MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 98135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016831	TCG	2	6	634006	634011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954343
13502	NC_016831	TAC	2	6	634051	634056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954343
13503	NC_016831	CAA	2	6	634091	634096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954343
13504	NC_016831	CGG	2	6	634100	634105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954343
13505	NC_016831	CTG	2	6	634119	634124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954343
13506	NC_016831	CGC	2	6	634129	634134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954343
13507	NC_016831	GCC	2	6	634191	634196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954343
13508	NC_016831	ATC	2	6	634213	634218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954343
13509	NC_016831	GCTG	2	8	634250	634257	0 %	25 %	50 %	25 %	378954343
13510	NC_016831	TGG	2	6	634294	634299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954343
13511	NC_016831	ACGG	2	8	634308	634315	25 %	0 %	50 %	25 %	378954343
13512	NC_016831	GCA	2	6	634328	634333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954343
13513	NC_016831	ATG	2	6	634358	634363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954343
13514	NC_016831	GCA	2	6	634372	634377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954344
13515	NC_016831	CGG	2	6	634531	634536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954344
13516	NC_016831	TCA	2	6	634548	634553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954344
13517	NC_016831	GC	3	6	634561	634566	0 %	0 %	50 %	50 %	378954344
13518	NC_016831	ACA	2	6	634581	634586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954344
13519	NC_016831	TGGT	2	8	634598	634605	0 %	50 %	50 %	0 %	378954344
13520	NC_016831	GGC	2	6	634619	634624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954344
13521	NC_016831	GAT	2	6	634633	634638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954344
13522	NC_016831	TGG	2	6	634674	634679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954344
13523	NC_016831	GC	4	8	634715	634722	0 %	0 %	50 %	50 %	378954344
13524	NC_016831	CAG	2	6	634802	634807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954344
13525	NC_016831	GCA	2	6	634831	634836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954344
13526	NC_016831	GCTG	2	8	634882	634889	0 %	25 %	50 %	25 %	378954344
13527	NC_016831	TAT	2	6	634964	634969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954344
13528	NC_016831	GGC	2	6	635017	635022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954344
13529	NC_016831	AC	3	6	635124	635129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13530	NC_016831	TGA	2	6	635142	635147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954345
13531	NC_016831	GAT	2	6	635295	635300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954345
13532	NC_016831	ACG	2	6	635324	635329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954345
13533	NC_016831	ATT	2	6	635344	635349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954345
13534	NC_016831	GCGG	2	8	635380	635387	0 %	0 %	75 %	25 %	378954345
13535	NC_016831	GCG	2	6	635402	635407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954345
13536	NC_016831	CGG	2	6	635412	635417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954345
13537	NC_016831	CGG	2	6	635523	635528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954345
13538	NC_016831	TGC	2	6	635537	635542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954345
13539	NC_016831	ATG	2	6	635545	635550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954345
13540	NC_016831	CGG	2	6	635567	635572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954345
13541	NC_016831	CGG	2	6	635619	635624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954345
13542	NC_016831	AGA	2	6	635660	635665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954345
13543	NC_016831	GCC	2	6	635690	635695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954345
13544	NC_016831	GCG	2	6	635830	635835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954345
13545	NC_016831	GAA	2	6	635911	635916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954345
13546	NC_016831	GC	3	6	635995	636000	0 %	0 %	50 %	50 %	378954346
13547	NC_016831	GGT	2	6	636035	636040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954346
13548	NC_016831	GA	3	6	636115	636120	50 %	0 %	50 %	0 %	378954346
13549	NC_016831	TC	3	6	636121	636126	0 %	50 %	0 %	50 %	378954346
13550	NC_016831	TCAG	2	8	636139	636146	25 %	25 %	25 %	25 %	378954346
13551	NC_016831	GC	3	6	636253	636258	0 %	0 %	50 %	50 %	378954346
13552	NC_016831	ACTG	2	8	636266	636273	25 %	25 %	25 %	25 %	378954346
13553	NC_016831	GGC	2	6	636287	636292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954346
13554	NC_016831	TGC	2	6	636340	636345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954346
13555	NC_016831	TGG	2	6	636418	636423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378954346
13556	NC_016831	TGC	2	6	636430	636435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954346
13557	NC_016831	ATCTGC	2	12	636451	636462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378954346
13558	NC_016831	CGC	2	6	636487	636492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954346
13559	NC_016831	GAA	2	6	636555	636560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954346
13560	NC_016831	GAT	2	6	636576	636581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954346
13561	NC_016831	GCC	2	6	636738	636743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954346
13562	NC_016831	CGG	2	6	636760	636765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954346
13563	NC_016831	TCA	2	6	636766	636771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954346
13564	NC_016831	TCGA	2	8	636777	636784	25 %	25 %	25 %	25 %	378954346
13565	NC_016831	GCC	2	6	636819	636824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378954346
13566	NC_016831	TGA	2	6	636926	636931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954346
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13568	NC_016831	GGCG	2	8	637066	637073	0 %	0 %	75 %	25 %	378954347
13569	NC_016831	CTG	2	6	637112	637117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954347
13570	NC_016831	GCG	2	6	637170	637175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954347
13571	NC_016831	CG	3	6	637174	637179	0 %	0 %	50 %	50 %	378954347
13572	NC_016831	GCG	2	6	637319	637324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954347
13573	NC_016831	GC	3	6	637431	637436	0 %	0 %	50 %	50 %	378954347
13574	NC_016831	GCT	2	6	637480	637485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954347
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13577	NC_016831	GGC	2	6	637632	637637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954347
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13580	NC_016831	GCT	2	6	637737	637742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954347
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13582	NC_016831	TGA	2	6	637804	637809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378954347
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13584	NC_016831	AG	3	6	637832	637837	50 %	0 %	50 %	0 %	378954347
13585	NC_016831	TCG	2	6	637845	637850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954347
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13587	NC_016831	CG	3	6	637947	637952	0 %	0 %	50 %	50 %	378954347
13588	NC_016831	GGC	2	6	637992	637997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954347
13589	NC_016831	GCG	3	9	638016	638024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954347
13590	NC_016831	GGA	2	6	638038	638043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378954347
13591	NC_016831	TTA	2	6	638055	638060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378954347
13592	NC_016831	CAA	2	6	638078	638083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378954347
13593	NC_016831	TCG	2	6	638088	638093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954347
13594	NC_016831	AGA	2	6	638101	638106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378954347
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13596	NC_016831	CAG	2	6	638282	638287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954347
13597	NC_016831	GT	3	6	638291	638296	0 %	50 %	50 %	0 %	378954347
13598	NC_016831	TGGT	2	8	638418	638425	0 %	50 %	50 %	0 %	378954348
13599	NC_016831	GCG	2	6	638482	638487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378954348
13600	NC_016831	GTATT	2	10	638570	638579	20 %	60 %	20 %	0 %	378954348
13601	NC_016831	CGA	2	6	638633	638638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954348
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13605	NC_016831	GT	3	6	638833	638838	0 %	50 %	50 %	0 %	378954349
13606	NC_016831	CAG	2	6	638851	638856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378954349
13607	NC_016831	CAT	2	6	638967	638972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378954349
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13609	NC_016831	TAAT	2	8	639076	639083	50 %	50 %	0 %	0 %	378954350
13610	NC_016831	GGCGG	2	10	639100	639109	0 %	0 %	80 %	20 %	378954350
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13614	NC_016831	GCTT	2	8	639309	639316	0 %	50 %	25 %	25 %	378954350
13615	NC_016831	GGGAA	2	10	639433	639442	40 %	0 %	60 %	0 %	378954351
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13618	NC_016831	TCG	2	6	639530	639535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378954351
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