MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

< Previous12...3435363738394041424344...200201Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_016832	GAT	2	6	883183	883188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958939
19003	NC_016832	ATT	2	6	883189	883194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958939
19004	NC_016832	AAC	2	6	883202	883207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958939
19005	NC_016832	TAA	2	6	883246	883251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958939
19006	NC_016832	ATTC	2	8	883265	883272	25 %	50 %	0 %	25 %	378958940
19007	NC_016832	TGC	2	6	883339	883344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958940
19008	NC_016832	TTG	2	6	883359	883364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958940
19009	NC_016832	AGT	2	6	883424	883429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958940
19010	NC_016832	TGC	3	9	883450	883458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958940
19011	NC_016832	T	6	6	883485	883490	0 %	100 %	0 %	0 %	378958940
19012	NC_016832	ATG	2	6	883629	883634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958940
19013	NC_016832	GCT	2	6	883706	883711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958940
19014	NC_016832	TA	3	6	883718	883723	50 %	50 %	0 %	0 %	378958940
19015	NC_016832	TTTA	2	8	883819	883826	25 %	75 %	0 %	0 %	378958940
19016	NC_016832	TGA	2	6	883996	884001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958940
19017	NC_016832	AT	3	6	884025	884030	50 %	50 %	0 %	0 %	378958940
19018	NC_016832	TAT	2	6	884037	884042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958940
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19020	NC_016832	T	6	6	884114	884119	0 %	100 %	0 %	0 %	378958940
19021	NC_016832	T	6	6	884224	884229	0 %	100 %	0 %	0 %	378958940
19022	NC_016832	AAT	2	6	884302	884307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958940
19023	NC_016832	GATG	2	8	884531	884538	25 %	25 %	50 %	0 %	378958940
19024	NC_016832	GC	3	6	884551	884556	0 %	0 %	50 %	50 %	378958940
19025	NC_016832	GCT	2	6	884580	884585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958940
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19028	NC_016832	TATTT	2	10	884699	884708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_016832	ATA	2	6	884744	884749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958941
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19032	NC_016832	GATTT	2	10	884800	884809	20 %	60 %	20 %	0 %	378958941
19033	NC_016832	T	8	8	884807	884814	0 %	100 %	0 %	0 %	378958941
19034	NC_016832	TTA	2	6	884906	884911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958941
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19036	NC_016832	AGT	2	6	884928	884933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958941
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19038	NC_016832	ATTTG	2	10	885036	885045	20 %	60 %	20 %	0 %	378958941
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19043	NC_016832	ATC	2	6	885187	885192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958941
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19045	NC_016832	GAG	2	6	885241	885246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958941
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19048	NC_016832	AAAT	2	8	885299	885306	75 %	25 %	0 %	0 %	378958941
19049	NC_016832	CAT	2	6	885436	885441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958941
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19051	NC_016832	GTTAT	2	10	885523	885532	20 %	60 %	20 %	0 %	378958941
19052	NC_016832	GTC	2	6	885561	885566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958941
19053	NC_016832	TTGT	2	8	885593	885600	0 %	75 %	25 %	0 %	378958941
19054	NC_016832	AAT	3	9	885603	885611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958941
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19056	NC_016832	TGG	2	6	885666	885671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958941
19057	NC_016832	TGA	2	6	885882	885887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958941
19058	NC_016832	TGA	2	6	885975	885980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958941
19059	NC_016832	ATT	3	9	885986	885994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958941
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19061	NC_016832	ATG	2	6	886043	886048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958941
19062	NC_016832	GTT	2	6	886141	886146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958941
19063	NC_016832	GCG	2	6	886149	886154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958941
19064	NC_016832	AAT	3	9	886189	886197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19065	NC_016832	CGT	2	6	886354	886359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958942
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19069	NC_016832	TCG	2	6	886534	886539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958942
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19074	NC_016832	TGG	2	6	886785	886790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958942
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19099	NC_016832	TA	3	6	887890	887895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19100	NC_016832	CAT	2	6	887938	887943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19104	NC_016832	TTG	2	6	888110	888115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958943
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19365	NC_016832	TGG	2	6	900424	900429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958955
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19368	NC_016832	GAT	2	6	900512	900517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958955
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19490	NC_016832	GCT	2	6	906202	906207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958957
19491	NC_016832	CTGC	2	8	906208	906215	0 %	25 %	25 %	50 %	378958957
19492	NC_016832	GC	3	6	906214	906219	0 %	0 %	50 %	50 %	378958957
19493	NC_016832	GC	3	6	906246	906251	0 %	0 %	50 %	50 %	378958957
19494	NC_016832	GCA	2	6	906386	906391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958957
19495	NC_016832	GCG	2	6	906421	906426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958957
19496	NC_016832	CGGTGA	2	12	906485	906496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378958957
19497	NC_016832	AATG	2	8	906545	906552	50 %	25 %	25 %	0 %	378958957
19498	NC_016832	GCA	2	6	906563	906568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958957
19499	NC_016832	GCTC	2	8	906604	906611	0 %	25 %	25 %	50 %	378958957
19500	NC_016832	TGA	2	6	906709	906714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958957

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