MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016831	GCG	2	6	751509	751514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954451
16002	NC_016831	AAT	2	6	751541	751546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954451
16003	NC_016831	GGT	2	6	751614	751619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954451
16004	NC_016831	TGC	2	6	751645	751650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954451
16005	NC_016831	GCG	2	6	751692	751697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954451
16006	NC_016831	CGG	2	6	751740	751745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954451
16007	NC_016831	GGC	2	6	751768	751773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954451
16008	NC_016831	TCTG	2	8	751822	751829	0 %	50 %	25 %	25 %	378954451
16009	NC_016831	CGA	2	6	751840	751845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954451
16010	NC_016831	TTA	2	6	752095	752100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_016831	ATG	2	6	752115	752120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_016831	TAAC	2	8	752139	752146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16013	NC_016831	AGTT	2	8	752154	752161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_016831	CGC	2	6	752324	752329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16015	NC_016831	GCG	2	6	752332	752337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_016831	TAC	2	6	752373	752378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_016831	GC	3	6	752397	752402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_016831	TGG	2	6	752437	752442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_016831	T	7	7	752505	752511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_016831	ATA	2	6	752526	752531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_016831	AAG	2	6	752552	752557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954452
16022	NC_016831	GC	3	6	752598	752603	0 %	0 %	50 %	50 %	378954452
16023	NC_016831	GGC	2	6	752611	752616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954452
16024	NC_016831	GTG	2	6	752669	752674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954452
16025	NC_016831	TGA	2	6	752724	752729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954452
16026	NC_016831	GCC	2	6	752828	752833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954452
16027	NC_016831	GC	3	6	752852	752857	0 %	0 %	50 %	50 %	378954452
16028	NC_016831	GGT	2	6	752872	752877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954452
16029	NC_016831	TAT	2	6	752930	752935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954452
16030	NC_016831	GACT	2	8	752941	752948	25 %	25 %	25 %	25 %	378954452
16031	NC_016831	CTG	2	6	753047	753052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954452
16032	NC_016831	ACG	2	6	753089	753094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954452
16033	NC_016831	GATG	2	8	753187	753194	25 %	25 %	50 %	0 %	378954452
16034	NC_016831	CGATG	2	10	753247	753256	20 %	20 %	40 %	20 %	378954452
16035	NC_016831	ATA	2	6	753288	753293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954452
16036	NC_016831	ATC	2	6	753295	753300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954452
16037	NC_016831	CGGTA	2	10	753367	753376	20 %	20 %	40 %	20 %	378954452
16038	NC_016831	CAA	2	6	753388	753393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954452
16039	NC_016831	TTG	2	6	753568	753573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_016831	GCA	2	6	753682	753687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_016831	TC	3	6	753691	753696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_016831	CGT	2	6	753697	753702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16043	NC_016831	TTG	2	6	753714	753719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_016831	ATT	2	6	753839	753844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_016831	GCA	2	6	753880	753885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16046	NC_016831	AAG	2	6	753901	753906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_016831	AAG	2	6	753925	753930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_016831	TGA	2	6	754079	754084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_016831	CG	5	10	754105	754114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16050	NC_016831	GAT	2	6	754143	754148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_016831	TTA	2	6	754187	754192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_016831	ATC	2	6	754232	754237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_016831	ATT	2	6	754246	754251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_016831	GAA	2	6	754303	754308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_016831	TGGATA	2	12	754382	754393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_016831	GAT	2	6	754404	754409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_016831	TCG	2	6	754589	754594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_016831	GTC	2	6	754620	754625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_016831	TAA	2	6	754656	754661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_016831	CGAA	2	8	754670	754677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16061	NC_016831	GAA	2	6	754708	754713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_016831	CGT	2	6	754714	754719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_016831	CGCA	2	8	754876	754883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_016831	CGG	2	6	754899	754904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16065	NC_016831	A	6	6	755035	755040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_016831	ATC	2	6	755050	755055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_016831	TCT	2	6	755062	755067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16068	NC_016831	TGA	2	6	755108	755113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_016831	ACA	2	6	755149	755154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16070	NC_016831	CTT	2	6	755180	755185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16071	NC_016831	CGT	2	6	755268	755273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954453
16072	NC_016831	ATT	3	9	755293	755301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954453
16073	NC_016831	T	6	6	755316	755321	0 %	100 %	0 %	0 %	378954453
16074	NC_016831	TAT	3	9	755367	755375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954453
16075	NC_016831	CGG	2	6	755423	755428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954453
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16078	NC_016831	CAAT	2	8	755473	755480	50 %	25 %	0 %	25 %	378954453
16079	NC_016831	CAA	2	6	755490	755495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954453
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16081	NC_016831	TTA	2	6	755615	755620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954453
16082	NC_016831	GAT	2	6	755634	755639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954453
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16085	NC_016831	CTG	2	6	755902	755907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954453
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16088	NC_016831	TATG	2	8	755997	756004	25 %	50 %	25 %	0 %	378954453
16089	NC_016831	CGTG	2	8	756023	756030	0 %	25 %	50 %	25 %	378954453
16090	NC_016831	GCG	2	6	756050	756055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954453
16091	NC_016831	GTG	2	6	756076	756081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954453
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16093	NC_016831	TA	3	6	756124	756129	50 %	50 %	0 %	0 %	378954453
16094	NC_016831	GGC	2	6	756163	756168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954453
16095	NC_016831	CG	3	6	756207	756212	0 %	0 %	50 %	50 %	378954453
16096	NC_016831	AAG	2	6	756214	756219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954453
16097	NC_016831	GC	3	6	756273	756278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_016831	T	6	6	756327	756332	0 %	100 %	0 %	0 %	378954454
16099	NC_016831	CAG	2	6	756384	756389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954454
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16101	NC_016831	TGA	2	6	756454	756459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954454
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16103	NC_016831	CCG	2	6	756554	756559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954454
16104	NC_016831	ATA	2	6	756562	756567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954454
16105	NC_016831	ATC	2	6	756586	756591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954454
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16107	NC_016831	GTC	2	6	756685	756690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954454
16108	NC_016831	CGC	2	6	756702	756707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954454
16109	NC_016831	CAG	3	9	756711	756719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954454
16110	NC_016831	GCC	2	6	756750	756755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954454
16111	NC_016831	CTG	2	6	756801	756806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954454
16112	NC_016831	ACC	2	6	756874	756879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954454
16113	NC_016831	TGG	2	6	756935	756940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954454
16114	NC_016831	CCG	2	6	756955	756960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954454
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16119	NC_016831	GGC	2	6	757260	757265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954454
16120	NC_016831	TCT	2	6	757330	757335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954454
16121	NC_016831	GA	3	6	757358	757363	50 %	0 %	50 %	0 %	378954454
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