MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_016831	ACG	2	6	1222626	1222631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954917
26003	NC_016831	GAA	2	6	1222757	1222762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954917
26004	NC_016831	TGG	2	6	1222773	1222778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954917
26005	NC_016831	CTG	2	6	1222853	1222858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954918
26006	NC_016831	TA	3	6	1222899	1222904	50 %	50 %	0 %	0 %	378954918
26007	NC_016831	GCG	2	6	1223002	1223007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954918
26008	NC_016831	GGT	2	6	1223074	1223079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954918
26009	NC_016831	ATTT	2	8	1223080	1223087	25 %	75 %	0 %	0 %	378954918
26010	NC_016831	ACC	2	6	1223091	1223096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954918
26011	NC_016831	A	6	6	1223145	1223150	100 %	0 %	0 %	0 %	378954918
26012	NC_016831	GCA	2	6	1223161	1223166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954918
26013	NC_016831	GCC	2	6	1223225	1223230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954918
26014	NC_016831	ACAG	2	8	1223248	1223255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26015	NC_016831	TGT	2	6	1223328	1223333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26016	NC_016831	AAGCG	2	10	1223340	1223349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
26017	NC_016831	GTC	2	6	1223356	1223361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26018	NC_016831	AGG	2	6	1223385	1223390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26019	NC_016831	TAT	2	6	1223426	1223431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26020	NC_016831	CGG	2	6	1223575	1223580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26021	NC_016831	TAT	2	6	1223718	1223723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26022	NC_016831	CCG	2	6	1223727	1223732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26023	NC_016831	CATCGG	2	12	1223759	1223770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26024	NC_016831	CGG	2	6	1223845	1223850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26025	NC_016831	GCC	2	6	1223888	1223893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26026	NC_016831	TCAT	2	8	1223968	1223975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26027	NC_016831	GC	3	6	1223983	1223988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26028	NC_016831	GAA	2	6	1224168	1224173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26029	NC_016831	CG	4	8	1224382	1224389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26030	NC_016831	ACG	2	6	1224410	1224415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26031	NC_016831	A	7	7	1224419	1224425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26032	NC_016831	TTAC	2	8	1224464	1224471	25 %	50 %	0 %	25 %	378954919
26033	NC_016831	TAC	2	6	1224482	1224487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954919
26034	NC_016831	TGT	2	6	1224490	1224495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954919
26035	NC_016831	CGT	2	6	1224520	1224525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954919
26036	NC_016831	AGC	2	6	1224530	1224535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954919
26037	NC_016831	GCATT	2	10	1224550	1224559	20 %	40 %	20 %	20 %	378954919
26038	NC_016831	AAC	2	6	1224640	1224645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954919
26039	NC_016831	ACT	2	6	1224669	1224674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954919
26040	NC_016831	ATAACA	2	12	1224705	1224716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378954919
26041	NC_016831	A	8	8	1224742	1224749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26042	NC_016831	TTA	2	6	1224772	1224777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26043	NC_016831	TTAC	2	8	1224789	1224796	25 %	50 %	0 %	25 %	378954920
26044	NC_016831	TAG	2	6	1224803	1224808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954920
26045	NC_016831	CGT	2	6	1224842	1224847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954920
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26047	NC_016831	CGT	2	6	1224884	1224889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954920
26048	NC_016831	AGA	2	6	1224930	1224935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954920
26049	NC_016831	CCAG	2	8	1224967	1224974	25 %	0 %	25 %	50 %	378954920
26050	NC_016831	ATT	2	6	1225024	1225029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954920
26051	NC_016831	T	6	6	1225084	1225089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26052	NC_016831	T	7	7	1225102	1225108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26053	NC_016831	AAG	2	6	1225143	1225148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26054	NC_016831	A	6	6	1225172	1225177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26055	NC_016831	GAAA	2	8	1225180	1225187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26056	NC_016831	TTC	2	6	1225207	1225212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26057	NC_016831	GATTT	2	10	1225244	1225253	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26058	NC_016831	T	7	7	1225251	1225257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26059	NC_016831	TAAA	2	8	1225277	1225284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26060	NC_016831	A	7	7	1225282	1225288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26061	NC_016831	T	6	6	1225304	1225309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26062	NC_016831	CA	3	6	1225323	1225328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26063	NC_016831	ATT	2	6	1225332	1225337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954921
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26065	NC_016831	GC	3	6	1225383	1225388	0 %	0 %	50 %	50 %	378954921
26066	NC_016831	ACG	2	6	1225403	1225408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954921
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26069	NC_016831	TGG	2	6	1225545	1225550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954921
26070	NC_016831	TGG	2	6	1225563	1225568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954921
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26072	NC_016831	CGG	2	6	1225650	1225655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954921
26073	NC_016831	CCGCG	2	10	1225662	1225671	0 %	0 %	40 %	60 %	378954921
26074	NC_016831	GTT	2	6	1225708	1225713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954921
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26081	NC_016831	CGC	2	6	1226112	1226117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954921
26082	NC_016831	GCA	2	6	1226177	1226182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954921
26083	NC_016831	CAGC	2	8	1226235	1226242	25 %	0 %	25 %	50 %	378954921
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26087	NC_016831	CGT	2	6	1226502	1226507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954921
26088	NC_016831	T	6	6	1226569	1226574	0 %	100 %	0 %	0 %	378954921
26089	NC_016831	TCA	2	6	1226586	1226591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954921
26090	NC_016831	GA	3	6	1226640	1226645	50 %	0 %	50 %	0 %	378954921
26091	NC_016831	ACAA	2	8	1226725	1226732	75 %	0 %	0 %	25 %	378954921
26092	NC_016831	AGTCTT	2	12	1226752	1226763	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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26094	NC_016831	GC	3	6	1226797	1226802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26095	NC_016831	TGA	2	6	1226835	1226840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26096	NC_016831	TG	3	6	1226887	1226892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26097	NC_016831	GC	3	6	1226979	1226984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26098	NC_016831	A	6	6	1227004	1227009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26099	NC_016831	TTA	2	6	1227063	1227068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26100	NC_016831	CGC	2	6	1227096	1227101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26101	NC_016831	GCG	2	6	1227112	1227117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26102	NC_016831	GTT	2	6	1227134	1227139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26103	NC_016831	CGC	2	6	1227234	1227239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954922
26104	NC_016831	ATC	2	6	1227301	1227306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954922
26105	NC_016831	AC	4	8	1227377	1227384	50 %	0 %	0 %	50 %	378954922
26106	NC_016831	A	7	7	1227396	1227402	100 %	0 %	0 %	0 %	378954922
26107	NC_016831	GC	3	6	1227410	1227415	0 %	0 %	50 %	50 %	378954922
26108	NC_016831	AGC	2	6	1227469	1227474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954922
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26113	NC_016831	CA	3	6	1227628	1227633	50 %	0 %	0 %	50 %	378954922
26114	NC_016831	ATG	2	6	1227643	1227648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954922
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26119	NC_016831	A	6	6	1227949	1227954	100 %	0 %	0 %	0 %	378954922
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26121	NC_016831	ACT	2	6	1227978	1227983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954922
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26365	NC_016831	GC	3	6	1239993	1239998	0 %	0 %	50 %	50 %	378954928
26366	NC_016831	GTA	2	6	1240050	1240055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954928
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26380	NC_016831	GAA	2	6	1240674	1240679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26477	NC_016831	ATAA	2	8	1245225	1245232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26478	NC_016831	AAAT	2	8	1245368	1245375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26479	NC_016831	GAG	2	6	1245439	1245444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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26482	NC_016831	TTA	2	6	1245711	1245716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26483	NC_016831	AGT	2	6	1245724	1245729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26484	NC_016831	A	6	6	1245786	1245791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26485	NC_016831	GTA	2	6	1245839	1245844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954933
26486	NC_016831	TGA	2	6	1245895	1245900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954933
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