MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

< Previous12...2425262728293031323334...200201Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016832	CTTCA	2	10	654353	654362	20 %	40 %	0 %	40 %	378958726
14002	NC_016832	GCC	2	6	654380	654385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958726
14003	NC_016832	GGC	2	6	654441	654446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958726
14004	NC_016832	GCA	2	6	654454	654459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958726
14005	NC_016832	GC	3	6	654466	654471	0 %	0 %	50 %	50 %	378958726
14006	NC_016832	CGTT	2	8	654480	654487	0 %	50 %	25 %	25 %	378958726
14007	NC_016832	ATG	2	6	654534	654539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958726
14008	NC_016832	CGT	2	6	654574	654579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958726
14009	NC_016832	CAG	2	6	654581	654586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958726
14010	NC_016832	TTC	2	6	654596	654601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958726
14011	NC_016832	CG	3	6	654615	654620	0 %	0 %	50 %	50 %	378958726
14012	NC_016832	CG	3	6	654629	654634	0 %	0 %	50 %	50 %	378958726
14013	NC_016832	CGA	2	6	654766	654771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958726
14014	NC_016832	GCG	2	6	654847	654852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958726
14015	NC_016832	CTG	2	6	654869	654874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958726
14016	NC_016832	GC	3	6	654892	654897	0 %	0 %	50 %	50 %	378958726
14017	NC_016832	GC	3	6	654949	654954	0 %	0 %	50 %	50 %	378958726
14018	NC_016832	GGC	2	6	654985	654990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958726
14019	NC_016832	CGG	2	6	655006	655011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958726
14020	NC_016832	GGA	2	6	655067	655072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958726
14021	NC_016832	GC	3	6	655081	655086	0 %	0 %	50 %	50 %	378958726
14022	NC_016832	TGC	2	6	655122	655127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958726
14023	NC_016832	CCG	2	6	655161	655166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958726
14024	NC_016832	ATA	2	6	655170	655175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958726
14025	NC_016832	AG	3	6	655314	655319	50 %	0 %	50 %	0 %	378958727
14026	NC_016832	GTC	2	6	655342	655347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958727
14027	NC_016832	CG	3	6	655374	655379	0 %	0 %	50 %	50 %	378958727
14028	NC_016832	CAG	2	6	655440	655445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958727
14029	NC_016832	CCG	2	6	655487	655492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958727
14030	NC_016832	GGC	2	6	655529	655534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958727
14031	NC_016832	CCG	2	6	655577	655582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958727
14032	NC_016832	GCG	2	6	655592	655597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958727
14033	NC_016832	CCG	2	6	655664	655669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958727
14034	NC_016832	GTCG	2	8	655710	655717	0 %	25 %	50 %	25 %	378958727
14035	NC_016832	CCG	2	6	655753	655758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958727
14036	NC_016832	AAC	2	6	655804	655809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958727
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14038	NC_016832	GCGG	2	8	655862	655869	0 %	0 %	75 %	25 %	378958727
14039	NC_016832	CG	3	6	655881	655886	0 %	0 %	50 %	50 %	378958727
14040	NC_016832	GCA	2	6	655934	655939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958727
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14042	NC_016832	ACC	3	9	656194	656202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958727
14043	NC_016832	CGC	2	6	656252	656257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958727
14044	NC_016832	GGC	2	6	656343	656348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958727
14045	NC_016832	GAT	2	6	656424	656429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958727
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14047	NC_016832	TGCC	2	8	656465	656472	0 %	25 %	25 %	50 %	378958727
14048	NC_016832	TAA	2	6	656528	656533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958727
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14050	NC_016832	CG	4	8	656603	656610	0 %	0 %	50 %	50 %	378958727
14051	NC_016832	GCA	2	6	656648	656653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958727
14052	NC_016832	CCA	2	6	656699	656704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958727
14053	NC_016832	GC	3	6	656726	656731	0 %	0 %	50 %	50 %	378958727
14054	NC_016832	CTTG	2	8	656785	656792	0 %	50 %	25 %	25 %	378958727
14055	NC_016832	T	6	6	656830	656835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_016832	CG	3	6	656874	656879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14057	NC_016832	AGC	2	6	656973	656978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_016832	GTT	2	6	656982	656987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_016832	GAAC	2	8	656989	656996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_016832	TAAA	2	8	657012	657019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_016832	GC	3	6	657076	657081	0 %	0 %	50 %	50 %	378958728
14062	NC_016832	GCG	2	6	657088	657093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958728
14063	NC_016832	TAT	2	6	657163	657168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958728
14064	NC_016832	CG	3	6	657317	657322	0 %	0 %	50 %	50 %	378958728
14065	NC_016832	GCA	2	6	657352	657357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958728
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14070	NC_016832	GCG	2	6	657503	657508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958728
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14073	NC_016832	CTG	2	6	657571	657576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958728
14074	NC_016832	GCG	2	6	657604	657609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958728
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14081	NC_016832	TATCGC	2	12	657813	657824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378958728
14082	NC_016832	CTG	2	6	657841	657846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958728
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14087	NC_016832	GGCA	2	8	658071	658078	25 %	0 %	50 %	25 %	378958728
14088	NC_016832	ATC	2	6	658108	658113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958728
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14092	NC_016832	CTT	2	6	658269	658274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958728
14093	NC_016832	GGC	2	6	658285	658290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958728
14094	NC_016832	TGA	2	6	658298	658303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958728
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14096	NC_016832	TGA	2	6	658343	658348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958728
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14102	NC_016832	TGA	2	6	658596	658601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958729
14103	NC_016832	GAC	2	6	658607	658612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958729
14104	NC_016832	GTC	2	6	658619	658624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958729
14105	NC_016832	TGAC	2	8	658650	658657	25 %	25 %	25 %	25 %	378958729
14106	NC_016832	A	6	6	658775	658780	100 %	0 %	0 %	0 %	378958729
14107	NC_016832	CAT	2	6	658928	658933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958729
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14110	NC_016832	GGAT	2	8	659076	659083	25 %	25 %	50 %	0 %	378958729
14111	NC_016832	CAG	2	6	659129	659134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958729
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14114	NC_016832	A	7	7	659463	659469	100 %	0 %	0 %	0 %	378958729
14115	NC_016832	TAG	2	6	659487	659492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_016832	TCA	2	6	659574	659579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14119	NC_016832	CTTC	2	8	659650	659657	0 %	50 %	0 %	50 %	378958730
14120	NC_016832	CGG	2	6	659661	659666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958730
14121	NC_016832	AAC	2	6	659857	659862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958730
14122	NC_016832	ATA	2	6	659866	659871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958730
14123	NC_016832	TTC	2	6	659919	659924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958730
14124	NC_016832	GCC	2	6	659944	659949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958730
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14128	NC_016832	AAT	2	6	660069	660074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958730
14129	NC_016832	GAT	2	6	660116	660121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958730
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14132	NC_016832	CG	3	6	660258	660263	0 %	0 %	50 %	50 %	378958730
14133	NC_016832	CGG	3	9	660287	660295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958730
14134	NC_016832	ACG	2	6	660312	660317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958730
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14139	NC_016832	TGAGC	2	10	660586	660595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14140	NC_016832	TGCG	2	8	660602	660609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14141	NC_016832	GAAA	2	8	660634	660641	75 %	0 %	25 %	0 %	378958731
14142	NC_016832	TAT	2	6	660685	660690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958731
14143	NC_016832	T	6	6	660692	660697	0 %	100 %	0 %	0 %	378958731
14144	NC_016832	T	6	6	660699	660704	0 %	100 %	0 %	0 %	378958731
14145	NC_016832	TTA	2	6	660719	660724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958731
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14155	NC_016832	GGC	3	9	661351	661359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958731
14156	NC_016832	CTG	2	6	661370	661375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958731
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14159	NC_016832	TGT	2	6	661447	661452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958731
14160	NC_016832	TGG	2	6	661485	661490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958731
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14174	NC_016832	TCG	2	6	662100	662105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958733
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14231	NC_016832	ACGC	2	8	664959	664966	25 %	0 %	25 %	50 %	378958734
14232	NC_016832	ATG	2	6	664972	664977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958734
14233	NC_016832	CAGG	2	8	665067	665074	25 %	0 %	50 %	25 %	378958734
14234	NC_016832	GC	3	6	665099	665104	0 %	0 %	50 %	50 %	378958734
14235	NC_016832	GCT	2	6	665156	665161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958734
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14237	NC_016832	CAG	2	6	665247	665252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958734
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14239	NC_016832	GCGG	2	8	665305	665312	0 %	0 %	75 %	25 %	378958734
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14485	NC_016832	ATC	2	6	676618	676623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958740
14486	NC_016832	CGC	2	6	676632	676637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958740
14487	NC_016832	ATG	2	6	676687	676692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958740
14488	NC_016832	GTC	2	6	676818	676823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958740
14489	NC_016832	AAC	2	6	676855	676860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958740
14490	NC_016832	A	6	6	676969	676974	100 %	0 %	0 %	0 %	378958740
14491	NC_016832	GGC	2	6	676983	676988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14492	NC_016832	TGTC	2	8	677081	677088	0 %	50 %	25 %	25 %	378958741
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14494	NC_016832	AGC	2	6	677119	677124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958741
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14496	NC_016832	TCT	2	6	677165	677170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958741
14497	NC_016832	GCT	2	6	677172	677177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958741
14498	NC_016832	TGC	2	6	677189	677194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958741
14499	NC_016832	CTT	2	6	677202	677207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958741
14500	NC_016832	CT	3	6	677257	677262	0 %	50 %	0 %	50 %	378958741

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