MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_016831	CGT	2	6	845086	845091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954533
18003	NC_016831	GC	4	8	845094	845101	0 %	0 %	50 %	50 %	378954533
18004	NC_016831	AGC	2	6	845102	845107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954533
18005	NC_016831	CTG	2	6	845281	845286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954534
18006	NC_016831	CG	3	6	845320	845325	0 %	0 %	50 %	50 %	378954534
18007	NC_016831	CCG	2	6	845522	845527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954534
18008	NC_016831	CTG	2	6	845554	845559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954534
18009	NC_016831	CCTG	2	8	845858	845865	0 %	25 %	25 %	50 %	378954534
18010	NC_016831	GAT	2	6	845931	845936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954534
18011	NC_016831	CAG	2	6	845941	845946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954534
18012	NC_016831	AGC	2	6	845948	845953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954534
18013	NC_016831	GGC	3	9	846012	846020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954534
18014	NC_016831	GAAGGC	2	12	846046	846057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	378954534
18015	NC_016831	TCCG	2	8	846152	846159	0 %	25 %	25 %	50 %	378954534
18016	NC_016831	CTG	2	6	846175	846180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954534
18017	NC_016831	TGG	2	6	846254	846259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954534
18018	NC_016831	A	6	6	846280	846285	100 %	0 %	0 %	0 %	378954534
18019	NC_016831	CACT	2	8	846286	846293	25 %	25 %	0 %	50 %	378954534
18020	NC_016831	GAAT	2	8	846340	846347	50 %	25 %	25 %	0 %	378954535
18021	NC_016831	TGG	2	6	846382	846387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954535
18022	NC_016831	CG	3	6	846415	846420	0 %	0 %	50 %	50 %	378954535
18023	NC_016831	TGC	2	6	846436	846441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954535
18024	NC_016831	GC	3	6	846473	846478	0 %	0 %	50 %	50 %	378954535
18025	NC_016831	GGC	3	9	846524	846532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954535
18026	NC_016831	GGC	2	6	846540	846545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954535
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18028	NC_016831	CGG	2	6	846568	846573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954535
18029	NC_016831	ATG	2	6	846591	846596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954535
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18031	NC_016831	ATT	2	6	846609	846614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954535
18032	NC_016831	CGC	2	6	846617	846622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954535
18033	NC_016831	CTG	2	6	846645	846650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954535
18034	NC_016831	TATC	2	8	846668	846675	25 %	50 %	0 %	25 %	378954535
18035	NC_016831	GCT	2	6	846710	846715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954535
18036	NC_016831	CCAA	2	8	846828	846835	50 %	0 %	0 %	50 %	378954535
18037	NC_016831	GCT	2	6	846890	846895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954535
18038	NC_016831	GGT	3	9	846935	846943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954535
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18040	NC_016831	GC	3	6	847023	847028	0 %	0 %	50 %	50 %	378954535
18041	NC_016831	GGT	2	6	847127	847132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954535
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18045	NC_016831	GTG	2	6	847340	847345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954536
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18048	NC_016831	GCGT	2	8	847521	847528	0 %	25 %	50 %	25 %	378954536
18049	NC_016831	GGC	2	6	847537	847542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954536
18050	NC_016831	GCA	2	6	847564	847569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954536
18051	NC_016831	GAC	2	6	847577	847582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954536
18052	NC_016831	GCCT	2	8	847659	847666	0 %	25 %	25 %	50 %	378954536
18053	NC_016831	GCTG	2	8	847689	847696	0 %	25 %	50 %	25 %	378954536
18054	NC_016831	CTTC	2	8	847750	847757	0 %	50 %	0 %	50 %	378954536
18055	NC_016831	CGG	2	6	847767	847772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954536
18056	NC_016831	TGG	2	6	847850	847855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954537
18057	NC_016831	GCC	2	6	847899	847904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954537
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18060	NC_016831	CGGAT	2	10	848096	848105	20 %	20 %	40 %	20 %	378954537
18061	NC_016831	CTG	2	6	848149	848154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954537
18062	NC_016831	GC	3	6	848168	848173	0 %	0 %	50 %	50 %	378954537
18063	NC_016831	GC	3	6	848285	848290	0 %	0 %	50 %	50 %	378954537
18064	NC_016831	TC	3	6	848318	848323	0 %	50 %	0 %	50 %	378954537
18065	NC_016831	ATG	2	6	848329	848334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954537
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18069	NC_016831	GC	3	6	848401	848406	0 %	0 %	50 %	50 %	378954537
18070	NC_016831	TGACG	2	10	848427	848436	20 %	20 %	40 %	20 %	378954537
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18072	NC_016831	A	7	7	848470	848476	100 %	0 %	0 %	0 %	378954537
18073	NC_016831	CGC	2	6	848532	848537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954537
18074	NC_016831	G	6	6	848583	848588	0 %	0 %	100 %	0 %	378954537
18075	NC_016831	TCC	2	6	848645	848650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954537
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18080	NC_016831	CGG	2	6	848772	848777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954537
18081	NC_016831	GC	4	8	848825	848832	0 %	0 %	50 %	50 %	378954537
18082	NC_016831	CGAC	2	8	848867	848874	25 %	0 %	25 %	50 %	378954537
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18085	NC_016831	GAT	2	6	848999	849004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954537
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18091	NC_016831	GGC	2	6	849296	849301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954538
18092	NC_016831	GGC	2	6	849305	849310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954538
18093	NC_016831	GGC	2	6	849353	849358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954538
18094	NC_016831	GCG	2	6	849403	849408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954538
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18103	NC_016831	ACC	2	6	849966	849971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954538
18104	NC_016831	TGG	3	9	849988	849996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954538
18105	NC_016831	GGT	2	6	850055	850060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954538
18106	NC_016831	GACG	2	8	850077	850084	25 %	0 %	50 %	25 %	378954538
18107	NC_016831	CAC	2	6	850092	850097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954538
18108	NC_016831	CCGT	2	8	850115	850122	0 %	25 %	25 %	50 %	378954538
18109	NC_016831	GGGA	2	8	850189	850196	25 %	0 %	75 %	0 %	378954538
18110	NC_016831	GTG	3	9	850236	850244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954538
18111	NC_016831	GCT	2	6	850283	850288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954538
18112	NC_016831	GAC	2	6	850401	850406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954538
18113	NC_016831	GTG	2	6	850407	850412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954538
18114	NC_016831	CGGG	2	8	850430	850437	0 %	0 %	75 %	25 %	378954538
18115	NC_016831	AATAAC	2	12	850488	850499	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18116	NC_016831	GAA	2	6	850537	850542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_016831	GCG	2	6	850683	850688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954539
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18119	NC_016831	CGG	2	6	850822	850827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954539
18120	NC_016831	GCCA	2	8	850841	850848	25 %	0 %	25 %	50 %	378954539
18121	NC_016831	GCCC	2	8	850892	850899	0 %	0 %	25 %	75 %	378954539
18122	NC_016831	GCG	2	6	850905	850910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954539
18123	NC_016831	CCG	2	6	850958	850963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954539
18124	NC_016831	CG	4	8	850975	850982	0 %	0 %	50 %	50 %	378954539
18125	NC_016831	CGGCG	2	10	851089	851098	0 %	0 %	60 %	40 %	378954539
18126	NC_016831	GC	3	6	851123	851128	0 %	0 %	50 %	50 %	378954539
18127	NC_016831	GC	3	6	851142	851147	0 %	0 %	50 %	50 %	378954539
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18134	NC_016831	GCT	2	6	851356	851361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954539
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18145	NC_016831	TCG	2	6	851819	851824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954539
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18148	NC_016831	AAC	2	6	851970	851975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18149	NC_016831	A	6	6	851988	851993	100 %	0 %	0 %	0 %	378954540
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18153	NC_016831	GCG	2	6	852194	852199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954540
18154	NC_016831	TGG	2	6	852269	852274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954540
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18157	NC_016831	GGCT	2	8	852379	852386	0 %	25 %	50 %	25 %	378954540
18158	NC_016831	GTCGCC	2	12	852415	852426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378954540
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18225	NC_016831	CG	3	6	855665	855670	0 %	0 %	50 %	50 %	378954542
18226	NC_016831	CAC	2	6	855728	855733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954542
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18228	NC_016831	ATCG	2	8	855825	855832	25 %	25 %	25 %	25 %	378954542
18229	NC_016831	CCT	2	6	855949	855954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954542
18230	NC_016831	CGCCAT	2	12	856016	856027	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378954542
18231	NC_016831	CCG	2	6	856045	856050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954542
18232	NC_016831	GCA	2	6	856058	856063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954542
18233	NC_016831	GTG	2	6	856125	856130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954542
18234	NC_016831	TCAA	2	8	856141	856148	50 %	25 %	0 %	25 %	378954542
18235	NC_016831	GAG	2	6	856188	856193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954542
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18238	NC_016831	CTG	2	6	856268	856273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954543
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18351	NC_016831	GAAATG	2	12	862355	862366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378954548
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18354	NC_016831	GTAA	2	8	862433	862440	50 %	25 %	25 %	0 %	378954548
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