MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016832	TGA	2	6	511913	511918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_016832	CCG	2	6	511929	511934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_016832	CCT	2	6	511939	511944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_016832	GTG	2	6	512022	512027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_016832	TGA	2	6	512030	512035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_016832	CCG	2	6	512046	512051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_016832	CCT	2	6	512056	512061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_016832	CGG	2	6	512121	512126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_016832	AGT	2	6	512138	512143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_016832	TGG	2	6	512144	512149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_016832	TGA	2	6	512151	512156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_016832	CCG	2	6	512167	512172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_016832	CCT	2	6	512177	512182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11014	NC_016832	TG	3	6	512224	512229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_016832	TGTT	2	8	512283	512290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_016832	CGT	2	6	512291	512296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_016832	CGG	2	6	512528	512533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958585
11018	NC_016832	CG	3	6	512534	512539	0 %	0 %	50 %	50 %	378958585
11019	NC_016832	CAC	2	6	512571	512576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958585
11020	NC_016832	TGC	2	6	512590	512595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11021	NC_016832	CAT	2	6	512645	512650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958585
11022	NC_016832	CAT	2	6	512868	512873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958585
11023	NC_016832	CGA	2	6	512876	512881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11024	NC_016832	GTG	2	6	512892	512897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958585
11025	NC_016832	TGA	2	6	512933	512938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958585
11026	NC_016832	TCG	2	6	512993	512998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11027	NC_016832	TG	3	6	513027	513032	0 %	50 %	50 %	0 %	378958585
11028	NC_016832	GTG	3	9	513030	513038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958585
11029	NC_016832	GAC	2	6	513039	513044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11030	NC_016832	CAA	2	6	513089	513094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958585
11031	NC_016832	GAT	2	6	513161	513166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958585
11032	NC_016832	CGA	2	6	513173	513178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11033	NC_016832	CGGTG	2	10	513203	513212	0 %	20 %	60 %	20 %	378958585
11034	NC_016832	GCG	2	6	513289	513294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958585
11035	NC_016832	GAT	2	6	513320	513325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958585
11036	NC_016832	CGGTG	2	10	513341	513350	0 %	20 %	60 %	20 %	378958585
11037	NC_016832	CTG	2	6	513384	513389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11038	NC_016832	ACC	2	6	513397	513402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958585
11039	NC_016832	GCG	2	6	513600	513605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958585
11040	NC_016832	A	6	6	513606	513611	100 %	0 %	0 %	0 %	378958585
11041	NC_016832	GTG	2	6	513645	513650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958585
11042	NC_016832	CAG	2	6	513682	513687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11043	NC_016832	CCA	2	6	513695	513700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958585
11044	NC_016832	CGG	2	6	513715	513720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958585
11045	NC_016832	GCA	2	6	513832	513837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11046	NC_016832	CAA	2	6	513848	513853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958585
11047	NC_016832	CAG	2	6	513885	513890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958585
11048	NC_016832	GGCAG	2	10	513916	513925	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11049	NC_016832	TAT	2	6	513938	513943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_016832	TTCCTG	2	12	514022	514033	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378958586
11051	NC_016832	AAT	2	6	514058	514063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958586
11052	NC_016832	GCAG	2	8	514131	514138	25 %	0 %	50 %	25 %	378958586
11053	NC_016832	GTT	2	6	514246	514251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958586
11054	NC_016832	CAGC	2	8	514297	514304	25 %	0 %	25 %	50 %	378958586
11055	NC_016832	ATT	2	6	514340	514345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958587
11056	NC_016832	CACG	2	8	514391	514398	25 %	0 %	25 %	50 %	378958587
11057	NC_016832	GA	3	6	514401	514406	50 %	0 %	50 %	0 %	378958587
11058	NC_016832	AGC	2	6	514456	514461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958587
11059	NC_016832	AT	3	6	514534	514539	50 %	50 %	0 %	0 %	378958587
11060	NC_016832	CTT	2	6	514616	514621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958587
11061	NC_016832	TTC	2	6	514674	514679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958587
11062	NC_016832	ACT	2	6	514783	514788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_016832	ATG	2	6	514888	514893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_016832	GCATG	2	10	514954	514963	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11065	NC_016832	CCA	2	6	514995	515000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_016832	GCATG	2	10	515072	515081	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11067	NC_016832	CCA	2	6	515113	515118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_016832	CGTT	2	8	515198	515205	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11069	NC_016832	GCT	2	6	515210	515215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_016832	TTA	2	6	515266	515271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_016832	TA	3	6	515283	515288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_016832	ATG	2	6	515289	515294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_016832	A	6	6	515332	515337	100 %	0 %	0 %	0 %	378958588
11074	NC_016832	CTGGC	2	10	515438	515447	0 %	20 %	40 %	40 %	378958588
11075	NC_016832	GCC	2	6	515487	515492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958588
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11078	NC_016832	TGC	2	6	515571	515576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958588
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11080	NC_016832	CCAA	2	8	515658	515665	50 %	0 %	0 %	50 %	378958588
11081	NC_016832	CTT	2	6	515773	515778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958588
11082	NC_016832	GGCACC	2	12	515780	515791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	378958588
11083	NC_016832	TAT	2	6	515858	515863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958588
11084	NC_016832	TTTG	2	8	516216	516223	0 %	75 %	25 %	0 %	378958588
11085	NC_016832	GC	4	8	516319	516326	0 %	0 %	50 %	50 %	378958588
11086	NC_016832	GT	3	6	516362	516367	0 %	50 %	50 %	0 %	378958588
11087	NC_016832	GCT	3	9	516463	516471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958588
11088	NC_016832	ATT	2	6	516508	516513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958588
11089	NC_016832	AT	3	6	516553	516558	50 %	50 %	0 %	0 %	378958588
11090	NC_016832	TAA	2	6	516571	516576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958588
11091	NC_016832	GCTG	2	8	516684	516691	0 %	25 %	50 %	25 %	378958588
11092	NC_016832	GAC	2	6	516760	516765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958588
11093	NC_016832	TGC	2	6	516774	516779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958588
11094	NC_016832	GCGCG	2	10	516808	516817	0 %	0 %	60 %	40 %	378958588
11095	NC_016832	CGA	2	6	516892	516897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958588
11096	NC_016832	ATG	2	6	516905	516910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958588
11097	NC_016832	CGG	2	6	517011	517016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958588
11098	NC_016832	GCT	2	6	517057	517062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958588
11099	NC_016832	TCA	2	6	517128	517133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958588
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11101	NC_016832	TC	3	6	517158	517163	0 %	50 %	0 %	50 %	378958588
11102	NC_016832	TGA	2	6	517225	517230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958588
11103	NC_016832	CAT	2	6	517282	517287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958588
11104	NC_016832	GTT	2	6	517299	517304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958588
11105	NC_016832	GAT	2	6	517339	517344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958588
11106	NC_016832	AGCGAA	2	12	517366	517377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378958588
11107	NC_016832	CGT	2	6	517387	517392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958588
11108	NC_016832	TTG	2	6	517401	517406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958588
11109	NC_016832	GCC	2	6	517473	517478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958588
11110	NC_016832	A	7	7	517506	517512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_016832	AAT	2	6	517677	517682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958589
11112	NC_016832	GA	3	6	517745	517750	50 %	0 %	50 %	0 %	378958589
11113	NC_016832	CAT	2	6	517776	517781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958589
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11116	NC_016832	CGC	2	6	517989	517994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958589
11117	NC_016832	GAT	2	6	517995	518000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958589
11118	NC_016832	GAA	2	6	518046	518051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958589
11119	NC_016832	TTC	2	6	518088	518093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958589
11120	NC_016832	GAA	3	9	518481	518489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958589
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11122	NC_016832	T	7	7	518672	518678	0 %	100 %	0 %	0 %	378958589
11123	NC_016832	GCT	2	6	518685	518690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958589
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11126	NC_016832	AC	4	8	518828	518835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11127	NC_016832	TAA	2	6	518838	518843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_016832	TACTG	2	10	518888	518897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11129	NC_016832	ATGAAA	2	12	518901	518912	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_016832	TGAC	2	8	519097	519104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11489	NC_016832	CAG	2	6	535911	535916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958607
11490	NC_016832	ATG	2	6	535960	535965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958607
11491	NC_016832	CTGG	2	8	536032	536039	0 %	25 %	50 %	25 %	378958607
11492	NC_016832	ACC	2	6	536076	536081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958607
11493	NC_016832	GTG	2	6	536187	536192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958607
11494	NC_016832	GAT	2	6	536217	536222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958607
11495	NC_016832	ATG	2	6	536228	536233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958607
11496	NC_016832	TGAT	2	8	536249	536256	25 %	50 %	25 %	0 %	378958608
11497	NC_016832	GCAG	2	8	536298	536305	25 %	0 %	50 %	25 %	378958608
11498	NC_016832	CGTG	2	8	536313	536320	0 %	25 %	50 %	25 %	378958608
11499	NC_016832	TG	3	6	536388	536393	0 %	50 %	50 %	0 %	378958608
11500	NC_016832	TCA	2	6	536433	536438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958608

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