MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016832	GC	3	6	630263	630268	0 %	0 %	50 %	50 %	378958702
13502	NC_016832	ATGA	2	8	630310	630317	50 %	25 %	25 %	0 %	378958702
13503	NC_016832	GGTCT	2	10	630322	630331	0 %	40 %	40 %	20 %	378958702
13504	NC_016832	GCA	2	6	630333	630338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13505	NC_016832	TGG	2	6	630352	630357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958702
13506	NC_016832	TTC	2	6	630421	630426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958702
13507	NC_016832	GAA	2	6	630472	630477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958702
13508	NC_016832	A	6	6	630481	630486	100 %	0 %	0 %	0 %	378958702
13509	NC_016832	GCA	2	6	630606	630611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13510	NC_016832	GTC	2	6	630622	630627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13511	NC_016832	GGCA	2	8	630668	630675	25 %	0 %	50 %	25 %	378958702
13512	NC_016832	GTC	2	6	630719	630724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13513	NC_016832	CGG	2	6	630791	630796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958702
13514	NC_016832	GTG	2	6	630810	630815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958702
13515	NC_016832	GGT	2	6	630855	630860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958702
13516	NC_016832	TGG	2	6	630953	630958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958702
13517	NC_016832	GCCG	2	8	630987	630994	0 %	0 %	50 %	50 %	378958702
13518	NC_016832	GCG	2	6	631051	631056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958702
13519	NC_016832	GC	3	6	631065	631070	0 %	0 %	50 %	50 %	378958702
13520	NC_016832	TCG	2	6	631094	631099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13521	NC_016832	TAC	2	6	631139	631144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958702
13522	NC_016832	CAA	2	6	631179	631184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958702
13523	NC_016832	CGG	2	6	631188	631193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958702
13524	NC_016832	CTG	2	6	631207	631212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13525	NC_016832	CGC	2	6	631217	631222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958702
13526	NC_016832	GCC	2	6	631279	631284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958702
13527	NC_016832	ATC	2	6	631301	631306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958702
13528	NC_016832	GAA	2	6	631321	631326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958702
13529	NC_016832	GCTG	2	8	631338	631345	0 %	25 %	50 %	25 %	378958702
13530	NC_016832	TGG	2	6	631382	631387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958702
13531	NC_016832	GC	3	6	631403	631408	0 %	0 %	50 %	50 %	378958702
13532	NC_016832	GCA	2	6	631416	631421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958702
13533	NC_016832	ATG	2	6	631446	631451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958702
13534	NC_016832	GCA	2	6	631460	631465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958703
13535	NC_016832	CGG	2	6	631619	631624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958703
13536	NC_016832	TCA	2	6	631636	631641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958703
13537	NC_016832	GC	3	6	631649	631654	0 %	0 %	50 %	50 %	378958703
13538	NC_016832	ACA	2	6	631669	631674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958703
13539	NC_016832	TGGT	2	8	631686	631693	0 %	50 %	50 %	0 %	378958703
13540	NC_016832	GGC	2	6	631707	631712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958703
13541	NC_016832	GAT	2	6	631721	631726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958703
13542	NC_016832	TGG	2	6	631762	631767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958703
13543	NC_016832	GC	4	8	631803	631810	0 %	0 %	50 %	50 %	378958703
13544	NC_016832	CAG	2	6	631890	631895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958703
13545	NC_016832	GCA	2	6	631919	631924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958703
13546	NC_016832	AGGC	2	8	631926	631933	25 %	0 %	50 %	25 %	378958703
13547	NC_016832	GCTG	2	8	631970	631977	0 %	25 %	50 %	25 %	378958703
13548	NC_016832	TAT	2	6	632052	632057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958703
13549	NC_016832	GGC	2	6	632105	632110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958703
13550	NC_016832	AC	3	6	632212	632217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13551	NC_016832	TGA	2	6	632230	632235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958704
13552	NC_016832	GAT	2	6	632383	632388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958704
13553	NC_016832	ACG	2	6	632412	632417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958704
13554	NC_016832	ATT	2	6	632432	632437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958704
13555	NC_016832	GCGG	2	8	632468	632475	0 %	0 %	75 %	25 %	378958704
13556	NC_016832	GCG	2	6	632490	632495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958704
13557	NC_016832	CGG	2	6	632500	632505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958704
13558	NC_016832	CGG	2	6	632611	632616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958704
13559	NC_016832	TGC	2	6	632625	632630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958704
13560	NC_016832	ATG	2	6	632633	632638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958704
13561	NC_016832	CGG	2	6	632707	632712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958704
13562	NC_016832	AGA	2	6	632748	632753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958704
13563	NC_016832	GCC	2	6	632778	632783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958704
13564	NC_016832	CGT	2	6	632827	632832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958704
13565	NC_016832	GCG	2	6	632918	632923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958704
13566	NC_016832	GAA	2	6	632999	633004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958704
13567	NC_016832	GC	3	6	633083	633088	0 %	0 %	50 %	50 %	378958705
13568	NC_016832	GGT	2	6	633123	633128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958705
13569	NC_016832	GA	3	6	633203	633208	50 %	0 %	50 %	0 %	378958705
13570	NC_016832	TCAG	2	8	633227	633234	25 %	25 %	25 %	25 %	378958705
13571	NC_016832	GC	3	6	633341	633346	0 %	0 %	50 %	50 %	378958705
13572	NC_016832	ACTG	2	8	633354	633361	25 %	25 %	25 %	25 %	378958705
13573	NC_016832	GGC	2	6	633375	633380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958705
13574	NC_016832	CGCGC	2	10	633388	633397	0 %	0 %	40 %	60 %	378958705
13575	NC_016832	TGG	2	6	633506	633511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958705
13576	NC_016832	TGC	2	6	633518	633523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958705
13577	NC_016832	ATCTGC	2	12	633539	633550	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378958705
13578	NC_016832	CGC	2	6	633575	633580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958705
13579	NC_016832	GAA	2	6	633643	633648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958705
13580	NC_016832	GAT	2	6	633664	633669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958705
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13582	NC_016832	CGG	2	6	633848	633853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958705
13583	NC_016832	TCA	2	6	633854	633859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958705
13584	NC_016832	TCGA	2	8	633865	633872	25 %	25 %	25 %	25 %	378958705
13585	NC_016832	GCC	2	6	633907	633912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958705
13586	NC_016832	CCTGG	2	10	633980	633989	0 %	20 %	40 %	40 %	378958705
13587	NC_016832	TGA	2	6	634014	634019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958705
13588	NC_016832	GC	3	6	634124	634129	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13589	NC_016832	GGCG	2	8	634154	634161	0 %	0 %	75 %	25 %	378958706
13590	NC_016832	CTG	2	6	634200	634205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958706
13591	NC_016832	GCG	2	6	634258	634263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958706
13592	NC_016832	CG	3	6	634262	634267	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13593	NC_016832	GC	3	6	634519	634524	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13594	NC_016832	GCT	2	6	634568	634573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958706
13595	NC_016832	TAT	2	6	634607	634612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958706
13596	NC_016832	GC	3	6	634635	634640	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13597	NC_016832	GGC	2	6	634720	634725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958706
13598	NC_016832	GCG	2	6	634740	634745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958706
13599	NC_016832	CGG	2	6	634769	634774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958706
13600	NC_016832	GCT	2	6	634825	634830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958706
13601	NC_016832	GAT	2	6	634893	634898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958706
13602	NC_016832	GC	3	6	634903	634908	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13603	NC_016832	AG	3	6	634920	634925	50 %	0 %	50 %	0 %	378958706
13604	NC_016832	TCG	2	6	634933	634938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958706
13605	NC_016832	GC	3	6	634955	634960	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13606	NC_016832	CG	3	6	635035	635040	0 %	0 %	50 %	50 %	378958706
13607	NC_016832	GGC	2	6	635080	635085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958706
13608	NC_016832	GCG	3	9	635104	635112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958706
13609	NC_016832	GGA	2	6	635126	635131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958706
13610	NC_016832	TTA	2	6	635143	635148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958706
13611	NC_016832	CAA	2	6	635166	635171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958706
13612	NC_016832	AGA	2	6	635189	635194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958706
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13615	NC_016832	TGGT	2	8	635506	635513	0 %	50 %	50 %	0 %	378958707
13616	NC_016832	GCG	2	6	635570	635575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958707
13617	NC_016832	GTATT	2	10	635658	635667	20 %	60 %	20 %	0 %	378958707
13618	NC_016832	CGA	2	6	635721	635726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958707
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13741	NC_016832	CAT	2	6	641818	641823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958713
13742	NC_016832	GGT	3	9	641867	641875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958713
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13983	NC_016832	ACC	2	6	653602	653607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958725
13984	NC_016832	CGT	2	6	653679	653684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958725
13985	NC_016832	CG	3	6	653694	653699	0 %	0 %	50 %	50 %	378958725
13986	NC_016832	GC	3	6	653701	653706	0 %	0 %	50 %	50 %	378958725
13987	NC_016832	GAT	2	6	653709	653714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958725
13988	NC_016832	TCA	2	6	653785	653790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958725
13989	NC_016832	GC	3	6	653795	653800	0 %	0 %	50 %	50 %	378958725
13990	NC_016832	TCCGG	2	10	653827	653836	0 %	20 %	40 %	40 %	378958725
13991	NC_016832	GGT	2	6	653886	653891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958725
13992	NC_016832	GT	3	6	653924	653929	0 %	50 %	50 %	0 %	378958725
13993	NC_016832	CGC	4	12	653998	654009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958726
13994	NC_016832	AGGG	2	8	654084	654091	25 %	0 %	75 %	0 %	378958726
13995	NC_016832	ACG	2	6	654111	654116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958726
13996	NC_016832	CTG	2	6	654122	654127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958726
13997	NC_016832	GAA	2	6	654143	654148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958726
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13999	NC_016832	CTA	2	6	654243	654248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958726
14000	NC_016832	AAG	2	6	654249	654254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958726

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