MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96001	NC_016832	GGA	2	6	4558397	4558402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96002	NC_016832	GAA	2	6	4558520	4558525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962601
96003	NC_016832	AGC	2	6	4558557	4558562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96004	NC_016832	CGC	2	6	4558577	4558582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962601
96005	NC_016832	GC	3	6	4558585	4558590	0 %	0 %	50 %	50 %	378962601
96006	NC_016832	CGC	2	6	4558622	4558627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962601
96007	NC_016832	CTG	2	6	4558658	4558663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96008	NC_016832	CGC	2	6	4558814	4558819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962601
96009	NC_016832	GAC	2	6	4558910	4558915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96010	NC_016832	AGA	2	6	4558948	4558953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962601
96011	NC_016832	GC	3	6	4558962	4558967	0 %	0 %	50 %	50 %	378962601
96012	NC_016832	TCGTGG	2	12	4558977	4558988	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378962601
96013	NC_016832	TCG	2	6	4559037	4559042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96014	NC_016832	AGC	2	6	4559133	4559138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96015	NC_016832	AGA	2	6	4559155	4559160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962601
96016	NC_016832	GTCG	2	8	4559180	4559187	0 %	25 %	50 %	25 %	378962601
96017	NC_016832	GAC	2	6	4559246	4559251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96018	NC_016832	A	6	6	4559267	4559272	100 %	0 %	0 %	0 %	378962601
96019	NC_016832	CGG	3	9	4559275	4559283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962601
96020	NC_016832	TAT	2	6	4559318	4559323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378962601
96021	NC_016832	GCC	2	6	4559329	4559334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962601
96022	NC_016832	GC	3	6	4559354	4559359	0 %	0 %	50 %	50 %	378962601
96023	NC_016832	TGA	2	6	4559529	4559534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962601
96024	NC_016832	TGC	2	6	4559574	4559579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96025	NC_016832	GAA	2	6	4559672	4559677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962601
96026	NC_016832	G	6	6	4559681	4559686	0 %	0 %	100 %	0 %	378962601
96027	NC_016832	CGG	2	6	4559814	4559819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962601
96028	NC_016832	CAC	2	6	4559875	4559880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378962601
96029	NC_016832	CG	3	6	4559955	4559960	0 %	0 %	50 %	50 %	378962601
96030	NC_016832	TGC	2	6	4560009	4560014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96031	NC_016832	TGC	3	9	4560021	4560029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96032	NC_016832	CGC	2	6	4560119	4560124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962601
96033	NC_016832	TCTT	2	8	4560133	4560140	0 %	75 %	0 %	25 %	378962601
96034	NC_016832	CTG	2	6	4560161	4560166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96035	NC_016832	ACT	2	6	4560216	4560221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962601
96036	NC_016832	CGC	2	6	4560269	4560274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378962601
96037	NC_016832	TGA	2	6	4560277	4560282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962601
96038	NC_016832	CTT	2	6	4560382	4560387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962601
96039	NC_016832	TGA	2	6	4560397	4560402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962601
96040	NC_016832	CGG	2	6	4560493	4560498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962601
96041	NC_016832	AGCG	2	8	4560587	4560594	25 %	0 %	50 %	25 %	378962601
96042	NC_016832	A	6	6	4560635	4560640	100 %	0 %	0 %	0 %	378962601
96043	NC_016832	CGT	2	6	4560665	4560670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96044	NC_016832	AGGT	2	8	4560672	4560679	25 %	25 %	50 %	0 %	378962601
96045	NC_016832	A	6	6	4560722	4560727	100 %	0 %	0 %	0 %	378962601
96046	NC_016832	AGC	2	6	4560739	4560744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962601
96047	NC_016832	GAA	2	6	4560745	4560750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962601
96048	NC_016832	A	6	6	4560766	4560771	100 %	0 %	0 %	0 %	378962601
96049	NC_016832	GCG	2	6	4560821	4560826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962601
96050	NC_016832	A	6	6	4560830	4560835	100 %	0 %	0 %	0 %	378962601
96051	NC_016832	AGA	2	6	4560866	4560871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96052	NC_016832	AAC	2	6	4560922	4560927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96053	NC_016832	CTG	2	6	4560977	4560982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962602
96054	NC_016832	GC	3	6	4560985	4560990	0 %	0 %	50 %	50 %	378962602
96055	NC_016832	CGA	2	6	4561111	4561116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962602
96056	NC_016832	TTG	2	6	4561226	4561231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378962602
96057	NC_016832	TGC	2	6	4561288	4561293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962602
96058	NC_016832	GAA	2	6	4561351	4561356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962602
96059	NC_016832	GCG	2	6	4561365	4561370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962602
96060	NC_016832	GC	3	6	4561409	4561414	0 %	0 %	50 %	50 %	378962602
96061	NC_016832	CGG	2	6	4561458	4561463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962602
96062	NC_016832	GAAGGT	2	12	4561529	4561540	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378962602
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96064	NC_016832	T	6	6	4561681	4561686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96065	NC_016832	A	6	6	4561690	4561695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96066	NC_016832	CCAT	2	8	4561696	4561703	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96067	NC_016832	T	9	9	4561714	4561722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96068	NC_016832	TTTA	2	8	4561769	4561776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96069	NC_016832	A	6	6	4561778	4561783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96070	NC_016832	GAGATA	2	12	4561784	4561795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96071	NC_016832	ATA	3	9	4561793	4561801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962603
96072	NC_016832	ACA	2	6	4561838	4561843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962603
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96074	NC_016832	TAA	3	9	4561886	4561894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962603
96075	NC_016832	ATGA	2	8	4561897	4561904	50 %	25 %	25 %	0 %	378962603
96076	NC_016832	TTTA	2	8	4561929	4561936	25 %	75 %	0 %	0 %	378962603
96077	NC_016832	CAA	2	6	4561942	4561947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378962603
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96082	NC_016832	AAT	2	6	4562201	4562206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378962603
96083	NC_016832	GGC	2	6	4562210	4562215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96084	NC_016832	AGA	2	6	4562273	4562278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962604
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96089	NC_016832	GAA	2	6	4562502	4562507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962604
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96091	NC_016832	AGC	2	6	4562626	4562631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962604
96092	NC_016832	GC	4	8	4562666	4562673	0 %	0 %	50 %	50 %	378962604
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96097	NC_016832	AAT	2	6	4562914	4562919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96098	NC_016832	GC	3	6	4563033	4563038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96099	NC_016832	TCG	2	6	4563053	4563058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96100	NC_016832	TCTG	2	8	4563124	4563131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96101	NC_016832	ATG	2	6	4563166	4563171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378962605
96102	NC_016832	T	6	6	4563175	4563180	0 %	100 %	0 %	0 %	378962605
96103	NC_016832	CTA	2	6	4563280	4563285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962605
96104	NC_016832	GTC	2	6	4563288	4563293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962605
96105	NC_016832	TGG	2	6	4563299	4563304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378962605
96106	NC_016832	GGC	3	9	4563355	4563363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378962605
96107	NC_016832	CTA	2	6	4563378	4563383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378962605
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96112	NC_016832	CAG	2	6	4563637	4563642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962605
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96114	NC_016832	TCT	2	6	4563714	4563719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378962605
96115	NC_016832	GAA	2	6	4563730	4563735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378962605
96116	NC_016832	TCACT	2	10	4563800	4563809	20 %	40 %	0 %	40 %	378962605
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96471	NC_016832	CTG	2	6	4581061	4581066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378962629
96472	NC_016832	GAT	2	6	4581096	4581101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96473	NC_016832	CAG	2	6	4581134	4581139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96474	NC_016832	ATTTT	2	10	4581148	4581157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96475	NC_016832	CGT	2	6	4581166	4581171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96476	NC_016832	CCG	2	6	4581268	4581273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96477	NC_016832	TCG	2	6	4581310	4581315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96478	NC_016832	ACAG	2	8	4581350	4581357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96479	NC_016832	GAA	2	6	4581364	4581369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96480	NC_016832	CGA	2	6	4581400	4581405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378962630
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