MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_016831	GCG	2	6	657762	657767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954367
14003	NC_016831	CTG	2	6	657784	657789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954367
14004	NC_016831	GC	3	6	657807	657812	0 %	0 %	50 %	50 %	378954367
14005	NC_016831	GC	3	6	657864	657869	0 %	0 %	50 %	50 %	378954367
14006	NC_016831	GGC	2	6	657900	657905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954367
14007	NC_016831	CGG	2	6	657921	657926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954367
14008	NC_016831	GGA	2	6	657982	657987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954367
14009	NC_016831	GC	3	6	657996	658001	0 %	0 %	50 %	50 %	378954367
14010	NC_016831	TGC	2	6	658037	658042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954367
14011	NC_016831	CCG	2	6	658076	658081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954367
14012	NC_016831	ATA	2	6	658085	658090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954367
14013	NC_016831	AG	3	6	658229	658234	50 %	0 %	50 %	0 %	378954368
14014	NC_016831	GTC	2	6	658257	658262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954368
14015	NC_016831	CG	3	6	658289	658294	0 %	0 %	50 %	50 %	378954368
14016	NC_016831	CAG	2	6	658355	658360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954368
14017	NC_016831	CCG	2	6	658402	658407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954368
14018	NC_016831	GGC	2	6	658444	658449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954368
14019	NC_016831	CCG	2	6	658492	658497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954368
14020	NC_016831	GCG	2	6	658507	658512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954368
14021	NC_016831	GTCG	2	8	658625	658632	0 %	25 %	50 %	25 %	378954368
14022	NC_016831	GGTAAT	2	12	658673	658684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954368
14023	NC_016831	AAC	2	6	658719	658724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954368
14024	NC_016831	CCA	2	6	658771	658776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954368
14025	NC_016831	GCGG	2	8	658777	658784	0 %	0 %	75 %	25 %	378954368
14026	NC_016831	CG	3	6	658796	658801	0 %	0 %	50 %	50 %	378954368
14027	NC_016831	GCA	2	6	658849	658854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954368
14028	NC_016831	ACC	3	9	659109	659117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954368
14029	NC_016831	GC	3	6	659156	659161	0 %	0 %	50 %	50 %	378954368
14030	NC_016831	CGC	2	6	659167	659172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954368
14031	NC_016831	GGC	2	6	659258	659263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954368
14032	NC_016831	GAT	2	6	659339	659344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954368
14033	NC_016831	CTG	2	6	659351	659356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954368
14034	NC_016831	CGC	2	6	659384	659389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954368
14035	NC_016831	ATC	2	6	659426	659431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954368
14036	NC_016831	TAA	2	6	659443	659448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954368
14037	NC_016831	CG	4	8	659518	659525	0 %	0 %	50 %	50 %	378954368
14038	NC_016831	GCA	2	6	659563	659568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954368
14039	NC_016831	CCA	2	6	659614	659619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378954368
14040	NC_016831	GC	3	6	659641	659646	0 %	0 %	50 %	50 %	378954368
14041	NC_016831	CTTG	2	8	659700	659707	0 %	50 %	25 %	25 %	378954368
14042	NC_016831	T	6	6	659745	659750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_016831	AGC	2	6	659928	659933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_016831	GTT	2	6	659937	659942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_016831	GAAC	2	8	659944	659951	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14046	NC_016831	TAAA	2	8	659967	659974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_016831	GC	3	6	660031	660036	0 %	0 %	50 %	50 %	378954369
14048	NC_016831	GCG	2	6	660043	660048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954369
14049	NC_016831	TAT	2	6	660118	660123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954369
14050	NC_016831	CG	3	6	660272	660277	0 %	0 %	50 %	50 %	378954369
14051	NC_016831	GCA	2	6	660307	660312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954369
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14053	NC_016831	TGT	2	6	660374	660379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378954369
14054	NC_016831	GCC	2	6	660411	660416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954369
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14056	NC_016831	GCG	2	6	660458	660463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954369
14057	NC_016831	CGG	3	9	660498	660506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954369
14058	NC_016831	CTG	2	6	660517	660522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954369
14059	NC_016831	CTG	2	6	660526	660531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954369
14060	NC_016831	GCG	2	6	660559	660564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954369
14061	NC_016831	TGG	2	6	660593	660598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954369
14062	NC_016831	ATG	2	6	660616	660621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954369
14063	NC_016831	CGC	2	6	660629	660634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954369
14064	NC_016831	GCC	2	6	660648	660653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954369
14065	NC_016831	GAC	2	6	660682	660687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954369
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14068	NC_016831	TATCGC	2	12	660768	660779	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378954369
14069	NC_016831	GTTT	2	8	660786	660793	0 %	75 %	25 %	0 %	378954369
14070	NC_016831	CTG	2	6	660796	660801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954369
14071	NC_016831	ACCT	2	8	660829	660836	25 %	25 %	0 %	50 %	378954369
14072	NC_016831	AAG	2	6	660839	660844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954369
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14088	NC_016831	GGC	2	6	661432	661437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954370
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14090	NC_016831	TGA	2	6	661551	661556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954370
14091	NC_016831	GAC	2	6	661562	661567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954370
14092	NC_016831	GTC	2	6	661574	661579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954370
14093	NC_016831	TGAC	2	8	661605	661612	25 %	25 %	25 %	25 %	378954370
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14095	NC_016831	CAT	2	6	661883	661888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954370
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14098	NC_016831	GGAT	2	8	662031	662038	25 %	25 %	50 %	0 %	378954370
14099	NC_016831	CAG	2	6	662084	662089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954370
14100	NC_016831	GGCG	2	8	662362	662369	0 %	0 %	75 %	25 %	378954370
14101	NC_016831	A	7	7	662418	662424	100 %	0 %	0 %	0 %	378954370
14102	NC_016831	GTT	2	6	662541	662546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_016831	TAA	2	6	662589	662594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954371
14104	NC_016831	CTTC	2	8	662605	662612	0 %	50 %	0 %	50 %	378954371
14105	NC_016831	CGG	2	6	662616	662621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954371
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14107	NC_016831	TTC	2	6	662874	662879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378954371
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14111	NC_016831	ATAC	2	8	662961	662968	50 %	25 %	0 %	25 %	378954371
14112	NC_016831	AAT	2	6	663024	663029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378954371
14113	NC_016831	GAT	2	6	663071	663076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954371
14114	NC_016831	GCAGGC	2	12	663111	663122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378954371
14115	NC_016831	T	7	7	663163	663169	0 %	100 %	0 %	0 %	378954371
14116	NC_016831	CG	3	6	663213	663218	0 %	0 %	50 %	50 %	378954371
14117	NC_016831	CGG	3	9	663242	663250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954371
14118	NC_016831	ACG	2	6	663267	663272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954371
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