MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25009	NC_016831	AT	4	8	1174960	1174967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25053	NC_016831	TCA	2	6	1176878	1176883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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25058	NC_016831	ATAG	2	8	1177133	1177140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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25062	NC_016831	T	7	7	1177286	1177292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25122	NC_016831	AAG	2	6	1179924	1179929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954880
25123	NC_016831	AAC	2	6	1179950	1179955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25124	NC_016831	TTA	2	6	1180003	1180008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25125	NC_016831	TTA	2	6	1180026	1180031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25126	NC_016831	TGC	2	6	1180060	1180065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954881
25127	NC_016831	A	7	7	1180076	1180082	100 %	0 %	0 %	0 %	378954881
25128	NC_016831	GGT	2	6	1180091	1180096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954881
25129	NC_016831	AAGCAC	2	12	1180100	1180111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378954881
25130	NC_016831	A	6	6	1180136	1180141	100 %	0 %	0 %	0 %	378954881
25131	NC_016831	TAAACG	2	12	1180147	1180158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378954881
25132	NC_016831	TGCC	2	8	1180214	1180221	0 %	25 %	25 %	50 %	378954881
25133	NC_016831	GTG	2	6	1180298	1180303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954882
25134	NC_016831	CTA	2	6	1180350	1180355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954882
25135	NC_016831	CGT	2	6	1180429	1180434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954882
25136	NC_016831	GCA	3	9	1180480	1180488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954882
25137	NC_016831	TCA	2	6	1180517	1180522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954882
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25140	NC_016831	CT	3	6	1180666	1180671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25141	NC_016831	TTTA	2	8	1180672	1180679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25142	NC_016831	GCT	2	6	1180765	1180770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25143	NC_016831	T	7	7	1180783	1180789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25144	NC_016831	AGG	2	6	1180808	1180813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25145	NC_016831	ACGAA	2	10	1180828	1180837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25146	NC_016831	A	6	6	1180847	1180852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25147	NC_016831	CCT	2	6	1180854	1180859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25148	NC_016831	T	7	7	1180869	1180875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25149	NC_016831	GA	3	6	1180888	1180893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25150	NC_016831	GCC	2	6	1180976	1180981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954883
25151	NC_016831	GAC	2	6	1181065	1181070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954883
25152	NC_016831	GCC	2	6	1181083	1181088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954883
25153	NC_016831	CGC	2	6	1181122	1181127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954883
25154	NC_016831	ACA	2	6	1181140	1181145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954883
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25156	NC_016831	AGCGC	2	10	1181177	1181186	20 %	0 %	40 %	40 %	378954883
25157	NC_016831	CGG	2	6	1181248	1181253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954883
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25160	NC_016831	CTG	2	6	1181432	1181437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954883
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25162	NC_016831	CCG	2	6	1181486	1181491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954883
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25164	NC_016831	TTG	2	6	1181577	1181582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954883
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25219	NC_016831	T	6	6	1184766	1184771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25220	NC_016831	CAA	2	6	1184851	1184856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954886
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25222	NC_016831	CTG	2	6	1184893	1184898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954886
25223	NC_016831	G	6	6	1184972	1184977	0 %	0 %	100 %	0 %	378954886
25224	NC_016831	GCGCT	2	10	1185032	1185041	0 %	20 %	40 %	40 %	378954886
25225	NC_016831	GCC	2	6	1185139	1185144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954886
25226	NC_016831	GGGGCA	2	12	1185153	1185164	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	378954886
25227	NC_016831	GC	3	6	1185203	1185208	0 %	0 %	50 %	50 %	378954886
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25229	NC_016831	CTG	2	6	1185226	1185231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954886
25230	NC_016831	TC	3	6	1185249	1185254	0 %	50 %	0 %	50 %	378954886
25231	NC_016831	TTG	3	9	1185265	1185273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954886
25232	NC_016831	GC	3	6	1185302	1185307	0 %	0 %	50 %	50 %	378954886
25233	NC_016831	TGA	2	6	1185308	1185313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954886
25234	NC_016831	CTAT	2	8	1185320	1185327	25 %	50 %	0 %	25 %	378954886
25235	NC_016831	GAT	2	6	1185366	1185371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954886
25236	NC_016831	GGA	2	6	1185373	1185378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954886
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25238	NC_016831	GCA	2	6	1185396	1185401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954886
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25358	NC_016831	CGGT	2	8	1191289	1191296	0 %	25 %	50 %	25 %	378954893
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25479	NC_016831	TGG	2	6	1196599	1196604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954896
25480	NC_016831	GAA	2	6	1196711	1196716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954896
25481	NC_016831	CAGG	2	8	1196804	1196811	25 %	0 %	50 %	25 %	378954896
25482	NC_016831	GGC	2	6	1196905	1196910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954896
25483	NC_016831	GCG	2	6	1196928	1196933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954896
25484	NC_016831	GCC	2	6	1196998	1197003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954896
25485	NC_016831	AGT	2	6	1197004	1197009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954896
25486	NC_016831	GCG	2	6	1197063	1197068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954896
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25488	NC_016831	GC	3	6	1197236	1197241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25489	NC_016831	CGT	2	6	1197304	1197309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25490	NC_016831	CCG	2	6	1197361	1197366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954897
25491	NC_016831	GGCAG	2	10	1197482	1197491	20 %	0 %	60 %	20 %	378954897
25492	NC_016831	TTA	2	6	1197496	1197501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954897
25493	NC_016831	TTA	2	6	1197504	1197509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954897
25494	NC_016831	GAG	2	6	1197528	1197533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25495	NC_016831	ATTT	2	8	1197571	1197578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25496	NC_016831	T	7	7	1197672	1197678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25497	NC_016831	ACC	2	6	1197718	1197723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25498	NC_016831	GCC	2	6	1197755	1197760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25499	NC_016831	GC	3	6	1197855	1197860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25500	NC_016831	CGG	2	6	1197882	1197887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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