MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_016831	TGA	2	6	1127166	1127171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954829
24003	NC_016831	AGCA	2	8	1127174	1127181	50 %	0 %	25 %	25 %	378954829
24004	NC_016831	GCC	2	6	1127263	1127268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24005	NC_016831	CGG	2	6	1127272	1127277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24006	NC_016831	ATT	2	6	1127397	1127402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24007	NC_016831	CGG	2	6	1127408	1127413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24008	NC_016831	GATC	2	8	1127469	1127476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24009	NC_016831	AG	3	6	1127500	1127505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24010	NC_016831	TCC	2	6	1127520	1127525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24011	NC_016831	CAG	3	9	1127541	1127549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24012	NC_016831	TG	3	6	1127588	1127593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24013	NC_016831	TCA	2	6	1127614	1127619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24014	NC_016831	CCAG	2	8	1127659	1127666	25 %	0 %	25 %	50 %	378954830
24015	NC_016831	CGA	3	9	1127692	1127700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954830
24016	NC_016831	GATC	2	8	1127771	1127778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24017	NC_016831	TCT	2	6	1127804	1127809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24018	NC_016831	CTT	2	6	1127837	1127842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24019	NC_016831	A	6	6	1127896	1127901	100 %	0 %	0 %	0 %	378954831
24020	NC_016831	GCA	2	6	1127907	1127912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954831
24021	NC_016831	GTTT	2	8	1127998	1128005	0 %	75 %	25 %	0 %	378954831
24022	NC_016831	TTGG	2	8	1128022	1128029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24023	NC_016831	ATG	2	6	1128095	1128100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24024	NC_016831	GGC	2	6	1128169	1128174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24025	NC_016831	TGAT	2	8	1128182	1128189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24026	NC_016831	GCG	3	9	1128238	1128246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24027	NC_016831	GCG	2	6	1128251	1128256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24028	NC_016831	CGA	2	6	1128291	1128296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24029	NC_016831	CG	3	6	1128336	1128341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24030	NC_016831	ACA	2	6	1128392	1128397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24031	NC_016831	GCG	2	6	1128410	1128415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24032	NC_016831	CCTG	2	8	1128421	1128428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24033	NC_016831	TGT	2	6	1128448	1128453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24034	NC_016831	AAC	2	6	1128481	1128486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24035	NC_016831	TGG	2	6	1128667	1128672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24036	NC_016831	GTG	2	6	1128744	1128749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24037	NC_016831	GTC	2	6	1128837	1128842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24038	NC_016831	TGC	2	6	1128934	1128939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24039	NC_016831	CAT	2	6	1129025	1129030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24040	NC_016831	GCG	2	6	1129087	1129092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24041	NC_016831	GAT	2	6	1129109	1129114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24042	NC_016831	TGA	2	6	1129205	1129210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24043	NC_016831	GCG	2	6	1129266	1129271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954832
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24049	NC_016831	TGG	2	6	1129467	1129472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954832
24050	NC_016831	ATG	2	6	1129571	1129576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954832
24051	NC_016831	ACT	2	6	1129621	1129626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954832
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24054	NC_016831	GCTGT	2	10	1129802	1129811	0 %	40 %	40 %	20 %	378954832
24055	NC_016831	CG	3	6	1129872	1129877	0 %	0 %	50 %	50 %	378954832
24056	NC_016831	GCC	2	6	1129951	1129956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954832
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24058	NC_016831	GCC	2	6	1129981	1129986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954832
24059	NC_016831	CCGTA	2	10	1129992	1130001	20 %	20 %	20 %	40 %	378954832
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24064	NC_016831	TATG	2	8	1130341	1130348	25 %	50 %	25 %	0 %	378954832
24065	NC_016831	CGG	2	6	1130361	1130366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954832
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24072	NC_016831	GGAA	2	8	1130936	1130943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24073	NC_016831	TGG	2	6	1131079	1131084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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24109	NC_016831	TGA	2	6	1133127	1133132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954834
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24122	NC_016831	GATT	2	8	1133871	1133878	25 %	50 %	25 %	0 %	378954835
24123	NC_016831	CCG	2	6	1133914	1133919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954835
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24278	NC_016831	AATA	2	8	1140759	1140766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24353	NC_016831	GC	3	6	1144051	1144056	0 %	0 %	50 %	50 %	378954842
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24356	NC_016831	A	6	6	1144130	1144135	100 %	0 %	0 %	0 %	378954842
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24477	NC_016831	CGA	2	6	1150335	1150340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954850
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