667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959112
22481	NC_016832	TCCG	2	8	1043674	1043681	0 %	25 %	25 %	50 %	378959112
22482	NC_016832	GC	3	6	1043731	1043736	0 %	0 %	50 %	50 %	378959112
22483	NC_016832	GCT	2	6	1043798	1043803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959112
22484	NC_016832	GCA	2	6	1043811	1043816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959112
22485	NC_016832	TAA	2	6	1043829	1043834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378959112
22486	NC_016832	CGC	2	6	1043945	1043950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959113
22487	NC_016832	GTC	2	6	1043972	1043977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959113
22488	NC_016832	AAAGT	2	10	1044006	1044015	60 %	20 %	20 %	0 %	378959113
22489	NC_016832	TGA	2	6	1044099	1044104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959114
22490	NC_016832	GGT	2	6	1044143	1044148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959114
22491	NC_016832	TTC	2	6	1044157	1044162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378959114
22492	NC_016832	CAA	2	6	1044212	1044217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378959114
22493	NC_016832	TGC	2	6	1044246	1044251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378959114
22494	NC_016832	CCG	2	6	1044276	1044281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378959114
22495	NC_016832	ATG	3	9	1044287	1044295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378959114
22496	NC_016832	CAG	2	6	1044308	1044313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959114
22497	NC_016832	AGC	2	6	1044314	1044319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378959114
22498	NC_016832	GGC	3	9	1044364	1044372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378959114
22499	NC_016832	GTGCTG	2	12	1044665	1044676	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378959114
22500	NC_016832	TGG	2	6	1044684	1044689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378959114

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