MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10004	NC_016832	GGC	2	6	466759	466764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958535
10005	NC_016832	GCA	2	6	466781	466786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958535
10006	NC_016832	GCA	3	9	466862	466870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958535
10007	NC_016832	GCC	2	6	466873	466878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958535
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10009	NC_016832	GCCTG	2	10	467074	467083	0 %	20 %	40 %	40 %	378958535
10010	NC_016832	TCA	2	6	467110	467115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958536
10011	NC_016832	CTG	2	6	467208	467213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958536
10012	NC_016832	GTC	2	6	467218	467223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958536
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10033	NC_016832	GTC	2	6	467942	467947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958537
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10120	NC_016832	GCG	2	6	471111	471116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958540
10121	NC_016832	CGCC	2	8	471133	471140	0 %	0 %	25 %	75 %	378958540
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10225	NC_016832	CTG	2	6	475636	475641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958543
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10228	NC_016832	GCGG	2	8	475737	475744	0 %	0 %	75 %	25 %	378958543
10229	NC_016832	CGGTGA	2	12	475793	475804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378958543
10230	NC_016832	TCCT	2	8	475818	475825	0 %	50 %	0 %	50 %	378958543
10231	NC_016832	CAA	2	6	476018	476023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958544
10232	NC_016832	GAC	2	6	476160	476165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958544
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10235	NC_016832	A	6	6	476271	476276	100 %	0 %	0 %	0 %	378958544
10236	NC_016832	ACC	2	6	476283	476288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958544
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10238	NC_016832	CTTT	2	8	476379	476386	0 %	75 %	0 %	25 %	378958544
10239	NC_016832	CAC	2	6	476522	476527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958544
10240	NC_016832	TCG	2	6	476543	476548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958544
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10242	NC_016832	CGA	2	6	476633	476638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958544
10243	NC_016832	CTA	2	6	476786	476791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958544
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10245	NC_016832	CTG	2	6	476924	476929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958544
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10253	NC_016832	GCTG	2	8	477124	477131	0 %	25 %	50 %	25 %	378958544
10254	NC_016832	GTC	2	6	477157	477162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958544
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10273	NC_016832	CGC	2	6	478027	478032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958545
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10328	NC_016832	GC	4	8	480538	480545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10329	NC_016832	TCA	2	6	480567	480572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10333	NC_016832	TTCCTC	2	12	480666	480677	0 %	50 %	0 %	50 %	378958549
10334	NC_016832	TAGCT	2	10	480688	480697	20 %	40 %	20 %	20 %	378958549
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10340	NC_016832	T	7	7	480910	480916	0 %	100 %	0 %	0 %	378958549
10341	NC_016832	ACA	2	6	480975	480980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958549
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10343	NC_016832	CGGC	2	8	481121	481128	0 %	0 %	50 %	50 %	378958549
10344	NC_016832	GTAAA	2	10	481165	481174	60 %	20 %	20 %	0 %	378958549
10345	NC_016832	GAGG	2	8	481232	481239	25 %	0 %	75 %	0 %	378958549
10346	NC_016832	TGAAG	2	10	481243	481252	40 %	20 %	40 %	0 %	378958549
10347	NC_016832	GGT	2	6	481264	481269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958549
10348	NC_016832	CCAGG	2	10	481317	481326	20 %	0 %	40 %	40 %	378958549
10349	NC_016832	GGC	2	6	481396	481401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958549
10350	NC_016832	AG	3	6	481425	481430	50 %	0 %	50 %	0 %	378958549
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10356	NC_016832	TCGG	2	8	481609	481616	0 %	25 %	50 %	25 %	378958549
10357	NC_016832	AT	3	6	481738	481743	50 %	50 %	0 %	0 %	378958549
10358	NC_016832	GC	3	6	481764	481769	0 %	0 %	50 %	50 %	378958549
10359	NC_016832	TACTG	2	10	481903	481912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10360	NC_016832	GCGG	2	8	481933	481940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10361	NC_016832	AAAC	2	8	482021	482028	75 %	0 %	0 %	25 %	378958550
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10364	NC_016832	AT	3	6	482222	482227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10365	NC_016832	GCAG	2	8	482245	482252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10467	NC_016832	CAG	2	6	486701	486706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958556
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10472	NC_016832	TTA	2	6	486997	487002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10473	NC_016832	TCGC	2	8	487124	487131	0 %	25 %	25 %	50 %	378958557
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10482	NC_016832	GCC	2	6	487537	487542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958557
10483	NC_016832	GGC	2	6	487749	487754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958557
10484	NC_016832	GGC	2	6	487810	487815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958557
10485	NC_016832	AGCGTA	2	12	487831	487842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378958557
10486	NC_016832	TGAT	2	8	487849	487856	25 %	50 %	25 %	0 %	378958557
10487	NC_016832	TCC	2	6	487864	487869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10488	NC_016832	CGC	2	6	487873	487878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10489	NC_016832	GGGA	2	8	487882	487889	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10490	NC_016832	ATC	2	6	487917	487922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10491	NC_016832	TA	3	6	487929	487934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_016832	ATG	2	6	487967	487972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10493	NC_016832	GCA	2	6	488048	488053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958558
10494	NC_016832	GGCAG	2	10	488065	488074	20 %	0 %	60 %	20 %	378958558
10495	NC_016832	GCT	2	6	488089	488094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958558
10496	NC_016832	GCC	2	6	488129	488134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958558
10497	NC_016832	CCG	2	6	488141	488146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958558
10498	NC_016832	CAA	2	6	488153	488158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958558
10499	NC_016832	CGG	2	6	488173	488178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958558
10500	NC_016832	TCA	2	6	488213	488218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958558

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