MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016831	TTTA	2	8	115999	116006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_016831	A	6	6	116114	116119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_016831	T	6	6	116126	116131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_016831	GTTT	2	8	116132	116139	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_016831	ATA	2	6	116197	116202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_016831	TAAA	2	8	116223	116230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_016831	TCG	2	6	116250	116255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_016831	CT	3	6	116260	116265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2509	NC_016831	TAATT	2	10	116269	116278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_016831	ATTTT	2	10	116295	116304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_016831	CGGGTG	2	12	116311	116322	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2512	NC_016831	T	6	6	116457	116462	0 %	100 %	0 %	0 %	378953903
2513	NC_016831	ACAGA	2	10	116478	116487	60 %	0 %	20 %	20 %	378953903
2514	NC_016831	ATT	2	6	116502	116507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953903
2515	NC_016831	T	7	7	116522	116528	0 %	100 %	0 %	0 %	378953903
2516	NC_016831	A	6	6	116549	116554	100 %	0 %	0 %	0 %	378953903
2517	NC_016831	ATT	2	6	116571	116576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378953903
2518	NC_016831	CAA	2	6	116608	116613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953903
2519	NC_016831	TTC	2	6	116628	116633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953903
2520	NC_016831	GGAA	2	8	116642	116649	50 %	0 %	50 %	0 %	378953903
2521	NC_016831	ATA	2	6	116671	116676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953903
2522	NC_016831	AT	3	6	116729	116734	50 %	50 %	0 %	0 %	378953903
2523	NC_016831	TCA	2	6	116747	116752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378953903
2524	NC_016831	C	6	6	116758	116763	0 %	0 %	0 %	100 %	378953903
2525	NC_016831	CAG	2	6	116837	116842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953904
2526	NC_016831	TGC	2	6	116847	116852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953904
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2531	NC_016831	GCG	2	6	117000	117005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953904
2532	NC_016831	CTT	2	6	117013	117018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953904
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2534	NC_016831	GGT	2	6	117131	117136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953904
2535	NC_016831	GT	3	6	117195	117200	0 %	50 %	50 %	0 %	378953904
2536	NC_016831	ACA	2	6	117232	117237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378953904
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2539	NC_016831	CGC	2	6	117370	117375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953904
2540	NC_016831	TCT	2	6	117471	117476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378953904
2541	NC_016831	AAATG	2	10	117588	117597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_016831	CAGCG	2	10	117653	117662	20 %	0 %	40 %	40 %	378953905
2543	NC_016831	ATCA	2	8	117694	117701	50 %	25 %	0 %	25 %	378953905
2544	NC_016831	GC	3	6	117780	117785	0 %	0 %	50 %	50 %	378953905
2545	NC_016831	GCCA	2	8	117787	117794	25 %	0 %	25 %	50 %	378953905
2546	NC_016831	GCG	2	6	117876	117881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953905
2547	NC_016831	CAG	2	6	117907	117912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953905
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2549	NC_016831	GCCGG	2	10	117953	117962	0 %	0 %	60 %	40 %	378953905
2550	NC_016831	GCC	2	6	118000	118005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378953905
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2552	NC_016831	CGAGC	2	10	118078	118087	20 %	0 %	40 %	40 %	378953905
2553	NC_016831	TCC	2	6	118124	118129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378953905
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2555	NC_016831	GCG	2	6	118187	118192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953905
2556	NC_016831	GTT	2	6	118263	118268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953905
2557	NC_016831	GTC	2	6	118292	118297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953905
2558	NC_016831	GC	3	6	118351	118356	0 %	0 %	50 %	50 %	378953905
2559	NC_016831	GGCG	2	8	118399	118406	0 %	0 %	75 %	25 %	378953905
2560	NC_016831	GCT	2	6	118417	118422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953905
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2563	NC_016831	GTCA	2	8	118549	118556	25 %	25 %	25 %	25 %	378953905
2564	NC_016831	GAC	2	6	118684	118689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378953905
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2570	NC_016831	AGT	2	6	118823	118828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378953905
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2572	NC_016831	GCTG	2	8	119076	119083	0 %	25 %	50 %	25 %	378953905
2573	NC_016831	TGT	2	6	119199	119204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378953906
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2582	NC_016831	GC	5	10	119526	119535	0 %	0 %	50 %	50 %	378953906
2583	NC_016831	GCG	2	6	119639	119644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953906
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2587	NC_016831	TGC	2	6	119766	119771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378953906
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2591	NC_016831	CGG	2	6	120109	120114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953906
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2595	NC_016831	CGG	2	6	120249	120254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953906
2596	NC_016831	GTG	2	6	120270	120275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378953906
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2599	NC_016831	CGG	2	6	120322	120327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378953906
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2610	NC_016831	GC	3	6	120798	120803	0 %	0 %	50 %	50 %	378953906
2611	NC_016831	CAATTG	2	12	120829	120840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378953906
2612	NC_016831	TCCA	2	8	120853	120860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_016831	AG	3	6	120885	120890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_016831	CAGG	2	8	120907	120914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_016831	AATGCT	2	12	120937	120948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2616	NC_016831	TCA	2	6	121089	121094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_016831	GTC	2	6	121125	121130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_016831	TCT	2	6	121154	121159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_016831	T	7	7	121282	121288	0 %	100 %	0 %	0 %	378953907
2620	NC_016831	ATCG	2	8	121289	121296	25 %	25 %	25 %	25 %	378953907
2621	NC_016831	AT	3	6	121315	121320	50 %	50 %	0 %	0 %	378953907
2622	NC_016831	TAA	3	9	121354	121362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378953907
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2624	NC_016831	AT	3	6	121392	121397	50 %	50 %	0 %	0 %	378953907
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2999	NC_016831	CT	3	6	139235	139240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3000	NC_016831	GCC	2	6	139244	139249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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