MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_016831	CGC	2	6	681613	681618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954381
14502	NC_016831	TGA	2	6	681653	681658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954381
14503	NC_016831	AACGCC	2	12	681680	681691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378954381
14504	NC_016831	AGC	2	6	681692	681697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954381
14505	NC_016831	CAG	2	6	681706	681711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954381
14506	NC_016831	GCA	2	6	681717	681722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954381
14507	NC_016831	GAG	2	6	681803	681808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954381
14508	NC_016831	CGG	2	6	681928	681933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954381
14509	NC_016831	CCA	2	6	681963	681968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954381
14510	NC_016831	GCCAG	2	10	682029	682038	20 %	0 %	40 %	40 %	378954381
14511	NC_016831	GAG	2	6	682049	682054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954381
14512	NC_016831	CTG	2	6	682084	682089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954381
14513	NC_016831	CGG	2	6	682103	682108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954381
14514	NC_016831	CGA	2	6	682113	682118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954381
14515	NC_016831	AG	3	6	682150	682155	50 %	0 %	50 %	0 %	378954381
14516	NC_016831	GGTAG	2	10	682166	682175	20 %	20 %	60 %	0 %	378954381
14517	NC_016831	ATA	2	6	682210	682215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954381
14518	NC_016831	ATA	2	6	682348	682353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954381
14519	NC_016831	GTG	2	6	682406	682411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954381
14520	NC_016831	GCG	2	6	682412	682417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954381
14521	NC_016831	TGT	2	6	682419	682424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954381
14522	NC_016831	GTGA	2	8	682477	682484	25 %	25 %	50 %	0 %	378954381
14523	NC_016831	CAG	2	6	682558	682563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954381
14524	NC_016831	AAG	2	6	682580	682585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954381
14525	NC_016831	GACT	2	8	682640	682647	25 %	25 %	25 %	25 %	378954381
14526	NC_016831	TGAAGG	2	12	682679	682690	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_016831	AATG	2	8	682705	682712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_016831	CGG	2	6	682761	682766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_016831	ACT	2	6	682812	682817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_016831	ATT	2	6	682847	682852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_016831	GT	3	6	682934	682939	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_016831	A	6	6	682943	682948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_016831	A	8	8	682952	682959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_016831	TAA	2	6	683019	683024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_016831	ATG	2	6	683034	683039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_016831	TCA	2	6	683100	683105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_016831	AT	3	6	683137	683142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_016831	A	6	6	683182	683187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_016831	ATT	2	6	683268	683273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954382
14540	NC_016831	A	6	6	683339	683344	100 %	0 %	0 %	0 %	378954382
14541	NC_016831	TAA	2	6	683370	683375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954382
14542	NC_016831	CCT	2	6	683397	683402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954383
14543	NC_016831	CTG	2	6	683413	683418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14544	NC_016831	GGCG	2	8	683421	683428	0 %	0 %	75 %	25 %	378954383
14545	NC_016831	TAA	2	6	683451	683456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954383
14546	NC_016831	CAA	2	6	683463	683468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954383
14547	NC_016831	ACT	2	6	683501	683506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954383
14548	NC_016831	GAC	2	6	683512	683517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14549	NC_016831	GCA	2	6	683639	683644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14550	NC_016831	ATG	2	6	683732	683737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954383
14551	NC_016831	CCT	2	6	683741	683746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378954383
14552	NC_016831	CGG	2	6	683769	683774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954383
14553	NC_016831	GCA	2	6	683802	683807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14554	NC_016831	CTT	2	6	683844	683849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954383
14555	NC_016831	TGG	2	6	683855	683860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954383
14556	NC_016831	CTG	2	6	683935	683940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14557	NC_016831	CGG	2	6	683961	683966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954383
14558	NC_016831	CAC	2	6	684015	684020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954383
14559	NC_016831	AAC	2	6	684043	684048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954383
14560	NC_016831	CGG	2	6	684099	684104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954383
14561	NC_016831	AAC	2	6	684121	684126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954383
14562	NC_016831	ATCT	2	8	684127	684134	25 %	50 %	0 %	25 %	378954383
14563	NC_016831	CAA	2	6	684189	684194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954383
14564	NC_016831	CAA	2	6	684219	684224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954383
14565	NC_016831	CGTC	2	8	684274	684281	0 %	25 %	25 %	50 %	378954383
14566	NC_016831	TAC	2	6	684382	684387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954383
14567	NC_016831	CAA	2	6	684390	684395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954383
14568	NC_016831	CTG	2	6	684430	684435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14569	NC_016831	CGA	2	6	684474	684479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954383
14570	NC_016831	T	6	6	684549	684554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_016831	ACG	2	6	684579	684584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_016831	GT	3	6	684652	684657	0 %	50 %	50 %	0 %	378954384
14573	NC_016831	GGC	3	9	684660	684668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954384
14574	NC_016831	T	6	6	684669	684674	0 %	100 %	0 %	0 %	378954384
14575	NC_016831	ACA	2	6	684706	684711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954384
14576	NC_016831	CGC	2	6	684795	684800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954384
14577	NC_016831	TGA	2	6	684837	684842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954384
14578	NC_016831	TC	3	6	685170	685175	0 %	50 %	0 %	50 %	378954384
14579	NC_016831	GCG	2	6	685195	685200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954384
14580	NC_016831	ATC	2	6	685202	685207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954384
14581	NC_016831	AGG	2	6	685226	685231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954384
14582	NC_016831	GCG	2	6	685259	685264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954384
14583	NC_016831	CCGA	2	8	685324	685331	25 %	0 %	25 %	50 %	378954384
14584	NC_016831	GGCAT	2	10	685370	685379	20 %	20 %	40 %	20 %	378954384
14585	NC_016831	GCG	2	6	685575	685580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954384
14586	NC_016831	AAG	2	6	685610	685615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954384
14587	NC_016831	CGC	2	6	685640	685645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954384
14588	NC_016831	AC	3	6	685718	685723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14589	NC_016831	AAGC	2	8	685731	685738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14590	NC_016831	ATG	2	6	685761	685766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954385
14591	NC_016831	A	6	6	685767	685772	100 %	0 %	0 %	0 %	378954385
14592	NC_016831	TTAC	2	8	685776	685783	25 %	50 %	0 %	25 %	378954385
14593	NC_016831	GAT	2	6	685785	685790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954385
14594	NC_016831	GCTG	2	8	685795	685802	0 %	25 %	50 %	25 %	378954385
14595	NC_016831	GC	3	6	685812	685817	0 %	0 %	50 %	50 %	378954385
14596	NC_016831	CGTTT	2	10	685836	685845	0 %	60 %	20 %	20 %	378954385
14597	NC_016831	T	6	6	685867	685872	0 %	100 %	0 %	0 %	378954385
14598	NC_016831	GCC	2	6	685873	685878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954385
14599	NC_016831	CTT	2	6	685879	685884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954385
14600	NC_016831	T	6	6	685920	685925	0 %	100 %	0 %	0 %	378954385
14601	NC_016831	GC	5	10	685989	685998	0 %	0 %	50 %	50 %	378954385
14602	NC_016831	CGG	2	6	686004	686009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954385
14603	NC_016831	GCCTGC	2	12	686022	686033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378954385
14604	NC_016831	GCA	2	6	686153	686158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954385
14605	NC_016831	GC	3	6	686165	686170	0 %	0 %	50 %	50 %	378954385
14606	NC_016831	CGG	2	6	686172	686177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954385
14607	NC_016831	CGG	2	6	686212	686217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954385
14608	NC_016831	CTA	2	6	686252	686257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954385
14609	NC_016831	GGC	2	6	686307	686312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954385
14610	NC_016831	ACGG	2	8	686353	686360	25 %	0 %	50 %	25 %	378954385
14611	NC_016831	TGG	2	6	686365	686370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954385
14612	NC_016831	GAGC	2	8	686375	686382	25 %	0 %	50 %	25 %	378954385
14613	NC_016831	CGA	2	6	686414	686419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954385
14614	NC_016831	AC	3	6	686438	686443	50 %	0 %	0 %	50 %	378954385
14615	NC_016831	AC	3	6	686521	686526	50 %	0 %	0 %	50 %	378954385
14616	NC_016831	TGC	2	6	686533	686538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954385
14617	NC_016831	CAG	2	6	686577	686582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954385
14618	NC_016831	GCG	2	6	686611	686616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954385
14619	NC_016831	CGG	2	6	686662	686667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954385
14620	NC_016831	CG	3	6	686670	686675	0 %	0 %	50 %	50 %	378954385
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14622	NC_016831	GC	3	6	686746	686751	0 %	0 %	50 %	50 %	378954385
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14983	NC_016831	GGCG	2	8	701503	701510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14984	NC_016831	CGG	2	6	701537	701542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14985	NC_016831	TGCGCC	2	12	701544	701555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14986	NC_016831	CAG	2	6	701583	701588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14987	NC_016831	GCA	2	6	701600	701605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14988	NC_016831	GCT	2	6	701627	701632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14989	NC_016831	CGG	2	6	701650	701655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14990	NC_016831	TGAA	2	8	701665	701672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14991	NC_016831	GAG	2	6	701673	701678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14992	NC_016831	ATG	2	6	701719	701724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14993	NC_016831	GGCT	2	8	701739	701746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14994	NC_016831	GCG	2	6	701842	701847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14996	NC_016831	CCG	2	6	701895	701900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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