MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_016831	GGT	2	6	1246763	1246768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954933
26503	NC_016831	A	6	6	1246833	1246838	100 %	0 %	0 %	0 %	378954933
26504	NC_016831	ATA	2	6	1246884	1246889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954933
26505	NC_016831	TTG	2	6	1246979	1246984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954933
26506	NC_016831	A	6	6	1247022	1247027	100 %	0 %	0 %	0 %	378954933
26507	NC_016831	CTTAAT	2	12	1247033	1247044	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378954933
26508	NC_016831	ACA	2	6	1247056	1247061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954933
26509	NC_016831	ATT	2	6	1247131	1247136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954933
26510	NC_016831	GGA	2	6	1247159	1247164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954933
26511	NC_016831	AAAAT	2	10	1247193	1247202	80 %	20 %	0 %	0 %	378954933
26512	NC_016831	T	7	7	1247280	1247286	0 %	100 %	0 %	0 %	378954933
26513	NC_016831	AGT	2	6	1247299	1247304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954933
26514	NC_016831	AAT	2	6	1247306	1247311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954933
26515	NC_016831	T	6	6	1247354	1247359	0 %	100 %	0 %	0 %	378954934
26516	NC_016831	TGAA	2	8	1247392	1247399	50 %	25 %	25 %	0 %	378954934
26517	NC_016831	A	6	6	1247458	1247463	100 %	0 %	0 %	0 %	378954934
26518	NC_016831	GA	3	6	1247471	1247476	50 %	0 %	50 %	0 %	378954934
26519	NC_016831	ATTT	2	8	1247488	1247495	25 %	75 %	0 %	0 %	378954934
26520	NC_016831	AGAGTT	2	12	1247514	1247525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954934
26521	NC_016831	TGG	2	6	1247661	1247666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954934
26522	NC_016831	TGGC	2	8	1247668	1247675	0 %	25 %	50 %	25 %	378954934
26523	NC_016831	TTA	2	6	1247769	1247774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954934
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26525	NC_016831	G	6	6	1247893	1247898	0 %	0 %	100 %	0 %	378954934
26526	NC_016831	TGA	2	6	1247924	1247929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954934
26527	NC_016831	ATG	2	6	1248022	1248027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954934
26528	NC_016831	TCA	2	6	1248113	1248118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954934
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26531	NC_016831	ATA	2	6	1248147	1248152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954934
26532	NC_016831	GCG	2	6	1248191	1248196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954934
26533	NC_016831	GTG	2	6	1248211	1248216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954934
26534	NC_016831	TCA	2	6	1248230	1248235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954934
26535	NC_016831	AGC	2	6	1248257	1248262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954934
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26537	NC_016831	ATG	2	6	1248319	1248324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954934
26538	NC_016831	CTGC	2	8	1248336	1248343	0 %	25 %	25 %	50 %	378954934
26539	NC_016831	TGGC	2	8	1248349	1248356	0 %	25 %	50 %	25 %	378954934
26540	NC_016831	TTA	2	6	1248384	1248389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954934
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26543	NC_016831	TGC	2	6	1248557	1248562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954935
26544	NC_016831	GA	3	6	1248626	1248631	50 %	0 %	50 %	0 %	378954935
26545	NC_016831	GCA	2	6	1248654	1248659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954935
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26548	NC_016831	TAT	2	6	1248724	1248729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954935
26549	NC_016831	AGTG	2	8	1248753	1248760	25 %	25 %	50 %	0 %	378954935
26550	NC_016831	AGTAA	2	10	1248767	1248776	60 %	20 %	20 %	0 %	378954935
26551	NC_016831	CCA	2	6	1248796	1248801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26552	NC_016831	GC	3	6	1248837	1248842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26553	NC_016831	GTA	2	6	1248861	1248866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26554	NC_016831	TTAG	2	8	1248933	1248940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26555	NC_016831	TATC	2	8	1248950	1248957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26556	NC_016831	ATG	2	6	1248974	1248979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26557	NC_016831	A	6	6	1249052	1249057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26558	NC_016831	AG	3	6	1249105	1249110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26559	NC_016831	AG	3	6	1249124	1249129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26560	NC_016831	AG	3	6	1249132	1249137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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26564	NC_016831	AAC	2	6	1249224	1249229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26565	NC_016831	AAC	2	6	1249245	1249250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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26574	NC_016831	A	6	6	1249897	1249902	100 %	0 %	0 %	0 %	378954936
26575	NC_016831	GACCC	2	10	1249903	1249912	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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26615	NC_016831	CTT	2	6	1251892	1251897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26616	NC_016831	GGGA	2	8	1251916	1251923	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26617	NC_016831	TGA	2	6	1251953	1251958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954939
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27000	NC_016831	CCAT	2	8	1270898	1270905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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