MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_016831	GCC	2	6	821053	821058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17502	NC_016831	GCC	2	6	821090	821095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17503	NC_016831	TAT	2	6	821115	821120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954513
17504	NC_016831	ACG	2	6	821129	821134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17505	NC_016831	AG	3	6	821302	821307	50 %	0 %	50 %	0 %	378954513
17506	NC_016831	CGT	2	6	821368	821373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17507	NC_016831	TGCG	2	8	821396	821403	0 %	25 %	50 %	25 %	378954513
17508	NC_016831	TCG	2	6	821466	821471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17509	NC_016831	CGG	2	6	821475	821480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17510	NC_016831	CTG	2	6	821500	821505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17511	NC_016831	TCA	2	6	821513	821518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954513
17512	NC_016831	GC	3	6	821551	821556	0 %	0 %	50 %	50 %	378954513
17513	NC_016831	CAA	2	6	821589	821594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954513
17514	NC_016831	GTC	2	6	821597	821602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17515	NC_016831	CCG	2	6	821613	821618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17516	NC_016831	TCCGC	2	10	821631	821640	0 %	20 %	20 %	60 %	378954513
17517	NC_016831	GCG	2	6	821685	821690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17518	NC_016831	CTG	2	6	821911	821916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17519	NC_016831	CG	3	6	821927	821932	0 %	0 %	50 %	50 %	378954513
17520	NC_016831	CAT	2	6	821935	821940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954513
17521	NC_016831	GAC	2	6	821959	821964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17522	NC_016831	CAA	2	6	822021	822026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954513
17523	NC_016831	AAT	2	6	822082	822087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954513
17524	NC_016831	GCC	3	9	822119	822127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17525	NC_016831	CAC	2	6	822172	822177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954513
17526	NC_016831	CCA	2	6	822189	822194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954513
17527	NC_016831	TTA	2	6	822233	822238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954513
17528	NC_016831	AAT	2	6	822307	822312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954513
17529	NC_016831	AGAT	2	8	822338	822345	50 %	25 %	25 %	0 %	378954513
17530	NC_016831	GAC	2	6	822352	822357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17531	NC_016831	TGG	2	6	822414	822419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954513
17532	NC_016831	GCA	2	6	822477	822482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17533	NC_016831	TCA	2	6	822540	822545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954513
17534	NC_016831	GC	3	6	822633	822638	0 %	0 %	50 %	50 %	378954513
17535	NC_016831	GAT	2	6	822652	822657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954513
17536	NC_016831	TCG	2	6	822671	822676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17537	NC_016831	CCGC	2	8	822711	822718	0 %	0 %	25 %	75 %	378954513
17538	NC_016831	GCG	2	6	822803	822808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17539	NC_016831	CCG	2	6	822851	822856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17540	NC_016831	TCT	2	6	822894	822899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954513
17541	NC_016831	CGG	2	6	822976	822981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17542	NC_016831	CCG	2	6	822984	822989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17543	NC_016831	CGG	2	6	823009	823014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17544	NC_016831	TGG	2	6	823041	823046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954513
17545	NC_016831	CGC	2	6	823057	823062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17546	NC_016831	ACC	2	6	823118	823123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954513
17547	NC_016831	CGC	2	6	823128	823133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17548	NC_016831	CGA	2	6	823144	823149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17549	NC_016831	GCG	2	6	823191	823196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17550	NC_016831	CGG	2	6	823203	823208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17551	NC_016831	AAC	2	6	823246	823251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954513
17552	NC_016831	GCG	2	6	823283	823288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954513
17553	NC_016831	CGC	2	6	823330	823335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17554	NC_016831	CAG	2	6	823339	823344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17555	NC_016831	GTG	2	6	823346	823351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954513
17556	NC_016831	GCC	2	6	823384	823389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954513
17557	NC_016831	TGC	2	6	823392	823397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954513
17558	NC_016831	GC	4	8	823420	823427	0 %	0 %	50 %	50 %	378954514
17559	NC_016831	T	6	6	823458	823463	0 %	100 %	0 %	0 %	378954514
17560	NC_016831	GGT	2	6	823473	823478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954514
17561	NC_016831	ACG	2	6	823537	823542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954514
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17563	NC_016831	CTT	2	6	823611	823616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954514
17564	NC_016831	TCG	2	6	823630	823635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954514
17565	NC_016831	CA	3	6	823645	823650	50 %	0 %	0 %	50 %	378954514
17566	NC_016831	CCG	2	6	823676	823681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954514
17567	NC_016831	GGCA	2	8	823683	823690	25 %	0 %	50 %	25 %	378954514
17568	NC_016831	ATTG	2	8	823739	823746	25 %	50 %	25 %	0 %	378954514
17569	NC_016831	GC	3	6	823776	823781	0 %	0 %	50 %	50 %	378954514
17570	NC_016831	AC	3	6	823835	823840	50 %	0 %	0 %	50 %	378954514
17571	NC_016831	GAC	2	6	823980	823985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954514
17572	NC_016831	GCT	2	6	824001	824006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954514
17573	NC_016831	GC	3	6	824093	824098	0 %	0 %	50 %	50 %	378954514
17574	NC_016831	GC	3	6	824211	824216	0 %	0 %	50 %	50 %	378954514
17575	NC_016831	ACG	2	6	824223	824228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954514
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17577	NC_016831	CTGG	2	8	824295	824302	0 %	25 %	50 %	25 %	378954514
17578	NC_016831	CAG	2	6	824316	824321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954514
17579	NC_016831	CTG	2	6	824337	824342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954514
17580	NC_016831	CGG	2	6	824408	824413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954514
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17582	NC_016831	GCG	3	9	824515	824523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954514
17583	NC_016831	GCG	2	6	824528	824533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954514
17584	NC_016831	GCG	2	6	824539	824544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954514
17585	NC_016831	CGGCG	2	10	824550	824559	0 %	0 %	60 %	40 %	378954514
17586	NC_016831	CCAGAA	2	12	824583	824594	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378954514
17587	NC_016831	GCG	3	9	824596	824604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954514
17588	NC_016831	CAG	2	6	824715	824720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17589	NC_016831	GGA	2	6	824736	824741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17590	NC_016831	ATT	2	6	824761	824766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954515
17591	NC_016831	GGC	2	6	824846	824851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954515
17592	NC_016831	CAG	2	6	824879	824884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17593	NC_016831	ATG	2	6	824940	824945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_016831	TCA	2	6	824953	824958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17595	NC_016831	GAG	2	6	825011	825016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17596	NC_016831	TCC	2	6	825020	825025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17597	NC_016831	AAT	2	6	825060	825065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17598	NC_016831	ATC	2	6	825152	825157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954516
17599	NC_016831	GCC	2	6	825158	825163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954516
17600	NC_016831	T	6	6	825200	825205	0 %	100 %	0 %	0 %	378954516
17601	NC_016831	GCC	2	6	825227	825232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954516
17602	NC_016831	AGAT	2	8	825237	825244	50 %	25 %	25 %	0 %	378954516
17603	NC_016831	GC	3	6	825262	825267	0 %	0 %	50 %	50 %	378954516
17604	NC_016831	GCTG	2	8	825337	825344	0 %	25 %	50 %	25 %	378954516
17605	NC_016831	GTC	2	6	825359	825364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954516
17606	NC_016831	CT	3	6	825420	825425	0 %	50 %	0 %	50 %	378954516
17607	NC_016831	AGC	2	6	825474	825479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954516
17608	NC_016831	CG	3	6	825501	825506	0 %	0 %	50 %	50 %	378954516
17609	NC_016831	GAC	2	6	825529	825534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954516
17610	NC_016831	CGT	2	6	825571	825576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954516
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17615	NC_016831	CAG	2	6	825770	825775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954516
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