MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

< Previous12...2526272829303132333435...200201Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016832	CAG	2	6	677310	677315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958741
14502	NC_016832	T	6	6	677340	677345	0 %	100 %	0 %	0 %	378958741
14503	NC_016832	TTG	2	6	677452	677457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958741
14504	NC_016832	ATA	2	6	677473	677478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958741
14505	NC_016832	GTT	2	6	677592	677597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958741
14506	NC_016832	ACA	2	6	677629	677634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958741
14507	NC_016832	GGT	2	6	677687	677692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958741
14508	NC_016832	AAT	2	6	677700	677705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958741
14509	NC_016832	AT	3	6	677777	677782	50 %	50 %	0 %	0 %	378958742
14510	NC_016832	CAGCG	2	10	677902	677911	20 %	0 %	40 %	40 %	378958742
14511	NC_016832	GCC	2	6	677924	677929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958742
14512	NC_016832	CAT	2	6	677949	677954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958742
14513	NC_016832	ATA	2	6	677980	677985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958742
14514	NC_016832	CCG	2	6	678017	678022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958742
14515	NC_016832	GCT	2	6	678054	678059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14516	NC_016832	GTA	2	6	678072	678077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958742
14517	NC_016832	TCA	2	6	678152	678157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958742
14518	NC_016832	AAGC	2	8	678166	678173	50 %	0 %	25 %	25 %	378958742
14519	NC_016832	GCA	2	6	678282	678287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14520	NC_016832	CG	3	6	678292	678297	0 %	0 %	50 %	50 %	378958742
14521	NC_016832	CGT	2	6	678333	678338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14522	NC_016832	CAG	2	6	678340	678345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14523	NC_016832	GC	3	6	678454	678459	0 %	0 %	50 %	50 %	378958742
14524	NC_016832	TCAT	2	8	678521	678528	25 %	50 %	0 %	25 %	378958742
14525	NC_016832	GTC	2	6	678656	678661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14526	NC_016832	CAG	2	6	678682	678687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14527	NC_016832	TTA	2	6	678746	678751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958742
14528	NC_016832	CAG	2	6	678754	678759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14529	NC_016832	GCA	2	6	678786	678791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14530	NC_016832	GTG	2	6	678944	678949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958742
14531	NC_016832	GGC	2	6	679018	679023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958742
14532	NC_016832	CTG	2	6	679030	679035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14533	NC_016832	TTC	2	6	679037	679042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958742
14534	NC_016832	CTT	2	6	679069	679074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958742
14535	NC_016832	AAT	2	6	679105	679110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958742
14536	NC_016832	TGCG	2	8	679118	679125	0 %	25 %	50 %	25 %	378958742
14537	NC_016832	G	6	6	679125	679130	0 %	0 %	100 %	0 %	378958742
14538	NC_016832	TTA	2	6	679169	679174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958742
14539	NC_016832	TGC	2	6	679199	679204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14540	NC_016832	GAT	2	6	679248	679253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958742
14541	NC_016832	CAG	2	6	679303	679308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14542	NC_016832	GCA	2	6	679317	679322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14543	NC_016832	ATT	2	6	679366	679371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958742
14544	NC_016832	CGC	2	6	679372	679377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958742
14545	NC_016832	TGA	2	6	679412	679417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958742
14546	NC_016832	AACGCC	2	12	679439	679450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378958742
14547	NC_016832	AGC	2	6	679451	679456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14548	NC_016832	CAG	2	6	679465	679470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14549	NC_016832	GCA	2	6	679476	679481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14550	NC_016832	GAG	2	6	679562	679567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958742
14551	NC_016832	CGT	2	6	679636	679641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14552	NC_016832	CGG	2	6	679687	679692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958742
14553	NC_016832	CCA	2	6	679722	679727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958742
14554	NC_016832	GCCAG	2	10	679788	679797	20 %	0 %	40 %	40 %	378958742
14555	NC_016832	GAG	2	6	679808	679813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958742
14556	NC_016832	CTG	2	6	679843	679848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14557	NC_016832	CGG	2	6	679862	679867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958742
14558	NC_016832	CGA	2	6	679872	679877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14559	NC_016832	AG	3	6	679909	679914	50 %	0 %	50 %	0 %	378958742
14560	NC_016832	GGTAG	2	10	679925	679934	20 %	20 %	60 %	0 %	378958742
14561	NC_016832	ATA	2	6	680107	680112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958742
14562	NC_016832	TGT	2	6	680178	680183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958742
14563	NC_016832	GTGA	2	8	680236	680243	25 %	25 %	50 %	0 %	378958742
14564	NC_016832	CAG	2	6	680317	680322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958742
14565	NC_016832	AAG	2	6	680339	680344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958742
14566	NC_016832	GACT	2	8	680399	680406	25 %	25 %	25 %	25 %	378958742
14567	NC_016832	TGAAGG	2	12	680438	680449	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_016832	AATG	2	8	680464	680471	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_016832	CGG	2	6	680520	680525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_016832	ACT	2	6	680571	680576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14571	NC_016832	ATT	2	6	680606	680611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_016832	GT	3	6	680694	680699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_016832	A	7	7	680712	680718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_016832	TAA	2	6	680778	680783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_016832	ATG	2	6	680793	680798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14577	NC_016832	AT	3	6	680897	680902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_016832	A	6	6	680942	680947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_016832	TA	3	6	680977	680982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_016832	ATT	2	6	681028	681033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_016832	A	6	6	681099	681104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_016832	TAA	2	6	681130	681135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_016832	CCT	2	6	681157	681162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958743
14584	NC_016832	CTG	2	6	681173	681178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958743
14585	NC_016832	GGCG	2	8	681181	681188	0 %	0 %	75 %	25 %	378958743
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14591	NC_016832	CCT	2	6	681501	681506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958743
14592	NC_016832	CGG	2	6	681529	681534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958743
14593	NC_016832	GCA	2	6	681562	681567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958743
14594	NC_016832	CTAC	2	8	681585	681592	25 %	25 %	0 %	50 %	378958743
14595	NC_016832	CTT	2	6	681604	681609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958743
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14602	NC_016832	AAC	2	6	681881	681886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958743
14603	NC_016832	ATCT	2	8	681887	681894	25 %	50 %	0 %	25 %	378958743
14604	NC_016832	GCA	2	6	681948	681953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958743
14605	NC_016832	CAA	2	6	681979	681984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958743
14606	NC_016832	CGTC	2	8	682034	682041	0 %	25 %	25 %	50 %	378958743
14607	NC_016832	TAC	2	6	682142	682147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958743
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14609	NC_016832	CTG	2	6	682190	682195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958743
14610	NC_016832	CGA	2	6	682234	682239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958743
14611	NC_016832	T	6	6	682309	682314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_016832	ACG	2	6	682339	682344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_016832	GT	3	6	682412	682417	0 %	50 %	50 %	0 %	378958744
14614	NC_016832	T	6	6	682429	682434	0 %	100 %	0 %	0 %	378958744
14615	NC_016832	ACA	2	6	682466	682471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958744
14616	NC_016832	TGGT	2	8	682533	682540	0 %	50 %	50 %	0 %	378958744
14617	NC_016832	TGA	2	6	682597	682602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958744
14618	NC_016832	GACG	2	8	682732	682739	25 %	0 %	50 %	25 %	378958744
14619	NC_016832	TC	3	6	682930	682935	0 %	50 %	0 %	50 %	378958744
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14621	NC_016832	ATC	2	6	682962	682967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958744
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14623	NC_016832	GCG	2	6	683019	683024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958744
14624	NC_016832	CCGA	2	8	683084	683091	25 %	0 %	25 %	50 %	378958744
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14735	NC_016832	TA	3	6	687861	687866	50 %	50 %	0 %	0 %	378958749
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14857	NC_016832	TGA	2	6	694042	694047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14863	NC_016832	CGG	2	6	694215	694220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958757
14864	NC_016832	CTG	2	6	694279	694284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958757
14865	NC_016832	GC	3	6	694361	694366	0 %	0 %	50 %	50 %	378958757
14866	NC_016832	GCA	2	6	694440	694445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958757
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14869	NC_016832	GC	3	6	694537	694542	0 %	0 %	50 %	50 %	378958757
14870	NC_016832	CGG	2	6	694549	694554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958757
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14877	NC_016832	TCT	2	6	694681	694686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14977	NC_016832	TGGC	2	8	697554	697561	0 %	25 %	50 %	25 %	378958762
14978	NC_016832	CTG	2	6	697572	697577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14979	NC_016832	GC	3	6	697601	697606	0 %	0 %	50 %	50 %	378958762
14980	NC_016832	GCT	2	6	697625	697630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14981	NC_016832	CTG	2	6	697659	697664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14982	NC_016832	GC	3	6	697725	697730	0 %	0 %	50 %	50 %	378958762
14983	NC_016832	CGG	2	6	697766	697771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
14984	NC_016832	GCT	3	9	697775	697783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14985	NC_016832	AAC	2	6	697821	697826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958762
14986	NC_016832	GCT	3	9	697847	697855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14987	NC_016832	CAA	2	6	697859	697864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958762
14988	NC_016832	CTG	2	6	697869	697874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14989	NC_016832	GCC	2	6	697878	697883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958762
14990	NC_016832	TGG	2	6	697888	697893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958762
14991	NC_016832	TGC	2	6	697894	697899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14992	NC_016832	CTG	2	6	697908	697913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14993	NC_016832	GCTGGG	2	12	697931	697942	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378958762
14994	NC_016832	CTG	3	9	698007	698015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14995	NC_016832	CTG	2	6	698070	698075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14996	NC_016832	GCT	2	6	698123	698128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762
14997	NC_016832	ATC	2	6	698139	698144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958762
14998	NC_016832	CGG	2	6	698152	698157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958762
14999	NC_016832	GATGGC	2	12	698162	698173	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378958762
15000	NC_016832	CTG	2	6	698174	698179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958762

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