MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

< Previous12...2829303132333435363738...200201Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_016832	GGA	2	6	745975	745980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958811
16003	NC_016832	GCG	2	6	745994	745999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958811
16004	NC_016832	AATAA	2	10	746087	746096	80 %	20 %	0 %	0 %	378958812
16005	NC_016832	CG	3	6	746151	746156	0 %	0 %	50 %	50 %	378958812
16006	NC_016832	CGG	2	6	746170	746175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958812
16007	NC_016832	GGCT	2	8	746244	746251	0 %	25 %	50 %	25 %	378958812
16008	NC_016832	GCC	2	6	746426	746431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958812
16009	NC_016832	TGGC	2	8	746529	746536	0 %	25 %	50 %	25 %	378958812
16010	NC_016832	TG	3	6	746547	746552	0 %	50 %	50 %	0 %	378958812
16011	NC_016832	TCG	2	6	746598	746603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958812
16012	NC_016832	CTG	2	6	746659	746664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958812
16013	NC_016832	GC	3	6	746674	746679	0 %	0 %	50 %	50 %	378958812
16014	NC_016832	TGG	2	6	746686	746691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958812
16015	NC_016832	TCA	2	6	746700	746705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958812
16016	NC_016832	CAGTA	2	10	746727	746736	40 %	20 %	20 %	20 %	378958812
16017	NC_016832	CGG	2	6	746762	746767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958812
16018	NC_016832	GGC	2	6	746804	746809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958812
16019	NC_016832	ATG	2	6	746810	746815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958812
16020	NC_016832	GCT	2	6	746824	746829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958812
16021	NC_016832	GCC	2	6	746834	746839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958812
16022	NC_016832	TTC	2	6	746911	746916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_016832	ATA	2	6	746917	746922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_016832	ATT	2	6	746926	746931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_016832	TCA	2	6	746978	746983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16027	NC_016832	AAT	2	6	747120	747125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_016832	AAG	2	6	747215	747220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958813
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16030	NC_016832	CGC	2	6	747386	747391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958813
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16032	NC_016832	TTC	2	6	747628	747633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958813
16033	NC_016832	CAA	2	6	747667	747672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958813
16034	NC_016832	AAT	2	6	747706	747711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958813
16035	NC_016832	GC	3	6	747751	747756	0 %	0 %	50 %	50 %	378958813
16036	NC_016832	ACG	4	12	747781	747792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958813
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16038	NC_016832	CAT	2	6	747856	747861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958813
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16040	NC_016832	GGC	2	6	747971	747976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958814
16041	NC_016832	GTT	3	9	748079	748087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958814
16042	NC_016832	TGC	2	6	748105	748110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958814
16043	NC_016832	CTG	2	6	748203	748208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958814
16044	NC_016832	ACGCG	2	10	748247	748256	20 %	0 %	40 %	40 %	378958814
16045	NC_016832	TAC	2	6	748315	748320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958814
16046	NC_016832	TGC	2	6	748321	748326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958814
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16048	NC_016832	GC	3	6	748474	748479	0 %	0 %	50 %	50 %	378958814
16049	NC_016832	TGGC	2	8	748484	748491	0 %	25 %	50 %	25 %	378958814
16050	NC_016832	CTG	2	6	748509	748514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958814
16051	NC_016832	GGCT	2	8	748536	748543	0 %	25 %	50 %	25 %	378958814
16052	NC_016832	CTG	2	6	748587	748592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958814
16053	NC_016832	CCTG	2	8	748616	748623	0 %	25 %	25 %	50 %	378958814
16054	NC_016832	GGC	2	6	748639	748644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958814
16055	NC_016832	CTT	2	6	748670	748675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958814
16056	NC_016832	CG	3	6	748687	748692	0 %	0 %	50 %	50 %	378958814
16057	NC_016832	GC	3	6	748699	748704	0 %	0 %	50 %	50 %	378958814
16058	NC_016832	ATT	2	6	748813	748818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958814
16059	NC_016832	TGC	2	6	748819	748824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958814
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16061	NC_016832	TTAT	2	8	748863	748870	25 %	75 %	0 %	0 %	378958814
16062	NC_016832	GC	3	6	749000	749005	0 %	0 %	50 %	50 %	378958814
16063	NC_016832	CATT	2	8	749037	749044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16064	NC_016832	GCC	2	6	749118	749123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16065	NC_016832	GC	3	6	749195	749200	0 %	0 %	50 %	50 %	378958815
16066	NC_016832	CTG	2	6	749297	749302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958815
16067	NC_016832	AATGCG	2	12	749315	749326	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378958815
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16079	NC_016832	TCTG	2	8	749971	749978	0 %	50 %	25 %	25 %	378958815
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16084	NC_016832	AGTT	2	8	750303	750310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_016832	CGC	2	6	750473	750478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16087	NC_016832	TAC	2	6	750522	750527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16088	NC_016832	GC	3	6	750546	750551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16089	NC_016832	TGG	2	6	750586	750591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_016832	T	7	7	750654	750660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_016832	ATA	2	6	750675	750680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_016832	AAG	2	6	750701	750706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958816
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16094	NC_016832	GTG	2	6	750818	750823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958816
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16098	NC_016832	GGT	2	6	751021	751026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958816
16099	NC_016832	TAT	2	6	751079	751084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958816
16100	NC_016832	GACT	2	8	751090	751097	25 %	25 %	25 %	25 %	378958816
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16104	NC_016832	GATG	2	8	751336	751343	25 %	25 %	50 %	0 %	378958816
16105	NC_016832	GGT	2	6	751378	751383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958816
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16109	NC_016832	CGGTA	2	10	751516	751525	20 %	20 %	40 %	20 %	378958816
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16112	NC_016832	GCA	2	6	751831	751836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_016832	TC	3	6	751840	751845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16114	NC_016832	CGT	2	6	751846	751851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_016832	TTG	2	6	751863	751868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_016832	ATT	2	6	751988	751993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_016832	GCA	2	6	752029	752034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_016832	AAG	2	6	752050	752055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_016832	AAG	2	6	752074	752079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_016832	CCA	2	6	752170	752175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16121	NC_016832	TGA	2	6	752228	752233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_016832	CG	5	10	752254	752263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16123	NC_016832	GAT	2	6	752292	752297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_016832	TTA	2	6	752336	752341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_016832	ATC	2	6	752381	752386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_016832	ATT	2	6	752395	752400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_016832	GAA	2	6	752452	752457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_016832	TGGATA	2	12	752531	752542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_016832	GAT	2	6	752553	752558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_016832	TCG	2	6	752738	752743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16131	NC_016832	GTC	2	6	752769	752774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16132	NC_016832	TAA	2	6	752805	752810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_016832	CGAA	2	8	752819	752826	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16134	NC_016832	CGT	2	6	752863	752868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16136	NC_016832	CGG	2	6	753048	753053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16137	NC_016832	A	6	6	753184	753189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16138	NC_016832	ATC	2	6	753199	753204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16229	NC_016832	ATA	3	9	757078	757086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16230	NC_016832	ATA	2	6	757108	757113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16243	NC_016832	CGCC	2	8	757751	757758	0 %	0 %	25 %	75 %	378958822
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16486	NC_016832	ATG	2	6	769220	769225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958835
16487	NC_016832	GC	4	8	769228	769235	0 %	0 %	50 %	50 %	378958835
16488	NC_016832	ATCAGC	2	12	769268	769279	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378958835
16489	NC_016832	GGTC	2	8	769308	769315	0 %	25 %	50 %	25 %	378958835
16490	NC_016832	GC	3	6	769324	769329	0 %	0 %	50 %	50 %	378958835
16491	NC_016832	ATT	2	6	769342	769347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958835
16492	NC_016832	GC	3	6	769451	769456	0 %	0 %	50 %	50 %	378958835
16493	NC_016832	GCG	2	6	769460	769465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958835
16494	NC_016832	GAT	2	6	769488	769493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16495	NC_016832	GTT	2	6	769601	769606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958836
16496	NC_016832	GC	3	6	769660	769665	0 %	0 %	50 %	50 %	378958836
16497	NC_016832	A	6	6	769677	769682	100 %	0 %	0 %	0 %	378958836
16498	NC_016832	GCG	2	6	769683	769688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958836
16499	NC_016832	GC	3	6	769744	769749	0 %	0 %	50 %	50 %	378958836
16500	NC_016832	AAT	2	6	769800	769805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958836

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